blastn结果怎么解读，每一列代表什么

Blastn输出的比对结果是一个表格，每一行代表一个比对结果，每一列代表不同的信息。下面是Blastn输出结果的各列含义：

1. Query id：查询序列的标识符。
2. Subject id：参考序列的标识符。
3. % identity：比对序列之间的相似度百分比。
4. alignment length：比对序列的长度。
5. mismatches：比对序列之间的不匹配数量。
6. gap opens：比对序列中出现的插入或删除数量。
7. q. start：查询序列的起始位置。
8. q. end：查询序列的终止位置。
9. s. start：参考序列的起始位置。
10. s. end：参考序列的终止位置。
11. evalue：比对序列之间的期望值（期望得分）。
12. bit score：比对序列之间的比特分数。

解读Blastn结果的关键是理解上述各列含义和它们之间的关系。例如，% identity和alignment length可以用于评估比对质量，evalue和bit score可以用于评估比对的可靠性和显著性。

相关问题

能看出来输出结果包含了什么信息吗，每一列是什么内容

根据blastn命令中的-outfmt 6选项，输出结果为tabular格式，共有12列，每一列的含义如下：

1. qseqid：查询序列的ID；
2. qlen：查询序列的长度；
3. saccver：匹配到的参考序列的ID和版本号；
4. salltitles：匹配到的参考序列的所有注释信息；
5. slen：匹配到的参考序列的长度；
6. pident：比对序列和参考序列的同源性百分比；
7. length：比对序列和参考序列的匹配长度；
8. qcovs：比对序列和参考序列的覆盖度百分比；
9. bitscore：比对序列和参考序列的比对分数；
10. evalue：比对序列和参考序列的比对期望值；
11. staxids：匹配到的参考序列的物种ID；
12. 空列：保留，无内容。

WU-BLASTN工具

WU-BLASTN是一种用于核酸序列比对的工具，它是基于NCBI BLAST（Basic Local Alignment Search Tool）的一个变种。WU-BLASTN使用的算法和原理与BLASTN类似，但在性能和准确性上有所改进。

WU-BLASTN是用于比对核酸序列的工具，它可以在数据库中快速搜索和比对DNA或RNA序列。它主要用于寻找相似的序列、确定同源性、识别功能区域等任务。WU-BLASTN采用了局部比对的策略，通过寻找序列之间的局部匹配来确定相似性。

WU-BLASTN可以用于各种生物学研究领域，如基因组学、转录组学、比较基因组学等。它在序列比对和注释中发挥着重要作用，帮助研究人员理解生物学序列之间的关系和功能。

请注意，WU-BLASTN是一个开源工具，并且已经有一些更新和改进的版本可供使用。您可以在相关的生物信息学资源和网站上找到更多关于WU-BLASTN工具的详细信息和使用方法。