from sklearn import random_projection from sklearn import decomposition,metrics from sklearn.cluster import KMeans X,y=datasets.load_breast_cancer(return_X_y=True) print("X.shape:",X.shape) print("y.shape:",y.shape) print("X[:3]:",X[:3]) print("y[:3]",y[:3]) #随机投影降维 rp=random_projection.SparseRandomProjection(n_components=3,density=0.1,random_state=42) X_projected=rp.fit_transform(X) # ##PCA降维 pca=decomposition.TruncatedSVD(n_components=3) X_projected=pca.fit_transform(X) ##kmeans聚类 y_pred=KMeans(n_clusters=2,n_init=10).fit_predict(X_projected) ##对K-mean的聚类效果进行评分 score=metrics.calinski_harabasz_score(X_projected,y_pred) print(score) plt.figure(1) ax = plt.subplot(111, projection='3d') ax.scatter(X_projected[:,0],X_projected[:,1],X_projected[:,2],c=y) plt.figure(2) ax = plt.subplot(111, projection='3d') ax.scatter(X_projected[:,0],X_projected[:,1],X_projected[:,2],c=y_pred) plt.show()是在干什么
时间: 2024-04-28 11:21:36 浏览: 8
这段代码主要是使用sklearn库中的一些机器学习算法对乳腺癌数据集进行降维和聚类,然后对聚类效果进行评估,最后用可视化的方式展示降维和聚类的结果。
具体来说,代码中的操作包括:
1. 加载乳腺癌数据集,其中X表示样本特征,y表示样本标签。
2. 使用随机投影(SparseRandomProjection)算法对样本进行降维,将特征从原来的30维降到了3维。
3. 使用PCA算法对样本进行降维,同样将特征从原来的30维降到了3维。
4. 使用K-means算法对降维后的数据进行聚类,将样本分为2类。
5. 使用Calinski-Harabasz指数(calinski_harabasz_score)对聚类效果进行评估,越大表示聚类效果越好。
6. 使用Matplotlib库对降维和聚类的结果进行可视化展示,其中第一个图展示了原始数据在3D空间中的分布情况,第二个图展示了聚类后的结果在3D空间中的分布情况。
相关问题
from mpl_toolkits.mplot3d import Axes3D
这是Python中用于绘制三维图形的模块之一,主要用于matplotlib库中。通过使用Axes3D模块,可以方便地创建三维坐标系,并在其中绘制三维图形。在使用之前,需要先安装matplotlib库。以下是一个简单的示例代码,用于创建一个三维坐标系并在其中绘制一个简单的三维散点图:
```python
import matplotlib.pyplot as plt
from mpl_toolkits.mplot3d import Axes3D
import numpy as np
# 创建一个三维坐标系
fig = plt.figure()
ax = fig.add_subplot(111, projection='3d')
# 生成一些随机数据
x = np.random.normal(size=100)
y = np.random.normal(size=100)
z = np.random.normal(size=100)
# 绘制散点图
ax.scatter(x, y, z)
# 设置坐标轴标签
ax.set_xlabel('X Label')
ax.set_ylabel('Y Label')
ax.set_zlabel('Z Label')
# 显示图形
plt.show()
```
这将生成一个简单的三维散点图,其中x、y、z轴分别表示随机生成的三个数据集。您可以根据需要修改代码,并使用Axes3D模块创建更复杂的三维图形。
from mpl_toolkits.basemap import Basemap这个调用不了
如果你在使用 `from mpl_toolkits.basemap import Basemap` 时出现了错误,可能是因为 Basemap 已经在 2020 年停止更新,不再支持 Python 3,并且已经从 PyPI 中移除。建议你使用 Cartopy 库代替 Basemap 库,Cartopy 是一个更加现代化的 Python 地图绘制库,支持 Python 3,并且提供了更多的功能和更好的性能。
你可以通过以下命令安装 Cartopy 库:
```
pip install cartopy
```
安装完成后,你可以使用以下代码来绘制地图:
```python
import cartopy.crs as ccrs
import matplotlib.pyplot as plt
# 创建一个以等面积投影方式为基础的地图
ax = plt.axes(projection=ccrs.EqualEarth())
# 添加海岸线和边界
ax.coastlines(resolution='110m', linewidth=1)
# 设置地图显示范围
ax.set_extent([-180, 180, -90, 90], crs=ccrs.PlateCarree())
plt.show()
```
更多的地图绘制示例可以参考 Cartopy 的官方文档。