AttributeError: module 'dgl.graph_index' has no attribute 'from_bytes'
时间: 2023-06-22 11:32:46 浏览: 273
抱歉,这是因为DGL的版本更新导致的。在最新的DGL版本中,`dgl.graph_index`模块已经被弃用,现在可以使用`dgl.data.utils`模块中的`load_graphs()`函数来加载序列化的图形文件。
以下是一个加载二进制文件的示例代码:
```python
import dgl
import numpy as np
from dgl.data.utils import load_graphs
# 从文件中读取二进制图形数据
graph_data = 'graph.bin'
graphs, _ = load_graphs(graph_data)
# 打印图形信息
for g in graphs:
print('Number of nodes:', g.number_of_nodes())
print('Number of edges:', g.number_of_edges())
```
在这个示例中,我们使用`dgl.data.utils.load_graphs()`函数来加载序列化的图形文件。该函数返回一个包含所有图形的列表以及其他元数据的元组。我们可以使用`number_of_nodes()`和`number_of_edges()`函数来打印每个图形的节点和边数。
注意,这个示例只是一个简单的演示,实际使用中你可能需要根据你的二进制文件的格式来进行调整。
相关问题
AttributeError: module 'dgl' has no attribute 'contrib'
AttributeError: module 'dgl' has no attribute 'contrib' 是一个Python错误,它表示在dgl模块中没有名为'contrib'的属性。这通常是因为你正在尝试访问一个不存在的属性或模块。
DGL(Deep Graph Library)是一个用于图神经网络的Python库,它提供了一些用于图神经网络的功能和工具。在DGL中,'contrib'是一个子模块,它包含了一些额外的贡献功能。
如果你遇到了这个错误,可能有以下几种原因:
1. 你的DGL版本过低,不支持'contrib'模块。你可以尝试升级DGL到最新版本。
2. 你可能拼写错误,应该检查拼写是否正确。
3. 'contrib'模块可能已被移除或重命名。你可以查看DGL的文档或官方网站以获取更多信息。
File "E:/403/myworld/VGAE/trainTest.py", line 41, in loss_function recon_loss = dgl.losses.binary_cross_entropy(output, adj) # 重构误差 报错:AttributeError: module 'dgl' has no attribute 'losses'
根据错误提示,`dgl`模块中似乎没有名为`losses`的属性,因此无法使用`dgl.losses.binary_cross_entropy`方法。
如果您想使用DGL提供的二元交叉熵损失函数,可以使用`torch.nn.BCEWithLogitsLoss`类,该类已经包含在PyTorch中。
下面是一个使用`torch.nn.BCEWithLogitsLoss`类计算二元交叉熵损失的示例代码:
```python
import torch
import dgl
import numpy as np
with open('graph.bin', 'rb') as f:
graph_data = np.load(f, allow_pickle=True)
graph = dgl.graph((graph_data['edge_index'][0], graph_data['edge_index'][1]))
adj = (graph_data['adjacency_matrix'] != 0).astype(np.float32)
model = MyModel()
output = model(graph)
criterion = torch.nn.BCEWithLogitsLoss()
recon_loss = criterion(output.view(-1), torch.from_numpy(adj).view(-1))
```
在上述示例代码中,我们使用`torch.nn.BCEWithLogitsLoss`类计算二元交叉熵损失,并将输出`output`和邻接矩阵`adj`转换为一维向量进行计算。
需要注意的是,如果您的DGL版本较老,可能没有提供`dgl.losses`模块。如果需要使用DGL提供的损失函数,可以尝试升级DGL到最新版本。