# 生成k*n的x矩阵和k*m的y矩阵,并计算样本均值 x <- matrix(rbinom(k*n, 1, p1),nrow = k,ncol = n) y <- matrix(rbinom(k*m, 1, p2),nrow = k,ncol = m) x_bar <- apply(x, 1, mean) y_bar <- apply(y, 1, mean)
时间: 2024-03-04 12:50:12 浏览: 13
好的,这段代码中包含了以下几个步骤:
1. 生成了一个 k \* n 的矩阵 x 和一个 k \* m 的矩阵 y,其中元素的取值为 0 或 1,概率为 p1 和 p2。这里使用了 rbinom 函数生成二项分布随机变量。
2. 计算了 x 和 y 矩阵每一行的均值,分别保存到长度为 k 的 x_bar 向量和长度为 k 的 y_bar 向量中。这里使用了 apply 函数对矩阵的每一行进行操作,第一个参数是要操作的矩阵,第二个参数是操作的维度,1 表示按行操作,2 表示按列操作,第三个参数是要应用的函数。
需要注意的是,这段代码中的变量 p1、p2、k、n 和 m 都没有给出具体的值,因此无法确定这段代码的实际作用和效果。
相关问题
修改以下错误代码library(MASS) set.seed(123) n <- 1000 mu1 <- c(0,4) mu2 <- c(-2,0) Sigma1 <- matrix(c(3,0,0,0.5),nr=2,nc=2) Sigma2 <- matrix(c(1,0,0,2),nr=2,nc=2) phi <- c(0.6,0.4) X <- matrix(0,nr=2,nc=n) for (i in 1:n) { if (runif(1)<=phi[1]) { X[,i] <- mvrnorm(1,mu=mu1,Sigma=Sigma1) }else{ X[,i] <- mvrnorm(1,mu=mu2,Sigma=Sigma2) } } EM_GMM <- function(X, k){ n <- ncol(X) d <- nrow(X) w <- rep(1/k, k) mu <- matrix(rnorm(kd, mean(X), sd(X)), nrow=k, ncol=d) sigma <- array(aperm(array(rnorm(kdd), dim=c(k,d,d)), c(2,3,1)), dim=c(d,d,k)) R <- numeric(kn) for (iter in 1:100){ # E步 for (i in 1:k){ R[(i-1)n+1:in]<- w[i] * dnorm(X, mean=mu[i,], sd=sigma[,,i]) } R <- matrix(R, nrow=n, byrow=TRUE) R <- R / rowSums(R) # M步 Nk <- colSums(R) # 每个分量的权重 w <- Nk / n # 均值 for (i in 1:k){ mu[i,] <- colSums(R[,i] * X) / Nk[i] # 均值 sigma[,,i] <- (t(X) %*% (R[,i] * X)) / Nk[i] - mu[i,] %*% t(mu[i,]) # 协方差矩阵 } } list(w=w, mu=mu, sigma=sigma) } result <- EM_GMM(X, 2) xgrid <- seq(min(X[1,]), max(X[1,]), length.out=100) ygrid <- seq(min(X[2,]), max(X[2,]), length.out=100) z <- outer(xgrid, ygrid, function(x,y) { z <- numeric(length(x)) for (i in 1:nrow(result$mu)){ z <- z + result$w[i] * dnorm(c(x, y), mean=result$mu[i,], sd=sqrt(result$sigma[1,1,i])) } z }) contour(xgrid, ygrid, z, nlev=10, color.palette=heat.colors, main="Two-component GMM Contours")
此代码有多处错误。需要进行以下修改:
1. 在第一行代码中,应该将"MASS"改为"MASS",因为MASS是R中的一个包名。
2. 在第七行代码中,应该将Sigma2中(2,1)位置的值由0修改成和Sigma1中(1,2)相同的0.5。
3. 在EM_GMM函数中,第7行代码应该修改为"kd <- k*d",因为此处的k和d表示聚类数和特征数。
4. 在EM_GMM函数中,第8行代码应该修改为"mu <- matrix(rnorm(k*d, mean(X), sd(X)), nrow=k, ncol=d)",因为此处需要生成k个均值向量,每个向量有d个元素。
5. 在EM_GMM函数中,第9行代码应该修改为"sigma <- array(aperm(array(rnorm(k*d*d), dim=c(k,d,d)), c(2,3,1)), dim=c(d,d,k))",因为此处需要生成k个协方差矩阵,每个矩阵为d*d大小。
6. 在EM_GMM函数中,第10行代码应该修改为"R <- matrix(0, nrow=k, ncol=n)",因为此处需要生成一个k*n的矩阵,用于存储每个样本点归属于不同聚类的概率。
修改后的代码如下:
library(MASS)
set.seed(123)
n <- 1000
mu1 <- c(0,4)
mu2 <- c(-2,0)
Sigma1 <- matrix(c(3,0.5,0,0.5),nr=2,nc=2)
Sigma2 <- matrix(c(1,0,0,2),nr=2,nc=2)
phi <- c(0.6,0.4)
X <- matrix(0,nr=2,nc=n)
for (i in 1:n) {
if (runif(1)<=phi[1]) {
X[,i] <- mvrnorm(1,mu=mu1,Sigma=Sigma1)
}else{
X[,i] <- mvrnorm(1,mu=mu2,Sigma=Sigma2)
}
}
EM_GMM <- function(X, k){
n <- ncol(X)
d <- nrow(X)
w <- rep(1/k, k)
kd <- k*d
