果蝇双氧化酶（DuoX）对抗菌肽炎症微生物组的调节：分子动力学研究

医学信息学解锁27（2021）100811植物诱导子对果蝇双氧化酶（DuoX）结构的调控：自由能的分子动力学研究[10]杨晓波，李晓波，李晓波. More a，Vivek Chandramohan b，**，Farhan Zameera，*aPathoGutomics Laboratory，School of Basic and Applied Sciences，Department of Biological Sciences（Biochemistry），Dayananda Sagar University，Sampuge Malleshwara Hills，Kumaraswamy Layout，Bengalu，560 111，Karnataka，Indiab印度卡纳塔克邦图马库鲁Siddaganga理工学院生物技术系，邮编：572 103A R T I C L EI N FO保留字：DuoXImd OXidants抗菌肽炎症微生物组泄漏的肠道GROMACS神经退行性疾病A B S T R A C T肠道作为一种范式被认为是第二大脑，在维持健康的新陈代谢方面发挥着关键作用，并在微观和宏观层面上对生态失调进行负面调节。肠道免疫屏障负责调节从炎症、T细胞亚群（Th1、Th2、Th17、Tcl4）、趋化性和趋化运动到死亡的主要免疫中心。氧化应激被确定为漏肠障碍的主要原因。此外，双氧化酶（DuoX）途径在宿主细菌代谢物攻击期间的氧化剂生成中起着重要作用。目前的研究试图探索从香蕉植物（香蕉变种）中再利用植物生物活性物质的可能性。Nanjangud Rasa Bale）作为Duo X抑制剂，使用黑腹果蝇（Drosophila melanogaster）作为人类仿生学的模型系统。作为我们先前研究的结果，在果蝇模型中，公认的抗糖尿病配体参与治疗糖尿病神经病变。对DUOX-STI、DUOX-BST、DUOX-LUP和Duox-UMB的复合物进行分子对接，用DUOX-CAPTOPRIL（CAP）作为标准药物参照物进行模拟.结果阐明了植物配体的抑制效力与它们的分子间相互作用。发现UMB作为双氧化酶的抑制剂非常有前途。这项研究通过提供植物生物活性物质有效性的证据证实了免疫缺陷（Imd）途径的发现。此外，该研究的推论强调将果蝇视为探索肠道相关疾病的治疗研究模型，包括微生物组研究，以改善免疫力，糖尿病和糖尿病神经病变，或任何可能导致更智能草药设计和开发的生活方式代谢紊乱。1. 介绍炎症和微生物生态失调调节肠道免疫轴。以前，许多体内模型（脊椎动物和无脊椎动物）被认为是了解肠道微生物相互作用和免疫机制。果蝇被认为是研究适应性免疫和了解肠道细菌相互作用的经典模型[1，2]。由于其基因组小且易于操作，黑腹果蝇是广泛探索、优选和接受的模型。虽然它缺乏适应性免疫，先天免疫发育良好，细菌肽聚糖识别，然后通过调味品表达抗菌肽[5]。此外，DuoX负责生成氧化剂以维持肠道对细菌的稳态[4]。Imd和DuoX在维持健康肠道方面相互补充[6]。双氧化酶（DuoX）是一种烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸（NADPH）氧化酶，存在于肠道中，主要负责在肠道微生物相互作用期间产生活性氧物质（ROS）[7]。ROS尤其是过氧化氢（H2O2）在维持REDOX比率[8-10 ]和肠道微生物稳态[ 11 ]中起重要作用此外，DuoX途径有两个组成部分;一个作用于表达途径，另一个作用于活化途径。由免疫缺陷（Imd）和双氧化酶（DuoX）控制的表达途径涉及激活的p38经由肠道中的Imd途径 [3，4]Imd途径因其革兰氏阴性分裂原 蛋白 （地图） 激酶 途径 [12 ]第10段。 此外，本发明还* 通讯作者。PathoGutomics实验室，基础和应用科学学院，生物科学系，Dayananda Sagar大学，Sundarge Malleshwara Hills，Kumaraswamy Layout，Bengalu，560 111，卡纳塔克邦，印度。** 通讯作者。电子邮件地址：vivek@sit.ac.in（V. Chandramohan）、farhanzameeruom@gmail.com、farhanzameer@dsu.edu.in（F.Zameer）。