linux中批量解压.fna.gz并删除原压缩包
时间: 2024-05-04 15:22:11 浏览: 16
可以使用以下命令来批量解压`.fna.gz`文件并删除原压缩包:
```
for file in *.fna.gz; do gunzip "$file" && rm "$file"; done
```
这个命令会遍历当前目录下所有以`.fna.gz`结尾的文件,使用`gunzip`命令解压该文件,然后使用`rm`命令删除原压缩包。
相关问题
.fna.gz怎么解压
.fna.gz是一种压缩文件格式,需要使用相应的解压软件进行解压缩。在Linux或MacOS系统中,可以使用命令行工具gzip进行解压,命令如下:
```
gzip -d file.fna.gz
```
在Windows系统中,可以使用WinRAR、7-Zip等文件压缩解压软件进行解压缩,右键单击文件,选择“解压缩到当前文件夹”或“解压缩到指定文件夹”即可。
我在linux系统中有一个文件夹20230510-removepara,里面有2203条.FNA文件,如何用命令行把这些.FNA转成.fasta文件?
可以使用下面的命令行将这些.FNA文件转换为.fasta文件:
```bash
for file in 20230510-removepara/*.FNA; do
filename=$(basename "$file" .FNA)
awk '/^>/ {print ">"FILENAME; next} {print}' "$file" > "20230510-removepara/${filename}.fasta"
done
```
这个命令行使用了一个循环,遍历了文件夹中所有的.FNA文件。对于每一个文件,使用`awk`命令将文件中以`>`开头的行替换为`>文件名`,并将结果输出到新的以`.fasta`为扩展名的文件中。新文件的文件名与原文件相同,只是扩展名不同。