mutate(cancer_allcanc = case_when( !is.na(cancer_type_total) & cancer_time_total < "2020-12-31" ~ 1, TRUE ~ 0),

时间: 2024-04-24 09:22:10 浏览: 141
这是一段 R 语言的代码,它的功能是给一个数据集中的变量 cancer_allcanc 赋值,这个变量的值取决于数据集中的两个其他变量 cancer_type_total 和 cancer_time_total 的取值。如果 cancer_type_total 不是缺失值,且 cancer_time_total 小于 "2020-12-31",则 cancer_allcanc 被赋值为 1,否则被赋值为 0。这段代码使用了 case_when 函数,它类似于 switch 语句,根据条件的不同来选择不同的赋值操作。
相关问题

lung_time = case_when( cancer_lung == 1 ~ as.character(cancer_time_total), cancer_lung == 0 ~ as.character(dead))) %>% mutate(lung_time = replace_na(lung_time, "2020-12-31")) %>% as_tibble() %>% mutate(lung_time = as.Date(lung_time), lung_time = ymd(lung_time)) %>% mutate(lung_time = case_when( lung_time > "2020-12-31" ~ "2020-12-31", TRUE ~ as.character(lung_time))) %>% mutate(lung_time = as.Date(lung_time), lung_time = ymd(lung_time)) %>%

这是一个 R 语言中的代码片段,它首先根据肺癌的状态(cancer_lung)来确定肺癌患者的存活时间(cancer_time_total)或死亡时间(dead),然后将其转换为字符型变量并用 "2020-12-31" 替换缺失值。接下来,将字符型变量转换为日期型变量,并将其限制在 "2020-12-31" 之前的时间范围内。最后,将日期型变量再次转换为字符型变量并存储在变量 lung_time 中。

帮我优化这段代码map_dfr(files,~read_excel(.x) %>% mutate(lab=.x))%>%mutate( 长度1=as.numeric(长度1),长度2=as.numeric(长度2),长度3=as.numeric(长度3), 长度4=as.numeric(长度4),长度5=as.numeric(长度5),长度6=as.numeric(长度6))%>% mutate(长度1=case_when(is.na(长度1)~0, TRUE~长度1),长度2=case_when(is.na(长度2)~0, TRUE~长度2),长度3=case_when(is.na(长度3)~0, TRUE~长度3), 长度4=case_when(is.na(长度4)~0, TRUE~长度4),长度5=case_when(is.na(长度5)~0, TRUE~长度5),长度6=case_when(is.na(长度6)~0, TRUE~长度6))%>% mutate(total=长度1+长度2+长度3+长度4+长度5+长度6)%>% mutate(result=case_when(total < 100~ "<100", total >=100&total<200 ~"100~200", total>=200&total<300~"200~300", total>=300&total<400~"300~400", total>=400&total<500~"400~500", total>=500&total<1000~"500~1000", total>=1000&total<5000~"1000~5000")) %>% count(result) %>% write.csv(.,"室内长度.csv")

这段代码有一些可以优化的地方,可以尝试以下几个方面进行优化: 1. 使用lapply代替map_dfr 2. 使用summarize代替mutate + count 3. 使用cut代替case_when 优化后的代码如下: ``` library(readxl) library(dplyr) files <- list.files(pattern = ".xlsx") df_list <- lapply(files, function(x) { read_excel(x) %>% mutate(lab = x) %>% mutate_at(vars(starts_with("长度")), ~ifelse(is.na(.), 0, as.numeric(.))) }) df <- bind_rows(df_list) df %>% mutate(total = rowSums(select(., starts_with("长度")))) %>% summarize(n = n(), result = cut(total, breaks = c(-Inf, 100, 200, 300, 400, 500, 1000, 5000), labels = c("<100", "100~200", "200~300", "300~400", "400~500", "500~1000", "1000~5000"))) %>% group_by(result) %>% summarize(count = n()) %>% write.csv("室内长度.csv", row.names = FALSE) ``` 这样做的好处是: 1. 使用lapply可以避免重复调用map_dfr造成的性能损失 2. 使用summarize代替mutate + count可以简化代码并提升性能 3. 使用cut可以简化case_when语句,并且更加灵活。同时我们还使用了group_by和summarize来完成数据的汇总,避免了使用count造成的性能损失。
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帮我修改以下代码,使它可以正确运行:library(tidyr)# 1. 数据处理gss_cat %>% filter(!is.na(age)) %>% mutate(age_group = case_when( age <= 45 ~ "youth", age >= 46 & age <= 69 ~ "middle_aged", age >= 70 ~ "old_people" )) %>% mutate(age_group = fct_relevel(as.factor(age_group), "youth", "middle_aged", "old_people")) %>% group_by(year, age_group, race) %>% summarise(n = n()) %>% # 2. 数据转换 pivot_wider(names_from = age_group, values_from = n) %>% mutate(youth_prop = youth / (youth + middle_aged + old_people)) %>% pivot_longer(cols = youth_prop, names_to = "age_group", values_to = "prop") %>% separate(age_group, into = c("age_group", "prop_type"), sep = "_") %>% pivot_wider(names_from = prop_type, values_from = prop) %>% arrange(year, race, age_group)library(ggplot2)# 1. 数据处理gss_cat %>% filter(!is.na(age)) %>% mutate(age_group = case_when( age <= 45 ~ "youth", age >= 46 & age <= 69 ~ "middle_aged", age >= 70 ~ "old_people" )) %>% mutate(age_group = fct_relevel(as.factor(age_group), "youth", "middle_aged", "old_people")) %>% group_by(year, age_group, race) %>% summarise(n = n()) %>% pivot_wider(names_from = age_group, values_from = n) %>% mutate(youth_prop = youth / (youth + middle_aged + old_people)) %>% pivot_longer(cols = youth_prop, names_to = "age_group", values_to = "prop") %>% separate(age_group, into = c("age_group", "prop_type"), sep = "_") %>% pivot_wider(names_from = prop_type, values_from = prop) %>% # 2. 绘图 ggplot(aes(x = year, y = youth_prop, group = race, color = race)) + geom_line() + labs(x = "年份", y = "青年人比例", title = "不同种族青年人比例随时间变化趋势") + theme_minimal()

