eggnog-mapper安装

EGGNOG-Mapper可以使用conda进行安装。请按照以下步骤进行安装：

1. 安装conda：如果你还没有安装conda，可以从[官方网站](https://docs.conda.io/en/latest/miniconda.html)下载适合你操作系统的版本，并按照官方文档进行安装。

2. 创建conda环境：打开终端，输入以下命令创建一个名为eggnog-mapper的conda环境（你可以将其替换为其他名称）：

conda create --name eggnog-mapper

3. 激活conda环境：输入以下命令激活创建的conda环境：

conda activate eggnog-mapper

4. 安装eggnog-mapper：输入以下命令使用conda安装eggnog-mapper：

conda install -c bioconda eggnog-mapper

5. 安装数据库：eggnog-mapper需要使用EGGNOG数据库进行注释。你需要下载并安装该数据库。可以使用以下命令下载和安装EGGNOG 5.0数据库：

emapper.py install --version 5

6. 运行eggnog-mapper：输入以下命令运行eggnog-mapper：

emapper.py -i input.fasta -o output.txt

以上命令中，`input.fasta`是你要注释的FASTA文件的路径和文件名，`output.txt`是注释结果输出文件的路径和文件名。你可以根据需要修改这些参数。