Error in DESeqDataSetFromMatrix(countData = countdata, colData = coldata, : 不是所有的ncol(countData) == nrow(colData)都是TRUE
时间: 2024-03-04 19:51:49 浏览: 1585
matlab特殊符号代码-frame:一个继承自data.frame的类,默认为'drop=FALSE',一个'end'关键字,'all'的0
这个错误通常是由于countData和colData的行数不匹配导致的。请确保countData和colData的行数相同,即每一行的观测值都对应于colData中的一行数据。您可以使用nrow()函数和ncol()函数来检查countData和colData的行数和列数。在调用DESeqDataSetFromMatrix时,还需要确保countData和colData中的样本顺序相同。如果问题仍然存在,请检查输入数据是否正确,并尝试重新构建DESeqDataSet对象。另外,您还可以查看DESeq2包的文档,以获取更多有关如何构建DESeqDataSet对象的信息。
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