data=data[order(data$gene_name, data$median,decreasing = T),]
时间: 2023-05-18 09:06:21 浏览: 64
这是一个 R 语言中的代码,它的作用是按照 data 数据框中 gene_name 列的字母顺序对数据进行排序,如果 gene_name 相同,则按照 median 列的数值大小进行排序,且按照降序排列。
相关问题
median_T <- read_excel("median_T.xlsx") median_T$Tissue <- factor(median_T$Tissue) aov_cpm_median_T <- aov(median_expression ~ Tissue, data = median_T) pairwise_T <- pairwise.t.test(median_expression ~ Tissue, data = median_T),以上代码的报错信息为:Error in factor(g) : argument "g" is missing, with no default,应怎么修改该代码?
根据错误信息,可能是在使用`factor()`函数将`median_T$Tissue`转换为因子型数据时出现了问题。请尝试使用以下代码:
```
median_T <- read_excel("median_T.xlsx")
median_T$Tissue <- as.factor(median_T$Tissue)
aov_cpm_median_T <- aov(median_expression ~ Tissue, data = median_T)
pairwise_T <- pairwise.t.test(median_expression ~ Tissue, data = median_T)
```
在上述代码中,使用`as.factor()`函数将`median_T$Tissue`转换为因子型数据类型。这个函数应该能够避免`factor()`函数的报错问题。
如果上述代码仍然不能解决问题,请检查数据是否存在空值或非数值型数据,并尝试进行数据清洗和转换。
> pairwise_T <- pairwise.t.test(median_expression ~ Tissue, data = median_T) Error in factor(g) : argument "g" is missing, with no default
这个错误通常是由于自变量`Tissue`的数据类型不是因子型导致的。在进行`pairwise.t.test()`函数时,自变量必须是因子型数据。您可以使用`factor()`函数将`Tissue`转换为因子型数据类型,例如:
```
median_T$Tissue <- factor(median_T$Tissue)
pairwise_T <- pairwise.t.test(median_expression ~ Tissue, data = median_T)
```
在上述代码中,使用`factor()`函数将`median_T`数据集中的`Tissue`列转换为因子型数据类型,然后再使用`pairwise.t.test()`函数进行显著性检验分析。
请注意,如果`Tissue`列已经是因子型数据类型,则不需要使用`factor()`函数进行转换。
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