eggnog-mapper输出文件

eggnog-mapper是一个用于预测基因或蛋白质的功能和注释的工具。它的输出文件包括以下几个：

1. **emapper.annotations文件**：这是主要的输出文件，包含注释信息和注释统计数据。每行代表一个输入基因或蛋白质，列包括输入序列的ID、功能注释、COG注释、KOG注释、NOG注释、EC号、KEGG注释、KEGG Pathway注释等。

2. **emapper.seed_orthologs文件**：这个文件包含一个输入序列的种子正交群（Seed Orthologs）的注释信息。

3. **emapper.annotations文件的.hmm_hits部分**：这个文件包含了每个输入序列的HMM搜索结果信息。

4. **emapper.annotations文件的.go_terms部分**：这个文件包含了每个输入序列的GO注释信息。

5. **emapper.annotations文件的.domains部分**：这个文件包含了每个输入序列的域注释信息。

6. **emapper.annotations文件的.pathways部分**：这个文件包含了每个输入序列的KEGG Pathway注释信息。

这些文件中的数据可以用于进一步的生物信息学分析和可视化。