MRMR算法 python
时间: 2023-07-10 16:09:47 浏览: 268
python编写MR
MRMR算法是一种特征选择算法,可以用于数据降维或特征提取。下面是一个基于Python的简单实现:
```python
import numpy as np
from sklearn.metrics import mutual_info_score
def mrmr(X, y, k):
"""
:param X: 特征矩阵,每行为一个样本的特征,每列为一个特征
:param y: 标签向量
:param k: 选择的特征数
:return: 选择的特征下标
"""
n_samples, n_features = X.shape
mi = np.zeros(n_features) # 初始化互信息数组
for i in range(n_features):
mi[i] = mutual_info_score(X[:, i], y) # 计算每个特征与标签的互信息
F = np.zeros(n_features, dtype=bool) # 初始化特征选择标记数组
F[0] = True # 第一个特征为最大互信息特征
for i in range(1, k):
c_mi = np.zeros(n_features) # 初始化条件互信息数组
for j in range(n_features):
if not F[j]:
continue
for l in range(n_features):
if F[l] or l == j:
continue
c_mi[l] += mutual_info_score(X[:, l], X[:, j]) # 计算条件互信息
f_index = np.argmax(mi - c_mi) # 找到最大mRMR的特征下标
F[f_index] = True # 标记选择的特征
return np.where(F == True)[0]
```
使用示例:
```python
from sklearn.datasets import load_iris
iris = load_iris()
X, y = iris.data, iris.target
k = 2 # 选择2个特征
f_index = mrmr(X, y, k)
print(f_index) # 输出选择的特征下标
```
该示例使用鸢尾花数据集,选择了两个特征,并输出了选择的特征下标。
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