NameError: name 'fig' is not defined
时间: 2023-09-09 11:14:39 浏览: 150
这个错误通常是因为代码中没有定义名为 `fig` 的变量。你需要确保在运行 `fig.show()` 之前,已经定义了 `fig` 变量并为其赋值。
下面是一个完整的例子,可以让你了解如何在 Jupyter Notebook 中绘制漏斗图:
```python
import plotly.graph_objs as go
# 定义数据
labels = ['访问', '注册', '付费']
values = [1000, 600, 200]
# 绘制漏斗图
fig = go.Figure(go.Funnel(
y = labels,
x = values,
textinfo = "value+percent initial"))
# 显示漏斗图
fig.show()
```
在这个例子中,我们首先导入了 `plotly.graph_objs` 模块,并定义了漏斗图的标签和值。然后,我们使用 `go.Funnel` 创建了漏斗图,并将其赋值给 `fig` 变量。最后,使用 `fig.show()` 方法来显示漏斗图。
如果你仍然遇到名为 `fig` 的变量未定义的错误,请检查代码中是否存在拼写错误或语法错误,并确保正确导入了所需的库和模块。
相关问题
NameError: name 'subfolder' is not defined
非常抱歉,我在之前的回答中犯了一个错误。在 `create_boxplot` 函数中,`subfolder` 变量没有定义。这是因为 `subfolder` 变量只在 `extract_data` 函数中定义,并不在 `create_boxplot` 函数的作用域内。
为了解决这个问题,我们可以修改代码,将 `subfolders` 列表作为参数传递给 `create_boxplot` 函数。这样,我们可以在外部循环中使用 `subfolders` 列表,并将其作为参数传递给 `create_boxplot` 函数。修改后的代码如下:
```python
import os
import matplotlib.pyplot as plt
import sys
def extract_data(rbp_name):
data = []
subfolders = ['lncRNA', 'miRNA', 'mRNA', 'snoRNA', 'snRNA', 'tRNA']
for subfolder in subfolders:
folder_path = os.path.join(rbp_name, subfolder, '3.normalization')
ctrl_file = os.path.join(folder_path, f'Ctrl_{subfolder}_rpm.txt')
rep1_file = os.path.join(folder_path, f'rep1_{subfolder}_rpm.txt')
rep2_file = os.path.join(folder_path, f'rep2_{subfolder}_rpm.txt')
with open(ctrl_file, 'r') as f:
ctrl_data = [line.strip().split('\t')[1] for line in f]
with open(rep1_file, 'r') as f:
rep1_data = [line.strip().split('\t')[1] for line in f]
with open(rep2_file, 'r') as f:
rep2_data = [line.strip().split('\t')[1] for line in f]
data.append(ctrl_data)
data.append(rep1_data)
data.append(rep2_data)
return data
def create_boxplot(rbp_name, data, subfolders):
fig, ax = plt.subplots()
ax.boxplot(data)
x_labels = [f'Ctrl_{subfolder}', f'rep1_{subfolder}', f'rep2_{subfolder}'] * len(subfolders)
ax.set_xticklabels(x_labels, rotation=45)
plt.savefig(os.path.join(rbp_name, f'{rbp_name}_boxplot.pdf'))
plt.close()
if __name__ == "__main__":
rbp_name = sys.argv[1]
subfolders = ['lncRNA', 'miRNA', 'mRNA', 'snoRNA', 'snRNA', 'tRNA']
# 提取数据
data = extract_data(rbp_name)
# 创建箱线图
create_boxplot(rbp_name, data, subfolders)
```
通过将 `subfolders` 列表作为参数传递给 `create_boxplot` 函数,并在函数内部使用它,我们可以解决 `NameError` 错误。请尝试运行修改后的代码,看看问题是否解决了。如果还有其他问题,请随时提问。
fig.patch.set_facecolor('silver') ^^^ NameError: name 'fig' is not defined
这个错误通常是因为您在代码中没有定义变量 'fig'。请确保您在使用 'fig' 变量之前定义了它,并且它应该是一个有效的 matplotlib 的 Figure 对象。另外,请注意,如果您使用了 Jupyter Notebook 或类似的环境,可能需要运行之前的所有单元格,以确保所有的变量被正确定义和初始化。