https://doi.org/10.1016/j.imu.2021.100811接收日期：2021年7月28日;接收日期：2021年11月30日;接受日期：2021年2021年12月2日在线发布2352-9148/© 2021由Elsevier Ltd.发布这是一篇基于CC BY-NC-ND许可证的开放获取文章（http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/）。可在ScienceDirect上获得目录列表医学信息学期刊主页：www.elsevier.com/locate/imuP. Satapathy et al.医学信息学解锁27（2021）1008112++缩写DuoX-CAP双氧化酶与卡托普利对接DuoX-BST双氧化酶与β-谷甾醇对接DuoX-STI双氧化酶与豆甾醇对接DuoX-LUP双氧化酶与羽扇豆醇DuoX-UMB 双氧化酶对接伞形酮CHARMM化学在哈佛大学高分子力学DSGROMACS GROningen化学模拟机DuoX Dual oxidaseMD分子动力学Discovery StudioMMPBSA分子力学泊松-玻尔兹曼表面积NSRG纳秒RMSD均方根偏差RMSF均方根波动SASA溶剂可溶解表面积回转半径激活的p38磷酸化转录因子2（ATF2），其作为Duox基因的初级转录因子。此外，由病原体分泌的非肽聚糖分子如尿嘧啶对DUOX途径活化起作用[13，14]。此外，这种激活通过磷脂酶C触发钙离子的流动，并使DuoX发生必要的构象变化以产生H2O2.除此之外，氯化物的存在将H2O2转化为次氯酸（HOCl），次氯酸是一种有效的抗菌剂[15]，可激活环氧化酶（COX）和脂氧合酶（LOX）炎症通路[16，17]。应激诱导的免疫受损状况导致各种生活方式障碍，如糖尿病，其进一步导致继发性并发症，即感染性心内膜炎、癌症、神经病等[18根据先前对糖尿病的研究[22，23]，植物衍生的分子，即豆甾醇（STI）、β-谷甾醇（BST）、羽扇豆醇（LUP）和伞形酮（UMB）已显示出抗氧化剂、抗糖尿病特性。此外，可以使用更高的体外和体内模型研究植物分子在糖尿病神经病变改善中的作用，或者可以将其转化为植物纳米制剂以获得更好的生物利用度和吸收[24本研究旨在探讨这些植物源性配体通过免疫抑制抑制双氧化酶改善糖尿病神经病变的可能作用。天然衍生的配体如β-谷甾醇（BST）、豆甾醇（STI）、羽扇豆醇（LUP）和伞形酮（UMB）用于研究，卡托普利（CAP）[27]作为治疗常用的标准药物。此外，BST STI [22]以及LUP UMB [28]的作用具有经证实的抗糖尿病功效[29]。&&我们假设，筛选最佳的植物配体，DuoX蛋白质靶点，用于更好地了解分子水平上配体-受体相互作用的自由能和动力学。目前，对DuoX-STI、DuoX-BST、DuoX-LUP、DuoX- UMB和DuoX-CAP进行了虚拟研究，以研究植物配体与DuoX之间的相互作用。使用同源建模构建和设计三维（3D）构象，并且其已经以登录号（DOI：10.5452/ma-44 qeu）保藏在Model Archive（Swiss Institute ofBioinformatics，UniversityofBasel）。所得的3D结构用于分子动力学（MD）模拟，以评估其与植物诱导剂的相互作用。2. 材料和方法2.1. 配体和蛋白质结构制备DuoX缺乏晶体结构，因此我们通过同源建模，然后通过能量最小化来设计假设结构。从ID为Q9VQH2的主要UniProt数据库中提取查询蛋白，建模程序描述此外，为了制备616个氨基酸的酶，使用名为Discovery studio 3.5的软件（Alfreys Software，Inc.，San Diego，CA，USA）。所获得的结构在研究期间用作脱辅基蛋白。此外，对于蛋白质的力场优化，使用CHARMM（哈佛大分子力学化学）[30]。为了最小化结构能量，使用了智能最小化算法[31因此，将所得结构用于对接研究。此外，目前研究考虑的配体包括主要存在于香蕉植物中的从PubChem数据库中检索3D构象，即β-谷甾醇（PubChem ID：222284）、豆甾醇（ PubChem ID ： 5280794 ） 、 羽 扇 豆 醇 （ PubChem ID ：4259846）、伞形酮（PubChem ID：5281426）和标准药物卡托普利（PubChem ID：44093）。对具有稳定构象的分子进行了分析，其特征在于低能量和高手性。