blastn结果怎么解读,每一列代表什么
时间: 2024-02-29 08:56:59 浏览: 262
BlastToSam:将 BLASTN 查询结果转换为 SAM 格式的工具
Blastn输出的比对结果是一个表格,每一行代表一个比对结果,每一列代表不同的信息。下面是Blastn输出结果的各列含义:
1. Query id:查询序列的标识符。
2. Subject id:参考序列的标识符。
3. % identity:比对序列之间的相似度百分比。
4. alignment length:比对序列的长度。
5. mismatches:比对序列之间的不匹配数量。
6. gap opens:比对序列中出现的插入或删除数量。
7. q. start:查询序列的起始位置。
8. q. end:查询序列的终止位置。
9. s. start:参考序列的起始位置。
10. s. end:参考序列的终止位置。
11. evalue:比对序列之间的期望值(期望得分)。
12. bit score:比对序列之间的比特分数。
解读Blastn结果的关键是理解上述各列含义和它们之间的关系。例如,% identity和alignment length可以用于评估比对质量,evalue和bit score可以用于评估比对的可靠性和显著性。
阅读全文