sffs算法使用互信息做评价指标pythonpytorch完整代码和每行详细注释
时间: 2024-03-22 12:42:32 浏览: 108
以下是使用Python和PyTorch实现SFFS算法的完整代码和详细注释:
```python
import numpy as np
import torch
from sklearn.metrics import mutual_info_score
# 计算特征与目标变量之间的互信息
def calc_mi(X, y):
n_samples, n_features = X.shape
mi = []
for i in range(n_features):
mi.append(mutual_info_score(X[:, i], y))
return mi
# SFFS算法
def sffs(X, y, estimator, k):
n_samples, n_features = X.shape
S = [] # 已选择的特征集合
F = list(range(n_features)) # 未选择的特征集合
while len(S) < k: # 选择k个特征
best_score = 0 # 最佳分数
best_feature = None # 最佳特征
for j in F: # 遍历未选择的特征集合
score = estimator(X[:, S + [j]], y) # 使用评价函数评估模型性能
if score > best_score: # 如果分数更好
best_score = score # 更新最佳分数
best_feature = j # 更新最佳特征
if best_feature is None: # 如果无法找到更好的特征
break # 结束搜索
S.append(best_feature) # 将最佳特征加入已选择的特征集合
F.remove(best_feature) # 在未选择的特征集合中删除已选择的特征
while True:
best_score = 0 # 最佳分数
worst_feature = None # 最差特征
for j in S: # 遍历已选择的特征集合
score = estimator(X[:, [f for f in S if f != j]], y) # 使用评价函数评估模型性能
if score > best_score: # 如果分数更好
best_score = score # 更新最佳分数
worst_feature = j # 更新最差特征
if worst_feature is None: # 如果无法找到更差的特征
break # 结束搜索
S.remove(worst_feature) # 在已选择的特征集合中删除最差特征
F.append(worst_feature) # 将最差特征加入未选择的特征集合
return S
# 示例用法
# 假设X是一个n_samples x n_features的矩阵,y是一个长度为n_samples的向量
# 假设estimator是一个用于评估模型性能的函数,它以X和y为输入,并返回一个分数
# 例如,可以使用交叉验证来评估模型性能
# 使用SFFS算法选择10个特征
selected_features = sffs(X, y, estimator, k=10)
```
在这个代码中,`calc_mi`函数用于计算特征与目标变量之间的互信息。`sffs`函数是SFFS算法的主要实现,它使用给定的评价函数(`estimator`)和特征数(`k`)来逐步选择特征。具体来说,它首先选择一个特征集合,其中包含评价函数得分最高的特征。接着,它根据评价函数的得分逐步增加或删除特征,直到达到指定的特征数。具体来说,它每次尝试将一个未选择的特征加入已选择的特征集合,并使用评价函数评估模型性能。然后,它尝试从已选择的特征集合中删除一个特征,并使用评价函数评估模型性能。这个过程会一直进行,直到无法找到更好或更差的特征为止。最后,它返回已选择的特征集合。
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