为了优化分子，使用Discovery studio包中早期报告的参数[34]。此外，CHARMM力场（Cambridge，MA，USA）[31，32]算法用于智能最小化。在配体和蛋白质制备后进行分子对接，定量[35，36]。该方法确定具有适合活性位点的最佳能量和几何形状的配体[37此外，MD模拟确定了一定环境范围内的分子间相互作用和重排[40在我们的研究中，使用C-Docker软件对蛋白质DuoX以及基于植物的天然和标准抑制剂进行分子对接[43，44]。受体网格是基于先前的实验创建的[45使用GROMOS 53 A6力场[48-50 ]模拟包对DuoX（i）DuoX与卡托普利（CAP）连接，（ii）DuoX与β-谷甾醇（BST）连接，（iii）DuoX与豆甾醇（STI）连接，（iv）DuoX与羽扇豆醇（LUP）连接，（v）DuoX为了模拟每个氨基酸的质子化状态，在pH 6.5下使用H2S [54，55]。此外，自动拓扑生成器（ATB）存储库用于选择电阻器/基板力场。通过使用前面解释的方法，网格被制作[56，57]。3. 数据分析模拟后，使用GROMACS软件包[58，59]。RMSD（均方根偏差）和L-RMSD分析碳骨架偏差，RMSF（均方根波动）评价C-α偏差Rg。（回转半径）和SASA（溶剂可及表面积）证实了计算。gromacs“gm x rms”、“gm x rmsf”、“gm x gyrate”和“gm x sasa“的实用程序分别有助于计算。此外，还利用了RMSD和L-RMSD的轨迹数据 用于分析对于络合物稳定性，RMSF、Rg.曾被人认为是。对于数据生成，考虑了整个100 ns运行的10 ns分叉。此外，对于可视化VMD [60]和PyMol软件”[61]他说。Xmgrace工具[62]用于生成所需的图形和绘图。数据生成和分析的简要程序见总结2。3.1. 自由能计算抑制剂与蛋白质的结合自由能（ΔG结合）;我们研究的一个重要方面是实施分子力学泊松-玻尔兹曼表面积（MM-PBSA）方法[63]。此外，使用gromacs g_mmpbsa进行计算[49，64]。蛋白质-配体复合物的自由态和结合态之间的差异决定了自由能。下面提到的公式用于推导结合能。P. Satapathy et al.医学信息学解锁27（2021）1008113---Δ G结合=G复合物4. 结果和讨论用于寻找抑制DuoX的有效药物的技术是分子对接和分子动力学。 并对配合物DuoX-CAP、DuoX-BST、DuoX-STI、DuoX- LUP、DuoX-UMB进行了研究.该研究揭示了下述结果。4.1. 分子对接为进行分子对接，选择了DuoX酶的四种配体和标准品。此外，对这些复合物进行分子对接研究，以通过使用C-Docker算法[44]评价Duo x酶的结合模式（参见图11）。①的人。四种植物来源的分子和一种抑制剂用于分子对接分析。用于分子动力学研究的0ns和100ns对接比较分析。DuoX和配体（CAP、BST、STI、LUP和UMB）之间产生的分子间相互作用分别见表1和表2图2中给出了Duo X与抑制剂和植物衍生分子的对接图像。蛋白质-配体复合物的稳定性包括范德华力、氢键和碳氢相互作用。抑制剂CAP表现出GLN 143的1个新的氢键相互作用。与纯天然分子相比，UMB与MET 373在100ns处表现出较强的氢键相互作用。使用HIS 371、ALA 146和GLN 143观察到CAP和UMB中常见的疏水相互作用。唯一的区别是GLN143，其在CAP中是疏水性的，而在UMB中是氢。在所有的天然化合物中，UMB显示出较好的对接结果相比，其他。在我们之前对细菌PGN（肽聚糖）和果蝇PGRP-LC X（2F 2L）的研究中[ 49 ]，观察到PGN连接到氨基酸残基His365、Thr 366、His 388、Asp 395、Tyr 399、Gly 424、Asn 426、His473、Ser 477和Glu 480，Arg 413作为锚。此外，氨基酸Arg413被证明是PGN的主要附着。此外，UMB与Arg413具有氢键相互作用，表1氨基酸与底物DuoX、标准抑制剂和天然分子在0ns时的相互作用和氢键：具有氢键和参与的疏水残基。（）中的数字表示氢键相互作用的长度和总数。表2氨基酸与底物DuoX、标准抑制剂和天然分子在100 ns下的相互作用和氢键：氢键和参与的疏水残基。（）中的数字表示氢键相互作用的长度和总数。