使用R语言对二分类变量进行xgboost特征重要性分析,并结果SHAP图呈现结果,请给出相应代码。
时间: 2024-03-02 15:50:15 浏览: 279
PycharmProjects_python_
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以下是使用xgboost进行特征重要性分析并绘制SHAP图的R代码:
首先,安装必要的包:
```R
install.packages("xgboost")
install.packages("DALEX")
install.packages("shapper")
```
接着,加载所需的库:
```R
library(xgboost)
library(DALEX)
library(shapper)
```
然后,读取数据并进行预处理:
```R
data <- read.csv("data.csv")
data$target <- as.factor(data$target)
```
接下来,将数据集拆分为训练集和测试集,并使用xgboost进行模型拟合和特征重要性分析:
```R
# 拆分训练集和测试集
set.seed(123)
train_index <- sample(1:nrow(data), 0.7*nrow(data))
train <- data[train_index, ]
test <- data[-train_index, ]
# 定义xgboost参数
params <- list(
objective = "binary:logistic",
eval_metric = "auc",
max_depth = 5,
eta = 0.1,
gamma = 0,
subsample = 0.8,
colsample_bytree = 0.8
)
# 拟合xgboost模型
xgb_model <- xgboost(data = as.matrix(train[, -ncol(train)]),
label = train$target,
nrounds = 100,
params = params)
# 特征重要性分析
xgb_importance <- xgb.importance(feature_names = colnames(train[, -ncol(train)]),
model = xgb_model)
print(xgb_importance)
# 绘制SHAP图
explainer <- explain(model = xgb_model,
data = as.matrix(test[, -ncol(test)]),
y = test$target,
label = "xgboost")
plot_features(explainer, type = "shap")
```
以上代码中,使用xgboost对训练集进行拟合,并使用xgb.importance()函数计算特征重要性。接下来,使用explain()函数创建解释器对象,并使用plot_features()函数绘制SHAP图。
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