nii.gz格式的三维图像转换为dicom格式python代码怎么写?dicom三维图像转换成三维重建VTK的输入格式python代码怎么写?
时间: 2024-01-14 22:02:26 浏览: 108
brain-growth 图像分割、包含40个病例,数据格式为nii.gz
对于将nii.gz格式的三维图像转换为dicom格式,可以使用以下Python代码:
```python
import SimpleITK as sitk
# 读取nii.gz文件
image = sitk.ReadImage('example.nii.gz')
# 将nii.gz文件转换为dicom格式
sitk.WriteImage(image, 'example.dcm')
```
上述代码使用了SimpleITK库,可以从nii.gz文件中读取三维图像数据,并将其转换为dicom格式。需要注意的是,dicom格式需要指定文件名后缀为".dcm"。
对于将dicom三维图像转换为三维重建VTK的输入格式,可以使用以下Python代码:
```python
import SimpleITK as sitk
import vtk
# 读取dicom文件
reader = vtk.vtkDICOMImageReader()
reader.SetDirectoryName('example.dcm')
reader.Update()
# 将dicom三维图像转换为VTK格式
sitk_img = sitk.ReadImage('example.dcm')
vtk_img = sitk.Cast(sitk_img, sitk.sitkUInt8)
vtk_img = sitk.GetArrayFromImage(vtk_img)
vtk_img = vtk.vtkImageData()
vtk_img.SetDimensions(sitk_img.GetSize()[::-1])
vtk_img.SetSpacing(sitk_img.GetSpacing()[::-1])
vtk_img.SetOrigin(sitk_img.GetOrigin()[::-1])
vtk_img.GetPointData().SetScalars(vtk.vtkDataArray.CreateDataArray(vtk.VTK_UNSIGNED_CHAR, array=vtk_img.ravel(), numComponents=1))
# 保存VTK格式的三维图像数据
writer = vtk.vtkXMLImageDataWriter()
writer.SetFileName('example.vti')
writer.SetInputData(vtk_img)
writer.Write()
```
上述代码使用了VTK库和SimpleITK库,可以从dicom文件中读取三维图像数据,并将其转换为VTK格式。需要注意的是,VTK格式需要指定文件名后缀为".vti"。
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