cmprsk predict.crr预测某个时间点cif
时间: 2023-06-22 19:02:08 浏览: 140
plot_cv_predict.zip_cross_val_predict_plot(cv._predict-python_预测
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### 回答1:
cmprsk predict.crr 是R语言中用于生存分析的函数,用来预测在给定时间点的累积发生率或累积死亡率。
其中,crr是基于Cox比例风险模型的方法,用来分析生存数据中的风险因素。
使用cmprsk predict.crr函数预测某个时间点cif,需要提供以下信息:
1. 模型对象,即已经建立的基于Cox比例风险模型的生存分析模型;
2. 需要预测的时间点或时间段;
3. 预测结果的类型,包括cumhaz、surv、cif等,其中cif表示累积发生率。
例如,可以使用以下代码预测在20个月时的事件发生率:
```
pred <- predict.crr(model, times=20, type='cif')
```
其中,model为已建立的生存分析模型,times=20表示预测20个月时的事件发生率,type='cif'表示预测累积发生率。
最终,函数将返回在20个月时的累积发生率预测值。这样的预测结果可以帮助研究者更好地理解生存分析数据中的风险因素,进一步进行生存分析研究。
### 回答2:
首先,cif是指条件事件的累积发生率(cumulative incidence function),常用于生存分析中计算死亡率、复发率等。在使用cmprsk包中的predict.crr函数预测某个时间点的cif时,需要先进行如下步骤:
1. 导入cmprsk和survival两个包,其中cmprsk包用于处理多状态生存数据,而survival包提供了一些生存分析的函数。
2. 准备好待预测的数据,包括协变量和生存时间,其中生存时间可以是时间间隔、事件时间或截断时间,而协变量可以是连续、分类或顺序变量。
3. 使用crr函数进行模型拟合,其语法为:crr(Surv(time, status) ~ covs, data = mydata, cause = "event")
4. 对于需要预测cif的时间点t,需要先将待预测数据中的生存时间截断在t处,同时添加一列新的时间变量,如“t_predict”,并将其设为t。
5. 使用predict.crr函数进行预测,其语法为:predict.crr(model, newdata = mydata_predict, times = t, type = "risk", se.fit = TRUE)
其中,model指代上一步得到的crr模型,newdata为待预测的数据,times为需要预测的时间点,type为预测类型,可以是“risk”(默认值,表示预测cif)或“surv”(表示预测生存函数),se.fit表示是否返回标准误。
6. 最后,可以得到预测出的cif值,即待预测时间点t的条件事件累积发生率,可以通过summary或plot函数对预测结果进行进一步的分析和展示。
总之,使用cmprsk包中的predict.crr函数预测某个时间点cif需要先进行模型拟合和数据预处理,再调用相应的函数进行预测和结果分析。
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