python中实现Permutation趋势检验的代码
时间: 2024-05-01 14:17:48 浏览: 75
python的简单测试代码
以下是Python中实现Permutation趋势检验的代码示例:
```python
import numpy as np
def permutation_trend_test(x, y):
n = len(x)
xy = np.vstack((x, y)).T
k = xy.shape[1]
# Compute observed t-statistic
t_obs = np.zeros(k)
for j in range(k):
t_obs[j] = np.sum(xy[:, j] * np.arange(1, n+1)) / np.sqrt(np.sum(xy[:, j]**2))
# Generate permutations and compute t-statistics
n_perms = 1000
t_perm = np.zeros((n_perms, k))
for i in range(n_perms):
np.random.shuffle(xy)
for j in range(k):
t_perm[i, j] = np.sum(xy[:, j] * np.arange(1, n+1)) / np.sqrt(np.sum(xy[:, j]**2))
# Compute p-values
p_val = np.mean((t_perm >= t_obs) | (t_perm <= -t_obs), axis=0)
return t_obs, p_val
```
其中,`x`和`y`是两个一维数组,表示需要进行趋势检验的两组样本数据。函数返回值是一个元组,包含两个一维数组`t_obs`和`p_val`,分别表示每个属性的观察t值和p值。这里使用了置换检验的思想,即通过随机重排两组数据的组合来生成n_perm个伪样本,计算每个属性的t值,最后计算p值得到显著性检验结果。
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