library(DESeq2) dds <- DESeqDataSetFromMatrix(countData=ABC_1,colData=group,design=~dex)Error in DESeqDataSet(se, design = design, ignoreRank) : some values in assay are not integers

根据错误信息，DESeq2函数中的countData参数要求输入的数据为整数类型。根据你提供的错误信息，可以推断你的ABC_1数据框中包含了非整数的数据。

为了解决这个问题，你可以将ABC_1数据框中的数据转换为整数类型。你可以使用`as.integer()`函数将数据转换为整数。请注意，转换前应确保数据不包含缺失值或其他非数值的值。

以下是可能的解决方案：

ABC_1 <- as.data.frame(sapply(ABC_1, as.integer))
dds <- DESeqDataSetFromMatrix(countData = ABC_1, colData = group, design = ~dex)

在这里，我们使用`sapply()`函数将ABC_1数据框中的每一列都转换为整数类型，并将结果重新赋值给ABC_1数据框。然后，我们再次尝试使用DESeqDataSetFromMatrix函数创建dds对象。

如果你的数据包含缺失值或其他非数值的值，你可能需要在转换之前对数据进行预处理，例如填充缺失值或删除非数值的行。

希望这能帮到你！如果还有其他问题，请随时提问。

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dds <- DESeqDataSetFromMatrix(countData=ABC_1,colData=group,design=~1) Error in DESeqDataSet(se, design = design, ignoreRank) : some values in assay are not integers

这个错误提示表明在你的countData中存在非整数的值，而DESeq2要求输入的countData必须是整数型的。

要解决这个问题，你需要将countData中的非整数值转换为整数。你可以使用round函数将浮点数四舍五入为最接近的整数。例如，假设你的countData是一个数据框，你可以使用以下代码将其中的浮点数转换为整数：

ABC_1 <- round(ABC_1)

然后，将转换后的整数型的countData输入到DESeqDataSetFromMatrix函数中进行分析：

dds <- DESeqDataSetFromMatrix(countData = ABC_1, colData = group, design = ~1)

这样，你应该可以成功创建DESeq2的数据集对象。

如果还有其他问题，请随时提问。

dds <- DESeqDataSetFromMatrix(countData=ABC,colData=group,design=~dex) Error in DESeqDataSet(se, design = design, ignoreRank) : some values in assay are not integers

这个错误是因为在使用DESeq2的DESeqDataSetFromMatrix函数时，输入的countData必须是整数型的。根据错误提示，你的countData中可能包含了非整数的值。

要解决这个问题，你可以使用round函数将countData中的值舍入为整数。请尝试以下代码：

ABC <- round(ABC)
dds <- DESeqDataSetFromMatrix(countData = ABC, colData = group, design = ~dex)

这样，你将会将ABC中的数值舍入为整数，并将其作为整数型的countData输入到DESeqDataSetFromMatrix函数中。

如果你的countData本身就是整数型的，那么可能是其他原因导致了这个错误。在这种情况下，请检查你的数据是否符合DESeq2的要求，并确保输入的参数正确。

如果还有其他问题，请随时提问。