eggnog-mapper注释基因功能输出的emapper.annotations文件包括哪些信息
时间: 2024-04-27 20:21:05 浏览: 296
宏基因组注释和可视化神器MEGAN入门
eggnog-mapper注释基因功能输出的 `emapper.annotations` 文件包括以下信息:
1. `query_name`: 查询序列的名称或ID。
2. `seed_eggNOG_ortholog`: 种子eggNOG正交群的ID。
3. `seed_ortholog_evalue`: 查询序列与种子eggNOG正交群的比对e-value。
4. `seed_ortholog_score`: 查询序列与种子eggNOG正交群的比对bit score。
5. `Predicted_gene_name`: 预测的基因名称。
6. `GO_terms`: 与查询序列匹配的Gene Ontology (GO) term列表。
7. `KO`: 与查询序列匹配的KEGG Orthology (KO) ID。
8. `BiGG_Reactions`: 与查询序列匹配的BiGG Reaction ID。
9. `KEGG_Pathways`: 与查询序列匹配的KEGG Pathway ID列表。
10. `KEGG_Module`: 与查询序列匹配的KEGG Module ID列表。
11. `KEGG_Reaction`: 与查询序列匹配的KEGG Reaction ID列表。
12. `KEGG_rclass`: 与查询序列匹配的KEGG Reaction Class ID列表。
13. `BRITE_hierarchy`: 与查询序列匹配的BRITE hierarchy ID列表。
14. `Annotation`: 与查询序列匹配的eggNOG注释信息。
以上信息可以帮助我们更好地了解基因的功能和相互关系,从而进行更深入的分析和研究。
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