北京计算科学研究中心集群系统用户手册

"集群系统用户手册 - 北京计算科学研究中心" 本手册详细介绍了北京计算科学研究中心的集群系统，主要用于高性能计算（HPC）任务。系统由多个组件构成，包括登录节点、计算节点、互连系统，以及各种编译环境。以下是手册的主要内容： 1. **硬件环境** - **登录节点**：是用户接入集群的入口，IP地址为XX.XX.XX.XX，主机名为master。登录节点配备了2颗Intel Xeon 5650 6核CPU，12M缓存，6.4 GT/s QPI，支持Turbo和HT技术，以及6C/24GB内存和40Gb QDR Infiniband卡。 - **计算节点**：包括64个CPU节点和4个GPU节点。CPU节点配置为2颗相同型号的Intel Xeon 5650 CPU，内存和硬盘配置未详细列出。GPU节点则额外配备2块Nvidia Tesla M2070 GPU加速卡。 - **互连系统**：所有节点通过40Gbps Infiniband QDR高速网络连接，提供高效的数据传输。 2. **系统环境** 系统环境未详细说明，通常包括操作系统、系统软件和服务等。 3. **编译环境** - **Intel编译器**：用于优化基于Intel架构的应用程序，提高性能。 - **gcc编译器**：开源的GNU编译器集合，支持多种编程语言。 - **mpi编译环境**：用于并行计算，如OpenMPI或MPICH，实现多处理器间的通信。 - **CUDA编译环境**：NVIDIA提供的工具，用于编写和编译利用GPU进行计算的CUDA程序。 4. **系统使用方式** - **基本条件**：用户需了解如何登录、设置环境变量、修改账户密码等基础操作。 - **文件传输**：可能涉及SCP、FTP或其他文件传输协议来在本地与集群间移动文件。 - **环境变量设置**：对PATH、LD_LIBRARY_PATH等环境变量的调整，影响程序执行。 - **用户帐号密码修改**：用户应知道如何安全地更改自己的账户信息。 - **退出系统**：正确地退出集群以释放资源。 5. **作业提交** - **使用限制**：可能有CPU时间、内存使用等方面的限制，用户需遵守。 - **状态查看命令**：通过特定命令监控作业状态，例如`qstat`或`squeue`。 6. **Cluster应用软件** 未具体说明，通常涉及数值模拟、数据分析等HPC相关软件。 7. **附录** 提供了常用Unix命令、vi编辑器命令和GDB调试命令的参考，帮助用户更好地在集群环境中工作。 这个手册是用户有效利用集群资源的关键指南，涵盖了从硬件配置到软件使用的所有重要方面，对于需要在高性能计算环境下工作的科研人员和工程师非常有价值。