R语言使用mcmc算法中的MH采样函数对ergm进行参数估计,并查看后验分布
时间: 2024-02-01 10:15:14 浏览: 78
统计计算-MH算法(R语言)
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首先,需要安装ergm包和coda包。然后,可以使用以下代码进行MH采样和后验分布的检查:
```R
library(ergm)
library(coda)
# 生成网络数据
set.seed(123)
net <- rgraph(10, directed = FALSE)
# 构建ERGM模型
ergm_model <- ergm(net ~ edges)
# 进行MH采样
mcmc_samples <- ergmMH(ergm_model, control = list(nrep = 10000, proposal = "toggles"))
# 检查收敛性
summary(mcmc_samples)
# 绘制后验分布图
plot(mcmc_samples)
```
在上述代码中,我们使用了一个简单的ERGM模型,将网络中的边数作为响应变量,然后使用MH算法进行采样。我们选择了10000次迭代,并使用“toggles”命令作为提议分布。然后,我们使用`summary()`函数检查了MH采样的收敛性,并使用`plot()`函数绘制了后验分布的图形。
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