读取“GSE83148_series_matrix.txt”基因芯片文件和平台“GPL570-55999.txt”(跳过注释行),分别命名为df1和df2
时间: 2024-02-21 22:58:35 浏览: 78
可以使用 pandas 库中的 read_csv 函数来读取文本文件。对于“GSE83148_series_matrix.txt”基因芯片文件,可以使用以下代码:
```python
import pandas as pd
df1 = pd.read_csv("GSE83148_series_matrix.txt", sep="\t", skiprows=70, index_col=0)
```
这里使用了 pandas 中的 read_csv 函数,指定了文件名为“GSE83148_series_matrix.txt”,分隔符为制表符(`\t`),跳过了前 70 行(注释行),并将第一列作为索引列。
对于平台文件“GPL570-55999.txt”,可以使用以下代码:
```python
import pandas as pd
df2 = pd.read_csv("GPL570-55999.txt", sep="\t", comment="#", header=None, index_col=0)
```
这里同样使用了 pandas 中的 read_csv 函数,指定了文件名为“GPL570-55999.txt”,分隔符为制表符(`\t`),并跳过了以“#”开头的注释行。此外,由于平台文件没有标题行,因此需要将 header 参数设置为 None,同时将第一列作为索引列。
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python读取“GSE83148_series_matrix.txt”基因芯片文件和平台“GPL570-55999.txt”(跳过注释行),分别命名为df1和df2¶
好的,我会帮您完成这个任务。您可以使用 Pandas 库来读取这些文件,具体的代码如下:
```python
import pandas as pd
# 读取基因芯片文件
df1 = pd.read_csv('GSE83148_series_matrix.txt', sep='\t', skiprows=79)
# 读取平台文件
df2 = pd.read_csv('GPL570-55999.txt', sep='\t', comment='#')
```
其中,`pd.read_csv()` 是 Pandas 读取 CSV 文件的函数。`sep` 参数用于指定分隔符,这里基因芯片文件使用 `\t` 作为分隔符,平台文件使用默认的 `\t` 分隔符。`skiprows` 参数用于跳过前面的注释行,这里基因芯片文件前面有 79 行注释。`comment` 参数用于指定注释符号,这里平台文件使用 `#` 作为注释符号。
(1)读取“GSE83148_series_matrix.txt”基因芯片文件和平台“GPL570-55999.txt”(跳过注释行),分别命名为df1和df2¶
好的,以下是读取和命名的代码:
```python
import pandas as pd
# 读取基因芯片文件
df1 = pd.read_csv("GSE83148_series_matrix.txt", sep="\t", skiprows=69)
# 读取平台文件
df2 = pd.read_csv("GPL570-55999.txt", sep="\t", comment="#")
```
其中,基因芯片文件需要跳过前面的注释行,所以使用`skiprows`参数来跳过这些行;平台文件中以`#`开头的行是注释行,使用`comment`参数来跳过这些行。
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