import deap import random from deap import base, creator, tools, algorithms import numpy as np import pandas as pd # 参数 stations = 30 start_end_stations = [1, 2, 5, 8, 10, 14, 17, 18, 21, 22, 25, 26, 27, 30] min_interval = 108 min_stopping_time = 20 max_stopping_time = 120 passengers_per_train = 1860 min_small_loop_stations = 3 max_small_loop_stations = 24 average_boarding_time = 0.04 # 使用 ExcelFile ,通过将 xls 或者 xlsx 路径传入,生成一个实例 stations_kilo1 = pd.read_excel(r'D:\桌面\附件2:区间运行时间(1).xlsx', sheet_name="Sheet1") stations_kilo2 = pd.read_excel(r'D:\桌面\附件3:OD客流数据(1).xlsx', sheet_name="Sheet1") stations_kilo3 = pd.read_excel(r'D:\桌面\附件4:断面客流数据.xlsx', sheet_name="Sheet1") print(stations_kilo1) print(stations_kilo2) print(stations_kilo3) # 适应度函数 def fitness_function(individual): big_loop_trains, small_loop_trains, small_loop_start, small_loop_end = individual small_loop_length = small_loop_end - small_loop_start if small_loop_length < min_small_loop_stations or small_loop_length > max_small_loop_stations: return 1e9, cost = (big_loop_trains + small_loop_trains) * (stations - 1) * min_interval + average_boarding_time * passengers_per_train * (big_loop_trains + small_loop_trains) return cost, # 创建适应度和个体类 creator.create("FitnessMin", base.Fitness, weights=(-1.0,)) creator.create("Individual", list, fitness=creator.FitnessMin) # 注册初始化函数 toolbox = base.Toolbox() toolbox.register("big_loop_trains", random.randint, 1, 10) toolbox.register("small_loop_trains", random.randint, 1, 10) toolbox.register("small_loop_start", random.choice, start_end_stations) toolbox.register("small_loop_end", random.choice, start_end_stations) toolbox.register("individual", tools.initCycle, creator.Individual, (toolbox.big_loop_trains, toolbox.small_loop_trains, toolbox.small_loop_start, toolbox.small_loop_end), n=1) toolbox.register("population", tools.initRepeat, list, toolbox.individual) # 注册遗传算法操作 toolbox.register("mate", tools.cxTwoPoint) toolbox.register("mutate", tools.mutUniformInt, low=[1, 1, min(start_end_stations), min(start_end_stations)], up=[10, 10, max(start_end_stations), max(start_end_stations)], indpb=0.5) toolbox.register("select", tools.selBest) toolbox.register("evaluate", fitness_function) # 设置遗传算法参数 population_size = 100 crossover_probability = 0.8 mutation_probability = 0.2 num_generations = 100 # 初始化种群 population = toolbox.population(n=population_size) # 进化 for gen in range(num_generations): offspring = algorithms.varAnd(population, toolbox, cxpb=crossover_probability, mutpb=mutation_probability) fits = toolbox.map(toolbox.evaluate, offspring) for fit, ind in zip(fits, offspring): ind.fitness.values = fit population = toolbox.select(offspring, k=len(population)) # 找到最佳个体 best_individual = tools.selBest(population, k=1)[0] # 解码最佳个体 big_loop_trains, small_loop_trains, small_loop_start, small_loop_end = best_individual # 输出结果 print("Big Loop Trains:", big_loop_trains) print("Small Loop Trains:", small_loop_trains) print("Small Loop Start Station:", small_loop_start) print("Small Loop End Station:", small_loop_end)分析代码

