dds<- DESeqDataSetFromMatrix(countData = ABC, colData=colData, design=~dex) Error in DESeqDataSetFromMatrix(countData = ABC, colData = colData, design = ~dex) : 不是所有的ncol(countData) == nrow(colData)都是TRUE
时间: 2024-04-11 21:28:45 浏览: 504
自动化毕业论文-范本=基于ad9851的dds信号源发生器.doc
根据你提供的代码,出现了一个错误。错误信息是"不是所有的ncol(countData) == nrow(colData)都是TRUE",意味着 `countData` 和 `colData` 的维度不匹配。
在使用 `DESeqDataSetFromMatrix()` 函数时,需要确保输入的 `countData` 矩阵的列数与 `colData` 数据框的行数相匹配。
要解决这个问题,你可以检查 `countData` 和 `colData` 的维度,并确保它们相匹配。以下是一个示例代码:
```R
# 检查 countData 和 colData 的维度
if (ncol(ABC) == nrow(colData)) {
# 创建 DESeqDataSet 对象
dds <- DESeqDataSetFromMatrix(countData = ABC, colData = colData, design = ~ dex)
} else {
# 处理维度不匹配的情况
# ...
}
```
请确保在示例代码中,`ABC` 是一个正确的 count 数据矩阵,并且 `colData` 是一个匹配的数据框。如果还有其他问题,请随时提问。
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