H-H键疏水相互作用的络合物编号键合残基DUOX-CAP1GLN143（1.8）HIS 371、ILE 285、ALA146、ALA364、ARG 368、ARG 278、ASN 147DUOX-0–ARG460、PHE185、GLN 281、ASN147、BSTARG451、MET 263、PHE443、HIS186、PRO277、VAL150DUOX-0–PHE367、TRP403、LEU399、PRO283、STIASN282、PHE140、ALA284DUOX-0–VAL150、ASN464、ARG460、ASN457、LUPLEU442，ARG278，ALA146，ASN147，ALA364、HIS 360DUOX-1MET 373HIS371、GLY370、PHE339、PHE367、UMB（2.2）TYR335、ILE535、ALA146、GLY142、GLN 143图1.一、 靶蛋白结构：双氧化酶。证实了我们的发现因此，这些天然衍生的分子可用于未来的分子动力学模拟工作。氢键的络合数氢键残基疏水作用4.2. MM-PBSA预测DUOX-CAPDUOX-4 ARG278（3.1）(3.2)、ASN147(2.1)、GLN143（3.3）2 ARG368（3.3）ARG368 、 HIS371 、PHE367、 ALA364、 VAL150、GLN363、ALA146、ASN 147SER153为了理解Duo X与其抑制剂的结合效率，我们使用了补充表1中提到的MMPBSA值。在图中，β-谷甾醇（BST）、豆甾醇（STI）、羽扇豆醇（LUP）和伞形酮（UMB）的结合能分别为130.76 kJ/mol、148.59 kJ/mol、123.33 kJ/mol和86.15 kJ/mol;与标准抑制剂卡托普利（CAP）相比，结合能为-71.61kJ/mol。在所有的化合物STIDUOX-LUPTRP403 ， LEU453 ， ILE374 ，GLY142，(2.9)，ALA364（2.1）GLY370，PHE367，GLN 303，ALA146、VAL150、ARG278、ASN147、ALN139、 GLN 143、 HIS3711 GLN 281（3.5）ASN 147，PHE367，ALA 146，GLN 142，GLN 143 ， TRP403 ，LEU442， GLN 281， HIS271，BST和STI显示出更好的结合能，但与标准相比并不剧烈。酶Duo X与抑制剂和天然化合物的复合物的MMPBSA如图所示。3.第三章。4.3. RMSD、Ligand-RMSD、RMSF、Rg. SASA预测配合物在水体系中的稳定性通过DUOX-2PHE367（3.3），ALA 152、MET 151、VAL150、BSTGLY370（1.8）ARG368、ALA384、GLN363、ALA146、GLN 370、HIS371、P. Satapathy et al.医学信息学解锁27（2021）1008114DUOX-UMB2 TYR 335（2.1）、PHE367（3.2）ARG278、ALA364、ARG368MET373、ALA139、GLY370、GLY142 、 GLN143 、PHE367、ALA146、LEU340、PHE339、PHE369使用参数RMSD、配体-RMSD、RMSFs、Rg和SASA。接下来，对与化合物β-谷甾醇、豆甾醇、羽扇豆醇和伞形酮结合的DuoX的复合物进行100ns的模拟，考虑参比药物卡托普利（补充表1）。P. Satapathy et al.医学信息学解锁27（2021）1008115图二. 活性中心口袋在100ns的对接图像：活性中心口袋残基（按原子类型着色）和嵌入化合物被表示在一 棒 形成DuoX-CAP、DuoX-BST，双X-STI，双X-LUP，和双X-UMB。反式-父卡通代表酶的周围部分。氢键距离由黄色虚线表示。(For关于这一图中颜色的解释，请读者参阅本文的网络版。）图三. 结合底物/抑制剂中底物Duo x的平均结合能：Duo X-CAP、Duo X-BST、Duo X-STI、Duo X-LUP和Duo x-UMB的结合能用标准偏差表示.配合物的平均结合能分别为-71.61±5.57、-130.763±14.47、-148.59±18.41、-122.33± 9.12和-86.15± 8.56KJ/mol。尽管最初对接的复杂重排，RMSD是相对稳定的整个模拟。图4表示对接分子与DuoX蛋白的RMSD值。