if any(codon_weights.loc[self.tissue, aa_codons]): weight_bkg = codon_weights.loc[self.tissue, aa_codons].mean() codweights = {c: codon_weights.loc[self.tissue, c] + weight_bkg for c in aa_codons} else: codweights = {c: codon_weights.loc[self.tissue, c] for c in aa_codons}
时间: 2024-03-15 09:42:13 浏览: 56
Gene_Prediction.zip_The Gene_gene_predict-python_prediction pyth
这段代码主要是为了计算不同氨基酸对应的密码子权重。具体来说,它使用了一个名为 "codon_weights" 的数据框来获取与氨基酸相关的密码子权重,并根据组织类型 "self.tissue" 来选择相应的行。然后,它使用一个名为 "aa_codons" 的字典来存储每个氨基酸对应的密码子列表。接着,它使用 "any" 函数来判断这些列表中是否有至少一个元素,在 "codon_weights" 数据框中存在对应的权重值。如果存在,则计算这些密码子的平均权重,并将平均权重加到每个密码子的权重值中,得到一个新的字典 "codweights"。如果不存在,则直接将每个密码子的权重值存储到 "codweights" 中。
总的来说,这段代码的作用是为了获取每个氨基酸对应的密码子权重,并将其存储到一个字典中,以便后续的处理和分析。
阅读全文