coxm <- cph(Surv(T,E)~`original:firstorder:RobustMeanAbsoluteDeviation`+`log-sigma-4-0-mm-3D:firstorder:InterquartileRange`+`log-sigma-5-0-mm-3D:glszm:SmallAreaEmphasis`+`wavelet-HHL:firstorder:Mean`+`wavelet-HHH:firstorder:Mean`,x=T,y=T,data=df,surv=T) Error in as.data.frame.default(data, optional = TRUE) : cannot coerce class ‘"function"’ to a data.frame

时间: 2024-04-10 20:32:39 浏览: 157
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CPH3427-TL-E-VB-MOSFET产品应用与参数解析

这个错误是因为你在使用`cph`函数时传递了一个函数作为数据参数。`cph`函数期望接收一个数据框作为数据参数，而不是一个函数。 请确保你传递给`data`参数的是一个正确的数据框对象。你可以使用`str(df)`来检查你的数据框的结构和类别。如果你的数据不是一个数据框，请确保将其转换为数据框对象再传递给`cph`函数。
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df <- read_excel("C:/Users/Z/Desktop/123.xlsx") dd=datadist(df) options(datadist="dd") options(na.action="na.delete") coxm <- cph(Surv(T,E)~original.firstorder.RobustMeanAbsoluteDeviation+log.sigma.4.0.mm.3D.firstorder.InterquartileRange+log.sigma.5.0.mm.3D.glszm.SmallAreaEmphasis+wavelet.LLH.firstorder.InterquartileRange+wavelet.LLH.firstorder.Uniformity+wavelet.HHL.firstorder.Mean+wavelet.LLL.glcm.Autocorrelation+wavelet.LLL.glcm.ClusterProminence,x=T,y=T,data=df,surv=T)

coxm <- cph(Surv(T,E)~original.firstorder.RobustMeanAbsoluteDeviation+log.sigma.4.0.mm.3D.firstorder.InterquartileRange+log.sigma.5.0.mm.3D.glszm.SmallAreaEmphasis+wavelet.LLH.firstorder....

Error in cph(Surv(T, E) ~ original.firstorder.RobustMeanAbsoluteDeviation + : could not find function "cph"

这个错误通常表示你没有...cph(Surv(T, E) ~ original.firstorder.RobustMeanAbsoluteDeviation + ...) 如果你已经加载了rms包但仍然出现错误，请检查你的R代码是否正确地调用了cph函数，或者尝试重新加载rms包。

意外的符号在"mul_cox_2 <- cph(Surv(Survival months"里，这一段里面错误在哪

在 R 语言的代码片段 mul_cox_2 <- cph(Surv(Survival months 中，有一个明显的语法错误。看起来像是在调用 cph 函数（coxph回归），用于生存分析。然而，这里有两个问题： 1. Survival months 这个部分似乎...

R语言运行代码：fit<-cph(Surv(time,death) ~ rcs(BNP,3)+ASA+HB,data=mydata)，出现错误错误于[.default(y, , 3): 下标出界请列出详细的解决该问题的代码

这个R语言错误通常发生在尝试从数据框(mydata)中提取变量值时，由于索引超出范围。rcs()函数用于创建归一化立方 spline ...fit <- cph(Surv(time, death) ~ rcs(BNP_group, 3) + ASA + HB, data = mydata)

为什么运行你的代码之后出现Error in eval(predvars, data, callenv) : object 'original.firstorder.RobustMeanAbsoluteDeviation' not found

coxm <- cph(Surv(T,E)~original.firstorder.RobustMeanAbsoluteDeviation+log.sigma.4.0.mm.3D.firstorder.InterquartileRange+log.sigma.5.0.mm.3D.glszm.SmallAreaEmphasis+wavelet.LLH.firstorder....

fcox3 <- cph(Surv(OS.time, OS) ~ RiskGroup + pstage +gender, surv=T,x=T, y=T, time.inc = 36, data=my.cli.3) cal3 <- calibrate(fcox3, cmethod="KM", method="boot", u=36, m=94, B=500)#m，是根据样本量n而定，一般m=n/4或n/5即可 fcox5 <- cph(Surv(OS.time, OS) ~ RiskGroup + pstage +gender, surv=T,x=T, y=T, time.inc = 60, data=my.cli.3) cal5 <- calibrate(fcox5, cmethod="KM", method="boot", u=60, m=94, B=500)# 怎么把cal3,cal5 画在一幅图上

plot(cal3, xlim=c(0, 1), ylim=c(0, 1), col="blue") 2. 接着，使用 lines() 函数将 cal5 的校准曲线添加到图中，同样设置 col 参数来指定曲线的颜色，例如： R lines(cal5, col="red") 3...

Can't compute median survival time of object

cph.fit(rossi_dataset, duration_col='week', event_col='arrest') # 计算中位生存时间 median_survival_times(cph, method='kaplan-meier') 该代码加载了罗西数据集，使用 CoxPHFitter 拟合 COX 模型，...

