python img2stereo.py --depthmodel_path=midas_models/mdel/dpt_hybrid-midas-501f0c75.pt --img_path="img/im1e0.png"写一个能执行这条命令行指令的函数

时间: 2024-12-14 11:26:56 浏览: 2
RAR

stereovision.rar_ StereoVision-master_Stereo Vision_Stereo vc++_

要编写一个Python函数来执行`img2stereo.py`命令,你可以创建一个shell子进程并传递参数给它。这里有一个简单的示例: ```python import subprocess def run_img2stereo(depth_model_path, img_path): command = f"img2stereo.py --depthmodel_path={depth_model_path} --img_path={img_path}" process = subprocess.Popen(command, shell=True, stdout=subprocess.PIPE, stderr=subprocess.PIPE) output, error = process.communicate() if error: print(f"Error executing command: {error.decode('utf-8')}") else: print(f"Command executed successfully. Output:\n{output.decode('utf-8')}") # 使用函数 run_img2stereo("midas_models/mdel/dpt_hybrid-midas-501f0c75.pt", "img/im1e0.png") ``` 这个函数会运行`img2stereo.py`脚本,传入指定的深度模型路径和图片文件路径作为参数。如果执行过程中有错误,它会打印错误信息;如果没有错误,它将显示标准输出。
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import argparse import numpy as np from openeye import oechem def clear_stereochemistry(mol): clear_atom_stereochemistry(mol) clear_bond_sterochemistry(mol) oechem.OESuppressHydrogens(mol, False, False, False) def clear_atom_stereochemistry(mol): for atom in mol.GetAtoms(): chiral = atom.IsChiral() stereo = oechem.OEAtomStereo_Undefined v = [] for nbr in atom.GetAtoms(): v.append(nbr) if atom.HasStereoSpecified(oechem.OEAtomStereo_Tetrahedral): stereo = atom.GetStereo(v, oechem.OEAtomStereo_Tetrahedral) if chiral or stereo != oechem.OEAtomStereo_Undefined: atom.SetStereo(v, oechem.OEAtomStereo_Tetrahedral, oechem.OEAtomStereo_Undefined) def clear_bond_sterochemistry(mol): for bond in mol.GetBonds(): if bond.HasStereoSpecified(oechem.OEBondStereo_CisTrans): for atomB in bond.GetBgn().GetAtoms(): if atomB == bond.GetEnd(): continue for atomE in bond.GetEnd().GetAtoms(): if atomE == bond.GetBgn(): continue v = [] v.append(atomB) v.append(atomE) stereo = bond.SetStereo(v, oechem.OEBondStereo_CisTrans, oechem.OEBondStereo_Undefined) def abs_smi(x): mol = oechem.OEGraphMol() if oechem.OESmilesToMol(mol, x): clear_stereochemistry(mol) return oechem.OEMolToSmiles(mol) else: return np.nan if __name__ == '__main__': parser = argparse.ArgumentParser(description="Remove stereochemistry from the input data set.") parser.add_argument("--in",dest="infile",help="whitespace-delimited input file",metavar="in.csv") parser.add_argument("--out", dest="outfile", help="output file", metavar="out.csv") args = parser.parse_args() n=0 with open(args.infile, 'r') as ifs: with open(args.outfile, 'w') as ofs: for line in ifs: if n==0: ofs.write(line) n=1 else: parsed = line.strip().split(',') if ('.' not in parsed[0]): ofs.write(f"{abs_smi(parsed[0])},{parsed[1]}\n")

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