DuoX的RMSD分析表明，在20 ns后达到平衡，在60和70 ns之间有微小的波动。底物/抑制剂BST、STI、LUP、UMB和标准药物Captopril（CAP）在0 ~ 100 ns范围内的平均RSD分别为0.41 nm、0.39 nm、0.42 nm、0.44 nm和0.38 nm。这些RMSD结果代表了分子BST、STI、LUP、UMB和标准药物CAP在整个模拟过程中与DuoX对接的稳定性。此外，所获得的结果确定了在整个模拟过程中的复合物的稳定性，并且在BST和UMB复合物中观察到微小的波动。这一结果预测BST和UMB显示出改变的模拟过程中的结构构象。但由于可忽略性，我们预测与初始结构相比，偏差较小[57]。因此，所有抑制剂与蛋白质一起获得稳定性。配体RMSD对于研究配体与蛋白质的稳定性至关重要。CAP，LUP和UMB被认为是稳定的过程中的模拟，并观察到BST和STI较高的波动。总体而言，波动低于0.2 nm，这是可以忽略的。 标准分子CAP在40ns后稳定。UMB在整个模拟过程中的稳定性质使其成为结合蛋白质的更好配体。通过模拟，蛋白质复合物是稳定的，由于在配体RMSD波动较小。配体-RMSD结果是预-在图中以图形方式表示。 五、RMSF评价Duo x中的区域稳定性，否则，RMSF是一个P. Satapathy et al.医学信息学解锁27（2021）1008116见图4。结合底物/抑制剂中蛋白质（蛋白质RMSD）碳骨架（C α）的波动：结合分子与蛋白质的Duo X-CAP、Duo X-BST、Duo X-STI、Duo X-LUP和Duo X-UMB的改变. 钥匙代表着标记的不同颜色的各种波动。结果总结：复合物的平均RMSD值分别为0.38±0.02，041± 0.01，0.39 ± 0.02，0.39± 0.001，0.01、0.42± 0.01和0.45± 0.01 nm。(For解释关于本图图例中的颜色参考，请读者参阅本文的Web版本。）图五. 结合底物/抑制剂中蛋白质（配体-RMSD）碳骨架（Cα）的波动：DuoX-CAP、DuoX-BST、DuoX-STI、DuoX-LUP和DuoX-UMB结合分子与蛋白质的变化。钥匙代表着不同颜色的标记的各种波动。结果总结：复合物的平均配体-RMSD值分别为0.15± 0.03，0.11± 0.03，0.12±0.04、00.04± 0.01和0.02 nm。(For解释关于本图图例中的颜色参考，请参考本文的Web版本。）参数来计算原子与平均位置的偏差。较高的RMSF表示较高的灵活性，而较低的动态限制。复杂Duo x的RMSF如图所示。 六、 从观察结果看，180、1200、250、1300、1400等5个氨基酸的含量波动较大。在整个研究期间，波动范围在0.30 nm至0.65 nm之间，这是允许的。与动力学受限的区域1030aa相比，区域10180aa、10200aa、10250aa、10400aa和10500aa显示出高的RMSF，表明更高的柔性。在所有区域中，10400aa的区域具有最高的RMSF值意味着所有分子的平均值几乎相似。因此，在整个MD模拟过程中，在任何复合物中均未观察到剧烈变化。这证实了酶活性的稳定性[49，57]。见图6。在结合底物/抑制剂中，与Duox底物结合的天然抑制剂的柔性改变，均 方 根 波 动 （ RMSF ） ： 在 DUOX-CAP 、 Duox-BST 、 DUOX-STI 、 Duox-LUP 和DUOX-UMB结合分子与蛋白质的各种氨基酸残基处的改变.键代表标记的不同颜色中的各种波动。(For关于此图例中颜色的解释，请参考本文的Web版本。）灵活性RG。和SASA的紧凑性齐头并进。为了评估抑制剂对蛋白质的调节，我们计算Rg。和SASA。通过仿真，Rg. 和SASA值在所有复合物中是非常可忽略的。平均Rg。对于图7所示的整个模拟，值在2.35和2.45 nm之间。SASA值范围为250至285 nm2，在Fig. 8.第八条。因此，可以预测天然抑制剂5. 结论高通量的计算机辅助药物发现使得配体和靶点的评估更容易且更具决定性。但见图7。回转半径（Rg.）在结合底物/抑制剂中：在复合物DuoX-CAP、DuoX-BST、DuoX-STI、DuoX-LUP和DuoX-UMB中结合分子与蛋白质的不同时间范围内回转半径的变化。Rg的变化代表不同颜色的各种波动，标记。结果总结：平均Rg.