--------- beginning of crash 01-18 13:36:55.631 641 641 F libc : Fatal signal 6 (SIGABRT), code -1 (SI_QUEUE) in tid 641 (init), pid 641 (init) 01-18 13:36:55.653 641 641 F libc : crash_dump helper failed to exec, or was killed 07-13 20:17:19.904 4586 4586 F libc : Fatal signal 6 (SIGABRT), code -1 (SI_QUEUE) in tid 4586 (init), pid 4586 (init) 07-13 20:17:20.109 4586 4586 F libc : crash_dump helper failed to exec, or was killed 07-13 22:44:09.011 19049 19173 F libc : Fatal signal 7 (SIGBUS), code 2 (BUS_ADRERR), fault addr 0x703860a000 in tid 19173 (priority-3), pid 19049 (loros.gallery3d) 07-13 22:44:18.663 19978 19978 F DEBUG : Process name is com.coloros.gallery3d, not key_process 07-13 22:44:18.663 19978 19978 F DEBUG : keyProcess: 0 07-13 22:44:18.663 19978 19978 F DEBUG : *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** *** 07-13 22:44:18.663 19978 19978 F DEBUG : Build fingerprint: 'OPPO/CPH2565/OP5745L1:13/TP1A.220905.001/T.R4T2.1171403-23463-3:user/release-keys' 07-13 22:44:18.663 19978 19978 F DEBUG : Revision: '0' 07-13 22:44:18.663 19978 19978 F DEBUG : ABI: 'arm64' 07-13 22:44:18.663 19978 19978 F DEBUG : Timestamp: 2023-07-13 22:44:17.727514045+0800 07-13 22:44:18.663 19978 19978 F DEBUG : Process uptime: 152s 07-13 22:44:18.663 19978 19978 F DEBUG : Cmdline: com.coloros.gallery3d 07-13 22:44:18.663 19978 19978 F DEBUG : pid: 19049, tid: 19173, name: priority-3 >>> com.coloros.gallery3d <<< 07-13 22:44:18.663 19978 19978 F DEBUG : uid: 10115 07-13 22:44:18.663 19978 19978 F DEBUG : signal 7 (SIGBUS), code 2 (BUS_ADRERR), fault addr 0x000000703860a000 07-13 22:44:18.663 19978 19978 F DEBUG : x0 0000007010ec7130 x1 0000007038609fd0 x2 0000000000000038 x3 0000000000000020

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Error in cph(Surv(time, Y) ~ ., X = T, y = T, data = surv, surv = T, n = 17836) : argument 6 matches multiple formal arguments

cph(Surv(time, Y) ~ ., X = T, y = T, data = surv, id = T, maxiter = 17836) 这样就可以避免参数位置混淆的问题。另外，你也可以查看一下 cph() 函数的帮助文档，确保你使用的是正确的参数名和参数位置。

did not specify surv=t with cph

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print(cph.summary()) TypeError: 'DataFrame' object is not callable

cph.summary()应该是一个属性而不是方法，所以不需要使用括号。以下是修正后的代码： python from lifelines import CoxPHFitter import pandas as pd # 准备数据 data = pd.DataFrame({ 'time': [5, 10, 15...

结局为新发高胆固醇血症（二分类变量），cohort为蛋白水平，有一万多个蛋白，如何使用age-period cohort模型分析四个横断面重复测量数据的高胆固醇血症相关的差异性蛋白，提供R代码

model <- Surv(time = df$time, event = as.numeric(df$cholesterol_event == "high")) ~ age + period + cohort + protein_1 + ... + protein_10000 # 使用cph函数拟合APC模型 apc_model <- cph(model, data = df,...

InvalidArchiveError("Error with archive C:\\Users\\梁帅博\\.conda\\pkgs\\wheel-0.38.4-py310haa95532_0\\.cph_tmpd3d1jh9_\\info-wheel-0.38.4-py310haa95532_0.tar.zst. You probably need to delete and re-download or re-create this file. Message from libarchive was:\n\nFailed to open 'C:\\Users\\梁帅博\\.conda\\pkgs\\wheel-0.38.4-py310haa95532_0\\.cph_tmpd3d1jh9_\\info-wheel-0.38.4-py310haa95532_0.tar.zst'")解释报错

这个报错是因为在安装或更新wheel包时，下载的info-wheel-0.38.4-py310haa95532_0.tar.zst文件出现了错误，导致解压失败。可能的原因包括网络连接问题、文件损坏等等。 解决方法就是删除C:\\Users\\梁帅博\\....

InvalidArchiveError("Error with archive C:\\Users\\泠枫\\.conda\\pkgs\\libpython-2.1-py39haa95532_0\\.cph_tmpjvmttmh5\\info-libpython-2.1-py39haa95532_0.tar.zst. You probably need to delete and re-download or re-create this file. Message from libarchive was:\n\nFailed to open 'C:\\Users\\泠枫\\.conda\\pkgs\\libpython-2.1-py39haa95532_0\\.cph_tmpjvmttmh5\\info-libpython-2.1-py39haa95532_0.tar.zst'")这怎么解决

4. 重新下载或重新创建 info-libpython-2.1-py39haa95532_0.tar.zst 文件。 - 如果你使用的是conda命令行工具，可以尝试使用以下命令重新下载文件： conda clean --all conda install libpython-2.1-py...

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