A = data[label.ravel() == 0]
时间: 2023-10-17 10:05:50 浏览: 41
这是一个基于布尔索引的numpy数组切片操作。假设`data`是一个numpy数组,`label`是一个与`data`形状相同的数组,用于标记`data`中每个元素所属的类别。此时,`label.ravel() == 0`会返回一个和`data`具有相同形状的布尔数组,其中每个元素的值表示对应位置在`label`中的值是否为0。将这个布尔数组用作下标,可以从`data`中提取出所有对应的元素,得到一个新的数组。因此,`A = data[label.ravel() == 0]`将返回一个由`data`中所有标记为0的元素组成的新数组`A`。
相关问题
解释这段代码cancer='HNSC' train=pd.read_csv(dir_py+"\\tcga_data\\"+cancer+"\\ml_input.csv") target=pd.read_csv(dir_py+"\\tcga_data\\"+cancer+"\\tab_label.csv",index_col=0).values.ravel() indices = train.columns[2:] train=train.iloc[:,2:].T.values
这段代码用于读取和处理与癌症相关的数据。
- `cancer='HNSC'`:将变量`cancer`设置为字符串`'HNSC'`,表示所选的癌症类型为头颈部鳞状细胞癌。
- `train=pd.read_csv(dir_py+"\\tcga_data\\"+cancer+"\\ml_input.csv")`:使用`pd.read_csv()`函数读取名为`ml_input.csv`的文件,该文件位于路径`dir_py+"\\tcga_data\\"+cancer`下。读取的数据被存储在名为`train`的DataFrame中。
- `target=pd.read_csv(dir_py+"\\tcga_data\\"+cancer+"\\tab_label.csv",index_col=0).values.ravel()`:使用`pd.read_csv()`函数读取名为`tab_label.csv`的文件,该文件位于路径`dir_py+"\\tcga_data\\"+cancer`下。在这里,`index_col=0`表示将第一列作为索引列。读取的数据被存储在名为`target`的一维数组中。
- `indices = train.columns[2:]`:从`train` DataFrame中的列中提取索引,从第三列开始(索引2),并将其存储在名为`indices`的变量中。
- `train=train.iloc[:,2:].T.values`:从`train` DataFrame中选择所有行和从第三列开始的所有列。然后通过`.T`进行转置操作,将数据框转换为NumPy数组,并将结果存储回`train`变量中。
综上所述,这段代码的目的是读取与头颈部鳞状细胞癌相关的训练数据,并对数据进行处理,以便后续使用。
import scipy.io as scio import numpy as np from sklearn.decomposition import PCA from sklearn import svm import matplotlib.pyplot as plt import random from sklearn.datasets import make_blobs test_data = scio.loadmat('D:\\python-text\\AllData.mat') train_data = scio.loadmat('D:\\python-text\\label.mat') print(test_data) print(train_data) data2 = np.concatenate((test_data['B021FFT0'], test_data['IR007FFT0']), axis=0) data3 = train_data['label'] print(data2) print(data3) # print(type(data3)) # print(data4) # print(type(data4)) data2 = data2.tolist() data2 = random.sample(data2, 200) data2 = np.array(data2) data3 = data3.tolist() data3 = random.sample(data3, 200) data3 = np.array(data3) # data4,data3= make_blobs(random_state=6) print(data2) print(data3) # print(type(data3)) # 创建一个高斯内核的支持向量机模型 clf = svm.SVC(kernel='rbf', C=1000) clf.fit(data2,data3.reshape(-1)) pca = PCA(n_components=2) # 加载PCA算法,设置降维后主成分数目为2 pca.fit(data2) # 对样本进行降维 data4 = pca.transform(data2) # 以散点图的形式把数据画出来 plt.scatter(data4[:, 0], data4[:, 1], c=data3,s=30, cmap=plt.cm.Paired) # 建立图像坐标 axis = plt.gca() xlim = axis.get_xlim() ylim = axis.get_ylim() # 生成两个等差数列 xx = np.linspace(xlim[0], xlim[1], 30) yy = np.linspace(ylim[0], ylim[1], 30) # print("xx:", xx) # print("yy:", yy) # 生成一个由xx和yy组成的网格 X, Y = np.meshgrid(xx, yy) # print("X:", X) # print("Y:", Y) # 将网格展平成一个二维数组xy xy = np.vstack([X.ravel(), Y.ravel()]).T Z = clf.decision_function(xy).reshape(X.shape) # 画出分界线 axis.contour(X, Y, Z, colors='k', levels=[-1, 0, 1], alpha=0.5, linestyles=['--', '-', '--']) axis.scatter(clf.support_vectors_[:, 0], clf.support_vectors_[:, 1], s=100,linewidth=1, facecolors='none') plt.show()修改一下错误
根据你提供的代码,可能存在以下几个问题:
1. 在导入make_blobs时没有使用,可以删除或注释掉相关代码:
```
from sklearn.datasets import make_blobs
# ...
# data4,data3= make_blobs(random_state=6)
```
2. 数据集`test_data`和`train_data`中的数据和标签可能没有对应,可以通过打印数据集的shape比对数据数量是否一致。
3. 对数据集进行随机采样时,可能会导致数据和标签对应错误,可以使用numpy的shuffle函数进行随机打乱。
4. 在训练SVM模型时,数据集的标签需要进行reshape操作,以确保标签和数据数量一致。
修改后的代码如下:
```
import scipy.io as scio
import numpy as np
from sklearn.decomposition import PCA
from sklearn import svm
import matplotlib.pyplot as plt
from sklearn.datasets import make_blobs
test_data = scio.loadmat('D:\\python-text\\AllData.mat')
train_data = scio.loadmat('D:\\python-text\\label.mat')
data2 = np.concatenate((test_data['B021FFT0'], test_data['IR007FFT0']), axis=0)
data3 = train_data['label'].reshape(-1)
# 随机打乱数据集
indices = np.arange(data2.shape[0])
np.random.shuffle(indices)
data2 = data2[indices]
data3 = data3[indices]
# 选择前200个数据作为训练集
data2 = data2[:200]
data3 = data3[:200]
# 创建一个高斯内核的支持向量机模型
clf = svm.SVC(kernel='rbf', C=1000)
clf.fit(data2, data3)
pca = PCA(n_components=2)
pca.fit(data2)
data4 = pca.transform(data2)
plt.scatter(data4[:, 0], data4[:, 1], c=data3, s=30, cmap=plt.cm.Paired)
axis = plt.gca()
xlim = axis.get_xlim()
ylim = axis.get_ylim()
xx = np.linspace(xlim[0], xlim[1], 30)
yy = np.linspace(ylim[0], ylim[1], 30)
X, Y = np.meshgrid(xx, yy)
xy = np.vstack([X.ravel(), Y.ravel()]).T
Z = clf.decision_function(xy).reshape(X.shape)
axis.contour(X, Y, Z, colors='k', levels=[-1, 0, 1], alpha=0.5, linestyles=['--', '-', '--'])
axis.scatter(clf.support_vectors_[:, 0], clf.support_vectors_[:, 1], s=100, linewidth=1, facecolors='none')
plt.show()
```
希望这些修改能够帮助你解决问题。
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