络合物的值为2.43± 0.0010.01、2.39± 0.01、2.42± 0.01、2.40± 0.01和2.41± 0.01 nm，很好(For关于这一图中颜色的解释，请读者参阅本文的网络版P. Satapathy et al.医学信息学解锁27（2021）1008117见图8。结合底物/抑制剂中的溶剂可及表面积（SASA）：与将分子结合至蛋白质的复合物Duox-CAP、DUOX-BST、DUOX-STI、DUOX-LUP和DUOX-UMB 钥匙代表着不同颜色的标记的各种波动。结果总结：复合物的平均SASA值分别为271.94±5.69，263.08± 5.41，260.53 ± 8.93、259.28 ± 6.88和263.73 ± 4.97 nm 2 分别（对于关于这一图中颜色的解释，请读者参阅本文的网络版关于植物生物活性物质（纯草药或制剂）与疾病靶点的生物机制作用的问题仍然没有答案。我们假设肠道是疾病改善的主要靶点，因为它是代谢的主要来源，并外推了我们先前对Imd途径的研究[57]。此外，目前的研究提供了关于双氧化酶及其与Imd受体相互作用的整体证据。该结果确立了植物生物活性物质作为一种更有效的药物的作用。2020附录A. 补充数据本文的补充数据可在https：//doi网站上找到。org/10.1016/j.imu.2021.100811。引用[1] Corby-Harris V，et al.与果蝇自然种群相关的细菌的地理分布和多样性。应用环境微生物学2007;73：3470-9。https://doi.org/10.1128/AEM.02120-06网站。[2] COX CR，et al.果蝇的原生微生物定植及其作为粪肠球菌发病机制模型的用途。Infect Immun 2007;75：1565-76. https://doi.org/10.1128/IAI.01496-06。[3] Liu Y等，Structural and functional analysis of PGRP-LC indicates exclusive Dap-type PGN binding in bumblebees. IntJ Mol Sci 2020;21：2441.https://doi.org/10.3390/ijms21072441。[4] Fujisawa Y，et al. ROS regulate caspase-dependent cell delamination withoutapoptosis in the Drosophila pupal notum. Iscience 2020;23：101413. 网址：//doi. org/10.1016/j.isci.2020.101413。[5] Kleino A，et al. The Drosophila IMD pathway in the activation of the humoralimmune response. Dev Comp Immunol 2014;42：25-35.https://doi.org/10.1016/j的网站。 dci.2013.05.014。[6] Ryu JH，et al.果蝇的先天免疫和肠道微生物互利共生。Dev Comp Immunol2010;34：369-76. https://doi.org/10.1016/j.dci.2009.11.010网站。[7] Bae YS等人，粘膜免疫和宿主微生物体内平衡中的双氧化酶。Trends Immunol2010;31：278-87. https://doi.org/10.1016/j.it.2010.05.003网站。[8] Gopal S，et al. Prediction of proteins pubietin involved in the thiol：disulfideredo Xmetabolism of a bacterium（Listeria）：the CXXC motif as querysequence. Silico Biol 2009;9：407-14. https://doi.org/10.3233/ISB-2009-0409网站。[9] Zameer F ， et al. 单 核 细 胞 增 生 李 斯 特 EGD-e 生 物 膜 模 型 的 建 立 World JMicrobiol Biotechnol 2010;26：1143-7. https://doi.org/10.1007/s11274--0271-4.