MCMC采样,用MMH算法的MATLAB代码

时间: 2023-12-22 07:02:23 浏览: 37
下面是一个基于Matlab的MCMC采样,使用了MMH算法的示例代码。以高斯分布为例: ```matlab % 目标分布函数 target_pdf = @(x) exp(-x.^2/2)/sqrt(2*pi); % MCMC算法参数 n_samples = 1e5; % 采样数量 n_burnin = 1e4; % 燃烧期数量 thin_step = 5; % 间隔抽样步长 % 初始状态 x0 = 0; % MCMC算法参数初始化 x = x0; samples = zeros(n_samples, 1); accept_count = 0; % 进行MCMC采样 for i = 1:(n_samples + n_burnin) % 随机游走 x_proposed = normrnd(x, 1); % 计算接受率 alpha = min(1, target_pdf(x_proposed)/target_pdf(x)); % 计算比例项 t_proposed = normpdf(x, x_proposed, 1); t = normpdf(x_proposed, x, 1); beta = t_proposed/t; % 计算总接受率 alpha = alpha * beta; % 判断是否接受 if rand < alpha x = x_proposed; accept_count = accept_count + 1; end % 记录样本 if i > n_burnin && mod(i-n_burnin-1, thin_step) == 0 samples((i-n_burnin-1)/thin_step+1) = x; end end % 计算接受率 accept_rate = accept_count / (n_samples + n_burnin); % 绘制样本分布 figure; histogram(samples, 'Normalization', 'pdf'); hold on; x = linspace(-5, 5, 1000); y = target_pdf(x); plot(x, y, 'r-', 'LineWidth', 2); xlabel('x'); ylabel('p(x)'); title(sprintf('Accept rate: %.2f%%', accept_rate*100)); ``` 在这个示例中,我们使用了高斯分布作为目标分布函数。根据MMH算法,我们需要计算接受率和比例项。在代码中,我们使用了normrnd和normpdf函数来进行随机游走和概率密度计算。需要注意的是,在实际应用中,需要根据采样的目标分布函数进行相应的参数设置和计算。

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