对PET的nii图像进行插值成256×256×256并保存代码

时间: 2024-01-12 07:05:10 浏览: 24
好的,以下是对PET的nii图像进行插值成256×256×256并保存的Python代码示例: ```python import nibabel as nib import numpy as np # 读取原始的nii文件 img = nib.load('original.nii') data = img.get_fdata() # 获取原始数据的形状和分辨率 original_shape = data.shape original_spacing = img.header.get_zooms() # 计算插值后的分辨率和形状 new_spacing = tuple([x*y/z for x,y,z in zip(original_spacing, original_shape, (256,256,256))]) new_shape = tuple([int(np.round(x*y/z)) for x,y,z in zip(original_shape, original_spacing, new_spacing)]) # 进行插值 new_data = np.zeros(new_shape) for i in range(new_shape[0]): slice_2d = data[:, :, int(i/original_shape[0]*new_shape[0])] slice_2d_resized = cv2.resize(slice_2d, (new_shape[1], new_shape[2]), interpolation=cv2.INTER_LINEAR) new_data[i,:,:] = slice_2d_resized # 保存插值后的nii文件 new_img = nib.Nifti1Image(new_data, img.affine) nib.save(new_img, 'interpolated.nii') ``` 解释一下代码的逻辑: 1. 首先使用nibabel库读取原始的nii文件,并获取原始数据的形状和分辨率。 2. 计算插值后的分辨率和形状,这里使用了双线性插值算法。 3. 对原始数据进行插值,得到插值后的数据。 4. 用插值后的数据创建一个新的nii文件,并保存到硬盘上。 注意:为了能够运行这段代码,你需要安装nibabel库和numpy库。另外,这里使用了cv2库中的resize函数进行插值,因此也需要安装opencv-python库。

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