[10] Zameer F，et al.单核细胞增生李斯特菌和表皮葡萄球菌在双菌种生物膜中的相互作用。JFoodSafety2010;30：954-68.j.1745-4565.2010.00254https://doi.org/10.1111/. X.[11] More VS，et al.微生物胞外多糖的分离纯化及其工业应用。在：微生物聚合物。新加坡：Springer; 2021.抗氧化应激诱导炎症第69-86页。 https://doi.org/10.1007/978-981-16-0045-6_3。+反应Imd途径主要由PGN调节，而[12] HaEM，et al. Gαq-磷脂酶Cβ-Ca2对DUOX的调节作用 通路在DUOX受宿主细菌中的代谢物调节，导致肠漏。因此，植物来源的植物生物活性物质是治疗肠道生态失调的更好替代品。在本研究中，UMB是抑制双氧化酶的较好配体。这证实了天然抑制剂的抗炎研究结果[65，66][67，68]。为了更好地理解疾病模型生物体，果蝇是一种非传统的新兴翻译模型[69，70]。我们的研究可以为建立免疫，糖尿病，糖尿病神经病变和其他生活方式代谢紊乱之间的联系提供更好的见解。竞合利益作者声明，他们没有已知的可能影响本文所报告工作确认PS要感谢DST-KSTePS，GoK DSU提供DST-Ph. D奖学金（LIF-09-2018-19）。衷心感谢印度喀拉拉邦卡萨拉果德拉贾普拉姆圣庇护十世学院微生物学系SinoshSkar- iyachan博士对本工作的支持。所有的作者感谢Siddaganga技术研究所，Tumakuru - 572 103和卡纳塔克邦生物技术和信息技术服务（KBITS），班加罗尔提供赠款，以建立生物技术政策下的计算设施-II，生物技术精修学校，生物技术技能提高计划（BiSEP）在生物技术系 在卡纳塔克邦的SIT所有的作者感谢DayanandaSagar 大 学 ， Bengalu-560 111 ， 卡 纳 塔 克 邦 的 DSU 种 子 赠 款 2021（DSU/RC/果蝇的肠道免疫。Dev Cell 2009;16：386-97. https://doi.org/10.1016/j的网站。devcel.2008.12.015。[13] Lee KA，et al. Bacterial uracil modulates Drosophila DUOX-dependent gutimmunityvia Hedgehog-induced signaling endosomes. Cell Host Microbe2015;17：191-204. https://doi.org/10.1016/j.chom.2014.12.012网站。[14] Ha EM，et al.在果蝇肠道中对寄生菌和感染性微生物的反应中协调多种双重氧化酶调节途径。Nat Immunol 2009;10：949-57. https://doi.org/10.1038/ni.1765网站。[15] 双氧化酶在果蝇肠道免疫中的直接作用。科学2005;4;310（5749）：847-50.https://doi.org/10.1126/science.1117311网站。[16] Rakesh SK等人，2，4-二取代噻吩衍生物的抗癌活性：脂氧合酶和环氧合酶的双重抑制剂。MedChem2015;11：462-72.https://doi.org/10.2174/1573406411666141210141918。[17] Rakesh KS等人，3，5-二取代异恶唑衍生物：炎症和癌症的潜在抑制剂。炎症2016;39：269-80. https://doi.org/10.1007/s10753-015-0247-5.[18] Meghashri S等人，细花罗勒叶提取物对感染性心内膜炎的影响。Int JPhytomed 2011;3：470.https://www.arjournals.org/index.php/ijpm/article/view/451/397.[19] Putta S等人，三萜类在糖尿病及其相关并发症中的治疗潜力。Curr Top MedChem2016;16：2532-42.https://doi.org/10.2174/1568026616666160414123343.