如何在下面的代码中给nv值限制在nu <= 0 or nu > 1:from sklearn.svm import OneClassSVM from sklearn.model_selection import train_test_split import numpy as np from deap import creator, base, tools, algorithms # 创建OneClassSVM分类器 clf = OneClassSVM() # 定义优化目标,这里使用评估分类器的准确率 creator.create("FitnessMax", base.Fitness, weights=(1.0,)) creator.create("Individual", list, fitness=creator.FitnessMax) # 定义一些算法参数 POPULATION_SIZE = 10 P_CROSSOVER = 0.9 P_MUTATION = 0.1 MAX_GENERATIONS = 50 HALL_OF_FAME_SIZE = 3 N_PARAMETER = 4 MIN_PARAM = 0.01 MAX_PARAM = 10.0 # 定义适应度评价函数,使用交叉验证计算准确率 def evaluate(individual): clf.set_params(kernel='rbf', gamma=individual[0], nu=individual[1]) accuracy = 0 for i in range(5): X_train, X_test = train_test_split(X_TRAIN, test_size=0.2) clf.fit(X_train) accuracy += clf.score(X_test) return accuracy / 5, # 定义遗传算法工具箱 toolbox = base.Toolbox() toolbox.register("attr_float", lambda: np.random.uniform(MIN_PARAM, MAX_PARAM)) toolbox.register("individual", tools.initRepeat, creator.Individual, toolbox.attr_float, n=N_PARAMETER) toolbox.register("population", tools.initRepeat, list, toolbox.individual) toolbox.register("evaluate", evaluate) toolbox.register("mate", tools.cxBlend, alpha=0.5) toolbox.register("mutate", tools.mutGaussian, mu=0, sigma=1, indpb=0.1) toolbox.register("select", tools.selTournament, tournsize=3) # 定义精英机制 hall_of_fame = tools.HallOfFame(HALL_OF_FAME_SIZE) # 运行遗传算法 population = toolbox.population(n=POPULATION_SIZE) stats = tools.Statistics(lambda ind: ind.fitness.values) stats.register("avg", np.mean) stats.register("min", np.min) stats.register("max", np.max) population, logbook = algorithms.eaSimple(population, toolbox, cxpb=P_CROSSOVER, mutpb=P_MUTATION, ngen=MAX_GENERATIONS, stats=stats, halloffame=hall_of_fame) # 输出优化结果 best_individual = tools.selBest(population, k=1)[0] best_parameters = [] for param in best_individual: best_parameters.append(round(param, 2)) print("OneClassSVM params: gamma={}, nu={}".format(*best_parameters))

解析如下代码:from sklearn.svm import OneClassSVM from sklearn.model_selection import train_test_split import numpy as np from deap import creator, base, tools, algorithms # 生成随机数据作为样本 X = np.random.rand(100, 5) # 创建OneClassSVM分类器 clf = OneClassSVM() # 定义优化目标,这里使用评估分类器的准确率 creator.create("FitnessMax", base.Fitness, weights=(1.0,)) creator.create("Individual", list, fitness=creator.FitnessMax) # 定义一些算法参数 POPULATION_SIZE = 10 P_CROSSOVER = 0.9 P_MUTATION = 0.1 MAX_GENERATIONS = 50 HALL_OF_FAME_SIZE = 3 N_PARAMETER = 4 MIN_PARAM = 0.01 MAX_PARAM = 10.0 # 定义适应度评价函数,使用交叉验证计算准确率 def evaluate(individual): clf.set_params(kernel='rbf', gamma=individual[0], nu=individual[1]) accuracy = 0 for i in range(5): X_train, X_test = train_test_split(X, test_size=0.3) clf.fit(X_train) accuracy += clf.score(X_test) return accuracy / 5, # 定义遗传算法工具箱 toolbox = base.Toolbox() toolbox.register("attr_float", lambda: np.random.uniform(MIN_PARAM, MAX_PARAM)) toolbox.register("individual", tools.initRepeat, creator.Individual, toolbox.attr_float, n=N_PARAMETER) toolbox.register("population", tools.initRepeat, list, toolbox.individual) toolbox.register("evaluate", evaluate) toolbox.register("mate", tools.cxBlend, alpha=0.5) toolbox.register("mutate", tools.mutGaussian, mu=0, sigma=1, indpb=0.1) toolbox.register("select", tools.selTournament, tournsize=3) # 定义精英机制 hall_of_fame = tools.HallOfFame(HALL_OF_FAME_SIZE) # 运行遗传算法 population = toolbox.population(n=POPULATION_SIZE) stats = tools.Statistics(lambda ind: ind.fitness.values) stats.register("avg", np.mean) stats.register("min", np.min) stats.register("max", np.max) population, logbook = algorithms.eaSimple(population, toolbox, cxpb=P_CROSSOVER, mutpb=P_MUTATION, ngen=MAX_GENERATIONS, stats=stats, halloffame=hall_of_fame) # 输出优化结果 best_individual = tools.selBest(population, k=1)[0] best_parameters = [] for param in best_individual: best_parameters.append(round(param, 2)) print("OneClassSVM params: gamma={}, nu={}".format(*best_parameters))

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