怎么看eggnog-mapper在线网站输出的文件

EggNOG-mapper在线网站输出的文件包含以下几个：

1. `emapper.annotations`: 这个文件包含了每个输入基因在 EggNOG 数据库中的预测功能注释信息，例如基因家族、功能注释、描述信息、得分等等。您可以点击“Download Annotations”按钮下载这个文件。

2. `emapper.annotations_summary`: 这个文件提供了一个简要的功能注释摘要，包括注释到的不同基因家族的数量和百分比、覆盖的GO注释数量和百分比、KEGG注释数量和百分比等等。您可以点击“Annotations Summary”页面查看这个摘要信息。

3. `emapper.seed_orthologs`: 这个文件包含了每个输入基因的最佳种子正交基因家族成员序列，以及它们在EggNOG数据库中的注释信息。您可以点击“Download Seed Orthologs”按钮下载这个文件。

4. `emapper.hmm_hits`: 这个文件包含了每个输入基因与HMM模型的匹配结果，包括匹配的模型名称、匹配得分、E值等等。您可以点击“Download HMM Hits”按钮下载这个文件。

5. `emapper.annotations_to_report.html`: 这个文件提供了一个HTML格式的注释报告，展示了输入基因的所有注释信息。您可以点击“Annotations Report”页面查看这个文件。

这些文件中最为重要的是`emapper.annotations`文件，它提供了每个输入基因在EggNOG数据库中的预测功能注释信息，包括注释到的基因家族、功能注释和得分等等。您可以下载这个文件，使用文本编辑器或Excel等软件打开，查看每个基因的注释信息。

另外，`emapper.annotations_summary`文件提供了一个简要的功能注释摘要，您可以在网站上直接查看这个摘要信息。

最后，`emapper.annotations_to_report.html`文件提供了一个HTML格式的注释报告，您可以在网站上直接查看这个文件，查看每个基因的所有注释信息。