class GraphAttention(nn.Module)和class GAT(nn.Module)这两个类
时间: 2023-10-23 09:51:27 浏览: 98
`GraphAttention`和`GAT`是两个类,继承自`nn.Module`,用于定义图注意力网络的模型结构。
下面是对这两个类的解释:
1. `GraphAttention`类:
- 继承自`nn.Module`,表示这是一个PyTorch模型类。
- 定义了图注意力网络的模型结构。
- 可以包含多个图注意力层,并通过堆叠这些层来构建更复杂的模型。
- 模型中的每个图注意力层可以具有不同的参数和配置。
- 可以实现前向传播函数来定义模型的计算流程。
2. `GAT`类:
- 继承自`nn.Module`,表示这是一个PyTorch模型类。
- 定义了图注意力网络的模型结构。
- 使用了`GraphAttention`类作为其子模块,以构建更复杂的模型。
- 可以通过设置不同的参数和配置来定制化模型。
- 实现了前向传播函数来定义模型的计算流程。
这两个类可以根据具体的需求进行定制和扩展,用于构建图注意力网络模型,并对图数据进行处理和学习。
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class GAT(nn.Module): def __init__(self, in_dim, out_dim, num_heads): super(GAT, self).__init__() self.num_heads = num_heads self.attentions = nn.ModuleList([nn.Linear(in_dim, out_dim) for _ in range(num_heads)]) self.out_att = nn.Linear(in_dim*num_heads, out_dim) def forward(self, x, adj): x = x.unsqueeze(1) x = x.transpose(2,0) x = torch.cat([att(x) for att in self.attentions], dim=1) alpha = F.softmax(torch.matmul(x, x.transpose(1, 2)) / self.num_heads, dim=-1) alpha = torch.where(alpha>0, alpha, torch.zeros_like(alpha)) # alpha = torch.where(adj.unsqueeze(-1).bool(), alpha, torch.zeros_like(alpha)) alpha = alpha / alpha.sum(dim=-2, keepdim=True) out = torch.matmul(alpha, x).squeeze(1) out = F.elu(self.out_att(out)) return out 这段代码中out的形状为(192,512),而self.out_att只能接受(128,512)的输入,这段代码应该怎么调整呢。我尝试在self部分增加一个线性全连接层linear(512,128),但是报错缺少必要的位置参数,我应该怎么办呢。这是pytorch版本
可以在 `forward` 函数中增加一个线性全连接层,将 `out` 的形状从(192,512)变为(192,128),代码如下:
```
class GAT(nn.Module):
def __init__(self, in_dim, out_dim, num_heads):
super(GAT, self).__init__()
self.num_heads = num_heads
self.attentions = nn.ModuleList([nn.Linear(in_dim, out_dim) for _ in range(num_heads)])
self.out_att = nn.Linear(in_dim*num_heads, out_dim)
self.linear = nn.Linear(512, 128) # 新增的全连接层
def forward(self, x, adj):
x = x.unsqueeze(1)
x = x.transpose(2,0)
x = torch.cat([att(x) for att in self.attentions], dim=1)
alpha = F.softmax(torch.matmul(x, x.transpose(1, 2)) / self.num_heads, dim=-1)
alpha = torch.where(alpha>0, alpha, torch.zeros_like(alpha))
# alpha = torch.where(adj.unsqueeze(-1).bool(), alpha, torch.zeros_like(alpha))
alpha = alpha / alpha.sum(dim=-2, keepdim=True)
out = torch.matmul(alpha, x).squeeze(1)
out = F.elu(self.out_att(out))
out = self.linear(out) # 新增的全连接层
return out
```
关于报错缺少必要的位置参数,可以检查一下代码中是否存在遗漏的参数或者参数位置错误的情况。如果还有问题可以提供更详细的错误信息以及代码段。
class Positional_GAT(torch.nn.Module): def __init__(self, in_channels, out_channels, n_heads, location_embedding_dim, filters_1, filters_2, dropout): super(Positional_GAT, self).__init__() self.in_channels = in_channels self.out_channels = out_channels self.n_heads = n_heads self.filters_1 = filters_1 self.filters_2 = filters_2 self.dropout = dropout self.location_embedding_dim = location_embedding_dim self.setup_layers() def setup_layers(self): self.GAT_1 = GATConv(in_channels=self.in_channels,out_channels=self.filters_1, heads=self.n_heads, dropout=0.1) self.GAT_2 = GATConv(in_channels=self.filters_1 * self.n_heads + self.location_embedding_dim, out_channels=self.out_channels, heads=self.n_heads, dropout=0.1, concat=False) def forward(self, edge_indices, features, location_embedding): features = torch.cat((features, location_embedding), dim=-1) features = self.GAT_1(features, edge_indices) features = torch.nn.functional.relu(features) features = torch.nn.functional.dropout(features, p=self.dropout, training=self.training) features = torch.cat((features, location_embedding), dim=-1) features = self.GAT_2(features, edge_indices) return features
这段代码实现了一个名为Positional_GAT的模型,它基于GAT(Graph Attention Network)模型,并添加了位置嵌入(location embedding)来考虑节点在图中的位置信息。具体来说,该模型包含一个GATConv层(表示第一层GAT),它将输入的特征向量(features)和边的索引(edge_indices)作为输入,并输出一个新的特征向量。第二层GATConv层将第一层的输出、位置嵌入和边的索引作为输入,并输出最终的特征向量。在模型的前向传播过程中,将输入的特征向量和位置嵌入在最开始的时候拼接在一起,然后经过第一层GATConv层进行处理,接着经过ReLU激活函数和dropout层。最后再次将特征向量和位置嵌入拼接在一起,经过第二层GATConv层得到输出结果。整个模型可以用于图分类、节点分类等任务。
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