library(DESeq2) colData <- data.frame( group = c("Sample1_FPKM", "Sample2_FPKM", "Sample3_FPKM", "Sample4_FPKM","Sample5_FPKM","Sample6_FPKM"), condition = c("fpkm", "fpkm", "fpkm", "fpkm","fpkm","fpkm")) dds <- DESeqDataSet(counts=ABC_1,colData=colData,design=~group)Error in DESeqDataSet(counts = ABC_1, colData = colData, design = ~group) : unused arguments (counts = ABC_1, colData = colData)

根据你提供的代码和错误信息，看起来你在调用DESeqDataSet函数时遇到了问题。

DESeqDataSet函数不接受直接传递counts和colData参数。相反，你需要先创建一个countData对象，然后将其与colData一起传递给DESeqDataSetFromMatrix函数。

请尝试以下代码：

library(DESeq2)

# 创建countData对象
countData <- ABC_1  # 假设ABC_1是你的浮点数型的countData

# 创建colData对象
colData <- data.frame(
  group = c("Sample1_FPKM", "Sample2_FPKM", "Sample3_FPKM", "Sample4_FPKM","Sample5_FPKM","Sample6_FPKM"),
  condition = c("fpkm", "fpkm", "fpkm", "fpkm","fpkm","fpkm")
)

# 创建DESeqDataSet对象
dds <- DESeqDataSetFromMatrix(countData = countData, colData = colData, design = ~ group)

# 进行差异表达分析
dds <- DESeq(dds)

这样，你应该能够成功创建DESeqDataSet对象并进行差异表达分析。

如果仍然遇到问题，请提供更多的代码和错误信息，以便我可以更好地帮助你。