序列浮动前向选择SFFS 互信息作为评价指标 mRMR作为准则函数 完整python代码和详细解释有使用示例可以直接粘贴使用
时间: 2024-03-22 20:40:15 浏览: 62
SFS代码1_SFS_SFS算法_SFS特征选择_序列前向选择_源码
以下是一个使用SFFS算法进行特征选择的Python代码示例,其中使用互信息作为评价指标,mRMR作为准则函数:
```python
import numpy as np
from sklearn.datasets import load_iris
from sklearn.feature_selection import mutual_info_classif
from sklearn.metrics import accuracy_score
from sklearn.neighbors import KNeighborsClassifier
def mrmr(X, y, k):
# 计算每个特征与目标变量之间的互信息
mi = mutual_info_classif(X, y)
# 初始化特征集合和准则函数值
S = set(range(X.shape[1]))
C = []
f = []
# 选择第一个特征
idx = np.argmax(mi)
S.remove(idx)
C.append(idx)
f.append(mi[idx])
# 选择其余k-1个特征
for i in range(k-1):
# 计算每个特征与已选择特征之间的互信息
mi_candidate = []
for j in S:
mi_j = mutual_info_classif(X[:, [j]], X[:, C], discrete_features=True)
mi_candidate.append(mi_j)
# 计算mRMR准则函数
mrmr_candidate = mi_candidate - np.mean(mi_candidate)
mrmr_candidate /= np.std(mi_candidate)
# 选择mRMR准则函数最大的特征
idx_candidate = np.argmax(mrmr_candidate)
idx = list(S)[idx_candidate]
S.remove(idx)
C.append(idx)
f.append(mi[idx])
return C, f
def sffs(X, y, k):
# 初始化特征集合和准确率
S = set(range(X.shape[1]))
S_best = set()
acc_best = 0
# 迭代选择特征
while len(S) > 0:
acc_all = []
S_candidate = []
# 向前选择特征
for i in S:
S_try = S_best | {i}
X_try = X[:, list(S_try)]
# 计算KNN分类器的准确率
knn = KNeighborsClassifier(n_neighbors=5)
knn.fit(X_try, y)
y_pred = knn.predict(X_try)
acc = accuracy_score(y, y_pred)
acc_all.append(acc)
S_candidate.append(S_try)
# 选择准确率最大的特征集合
idx = np.argmax(acc_all)
acc_cur = acc_all[idx]
S_cur = S_candidate[idx]
# 如果当前特征集合的准确率高于历史最高准确率,则更新
if acc_cur > acc_best:
S_best = S_cur
acc_best = acc_cur
# 如果当前特征集合的准确率低于历史最高准确率,则停止向前选择特征
else:
break
# 前向选择特征结束后,移除最差的特征
C, f = mrmr(X[:, list(S_best)], y, k)
S = set(C[:-1])
return S_best, acc_best
if __name__ == '__main__':
# 加载iris数据集
iris = load_iris()
X = iris.data
y = iris.target
# 使用SFFS算法进行特征选择
k = 4
S, acc = sffs(X, y, k)
# 输出选择的特征子集和准确率
print('Selected features:', S)
print('Accuracy:', acc)
```
在上述示例中,我们首先加载iris数据集,并使用SFFS算法进行特征选择。在sffs()函数中,我们将特征数目k设置为4,表示选择一个包含4个特征的子集。在特征选择结束后,我们输出选择的特征子集和准确率。
需要注意的是,上述示例中的特征选择算法和评价指标适用于分类问题。如果你需要处理回归问题,你需要使用其他评价指标和算法。另外,在实际使用时,你可能需要根据具体的数据集和问题进行调整和优化。
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