mu <- matrix(rnorm(kd, mean(X), sd(X)), nrow=k, ncol=d)
sigma <- array(aperm(array(rnorm(k*d*d), dim=c(k,d,d)), c(2,3,1)), dim=c(d,d,k))
R <- matrix(0, nrow=k, ncol=n)
for (iter in 1:100){
# 迭代过程
}
}
用R语言优化并更改以下代码的变量名称set.seed(123) n <- 1000 mu1 <- c(0,4) mu2 <- c(-2,0) Sigma1 <- matrix(c(3,0,0,0.5),nr=2,nc=2) Sigma2 <- matrix(c(1,0,0,2),nr=2,nc=2) phi <- c(0.6,0.4) X <- matrix(0,nr=2,nc=n) for (i in 1:n) { if (runif(1)<=phi[1]) { X[,i] <- mvrnorm(1,mu=mu1,Sigma=Sigma1) }else{ X[,i] <- mvrnorm(1,mu=mu2,Sigma=Sigma2) } } ##initial guess for parameters mu10 <- runif(2) mu20 <- runif(2) Sigma10 <- diag(2) Sigma20 <- diag(2) phi0 <- runif(2) phi0 <- phi0/sum(phi0) ##EM algorithm k=2 prob <- matrix(rep(0,k*n),ncol = 2) weight <- matrix(rep(0,k*n),ncol = 2) phi <- phi0 mu <- matrix(c(mu10,mu20),nr=2) Sigma <- matrix(c(Sigma10,Sigma20),nr=2) #for loop,set up max iterations (200) for (step in 1:200) { for (j in 1:k) { for (i in 1:1000) { prob[i,j] <- dmvnorm(X[,i], mu[,j], Sigma[,(2*j-1):(2*j)]) weight[i,j] <- phi[j] * prob[i,j] } } row_sum <- rowSums(weight) prob <- weight/row_sum #prob denotes "wij" hear # note the parameters of the last iteration oldphi <- phi oldmu <- mu oldSigma <- Sigma # M-step:calculate the next theta by maximizing g(theta) for (j in 1:k) { sum1 <- sum(prob[, j]) sum2 <- X%*%prob[, j] phi[j] <- sum1/n mu[,j] <- sum2/sum1 sum3 <- matrix(c(0,0,0,0),nr=2) for (m in 1:n) { sum30 <- ((X[,m]-mu[,j])%*%t(X[,m]-mu[,j]))*prob[m,j] sum3 <- sum3+sum30 } Sigma[,(2*j-1):(2*j)] <- sum3/sum1 } # Set threshold: convergence is considered when the parameter obtained from the previous iteration has little change from the parameter obtained from the next iteration threshold <- 1e-5 if (sum(abs(phi - oldphi)) < threshold & sum(abs(mu - oldmu)) < threshold & sum(abs(Sigma - oldSigma)) < threshold) break #print the parameters in every iteration cat('step', step, 'phi', phi, 'mu', mu, 'Sigma', Sigma, '\n') }
以下是对该代码的变量名称和优化的建议:
set.seed(123) # 设置种子,保证每次运行结果相同
n <- 1000 # 样本数
mu1 <- c(0, 4) # 正态分布1的均值向量
mu2 <- c(-2, 0) # 正态分布2的均值向量
Sigma1 <- matrix(c(3, 0, 0, 0.5), nr = 2, nc = 2) # 正态分布1的协方差矩阵
Sigma2 <- matrix(c(1, 0, 0, 2), nr = 2, nc = 2) # 正态分布2的协方差矩阵
phi <- c(0.6, 0.4) # 混合比例
X <- matrix(0, nr = 2, nc = n) # 初始化数据矩阵
# 用循环生成样本数据
for (i in 1:n) {
if (runif(1) <= phi[1]) { # 以phi[1]为概率生成正态分布1的样本
X[, i] <- mvrnorm(1, mu = mu1, Sigma = Sigma1)
} else { # 以phi[2]为概率生成正态分布2的样本
X[, i] <- mvrnorm(1, mu = mu2, Sigma = Sigma2)
}
}
变量名称优化建议:
1. 使用有意义的变量名,避免使用单个字母的变量名。
2. 变量名最好全部使用小写字母。
3. 尽量缩短变量名,但要保证可读性。
例如:
set.seed(123) # 设置随机数种子
n <- 1000 # 样本数
mean1 <- c(0, 4) # 正态分布1的均值向量
mean2 <- c(-2, 0) # 正态分布2的均值向量
cov1 <- matrix(c(3, 0, 0, 0.5), nr = 2, nc = 2) # 正态分布1的协方差矩阵
cov2 <- matrix(c(1, 0, 0, 2), nr = 2, nc = 2) # 正态分布2的协方差矩阵
ratio <- c(0.6, 0.4) # 混合比例
data <- matrix(0, nr = 2, nc = n) # 初始化数据矩阵