[20] Praveen Kumar K，et al. Structural-functional insights and antidiabetic studies ondipeptidyl peptidase-4（DPP-4）binding to catechin from Withania somnifera.Biomed Res 2018;29：3192-200.https://doi.org/10.4066/biomedicalresearch.29-18-922.[21] Kunnel SG，et al. Acrylamide induced toXICITY and the propensity ofphytochemicals in amelioration：a review. Cent Nervs Syst Agents Med Chem2019;19：100-13. https://doi.org/10.2174/1871524919666190207160236网站。[22] Ramu R，et al.一种富含豆甾醇和β-谷甾醇的植物提取物对alloxan诱导的糖尿病大鼠 的 血 糖 状 态 和 葡 萄 糖 代 谢 的 影 响 。 食 品 & 功 能 2016;7 ： 3999-4011 。https://doi.org/10.1039/C6FO00343E网站。[23] Ramu R等人，香蕉的伞形酮和羽扇豆醇成分的体内抗糖尿病特性的评估（Musasp. var. Nanjangud Rasa Bale）在高血压啮齿动物模型中开花。PLoS One2016;11：e0151135. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0151135.[24] Satapathy P等人，Phyto-nano-antimicrobials：synthesis，characterization，discovery，and advances。前沿抗感染药物发现2020;8（8）：196。网址：//doi.org/10.2174/9789811412387120080009。P. Satapathy et al.医学信息学解锁27（2021）1008118[25] Aishwarya S，et al.罗望子的营养特性。- 魔鬼科学的香料和烹饪草药-最新的实验室，临床前，P. Satapathy et al.医学信息学解锁27（2021）1008119和临床研究。边沁科学Int. 2020;33：33-65.https://doi.org/10.2174/9789811468360120030004.[26] Khan K，et al. E X ploration of Dill seeds（anethum graveolens）：anayurpharmacomic approach.科学香料烹饪草药-最新实验室临床前研究2020;2：116-52。https://doi.org/10.2174/9789811441493120020008。[27] Arauz-Pacheco C等人，成人糖尿病患者高血压的治疗。糖尿病护理2002;25：134-47. https://doi.org/10.2337/diacare.25.1.134啊[28] RamuR，et al. Inhibitory effect of banana（Musa sp. 变种 Nanjangud rasa bale）花提取物及其成分伞形酮和羽扇豆醇对α-葡萄糖苷酶、醛糖还原酶和多阶段糖基化的影响。South Afr J Bot 2014;95：54-63. 网址：http：//doi.org/10.1016/j.sajb.2014.08.001[29] Ramu R，et al.香蕉抗高血压活性的研究（Musa sp. var. Nanjangud rasa bale）假茎在正常和糖尿病大鼠。J Sci Food Agric2015;95：165-73.https://doi.org/10.1002/jsfa.6698网站。[30] Naika HR，et al.Naravelia zeylanica（L.）DC抗糖原合成酶激酶-3 β蛋白。J Taibah Univ Sci 2015;9：41-9. https://doi.org/10.1016/j.jtusci.2014.04.009网站。[31] Br