利用R语言,对ergm模型利用MCMC算法中的MH采样函数进行参数估计,另外说明参数的用法,并绘制各个参数的后验密度、迭代轨迹、自相关作用图
时间: 2024-02-03 10:11:37 浏览: 114
统计计算-MH算法(R语言)
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首先,需安装`ergm`包,然后导入数据并定义模型。下面是一个简单的例子:
```R
library(ergm)
data(faux.mesa.high) # 导入数据
# 定义模型,其中edges表示网络中连接的边
model <- ergm(edges ~ mutual + istar(2))
```
接下来,可以使用`MCMC`函数进行参数估计。下面是一个示例代码:
```R
mcmc <- MCMC(faux.mesa.high, model, control = control.ergm(MCMC.samplesize = 1000))
```
其中`MCMC.samplesize`表示采样次数,可以根据需要进行调整。
参数的用法如下:
- `mutual`:表示互惠性,即每个节点对之间的连接都是双向的。
- `istar(2)`:表示三角形的数量,其中`2`表示三角形中每个节点的度数为2。
可以使用`summary`函数查看参数的估计值和置信区间:
```R
summary(mcmc)
```
绘制各个参数的后验密度、迭代轨迹、自相关作用图可以使用`plot`函数:
```R
plot(mcmc)
```
如果想对特定参数进行绘图,可以使用以下命令:
```R
plot(mcmc, "mutual")
```
其中`"mutual"`表示要绘制的参数名称。
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