读入经过图像分割后的nii文件利用vtk库将其3d可视化编写python代码

时间: 2024-01-20 07:04:35 浏览: 232
可以参考以下代码: ``` import vtk import nibabel as nib # 读取nii文件 filename = "segmentation.nii" nii_image = nib.load(filename) data = nii_image.get_fdata() # 创建vtk数据 vtk_data = vtk.vtkImageData() vtk_data.SetDimensions(data.shape) vtk_data.SetSpacing(nii_image.header.get_zooms()) vtk_data.AllocateScalars(vtk.VTK_UNSIGNED_CHAR, 1) for i in range(data.shape[0]): for j in range(data.shape[1]): for k in range(data.shape[2]): vtk_data.SetScalarComponentFromDouble(i, j, k, 0, data[i,j,k]) # 创建vtk可视化窗口 renderer = vtk.vtkRenderer() render_window = vtk.vtkRenderWindow() render_window.AddRenderer(renderer) render_window_interactor = vtk.vtkRenderWindowInteractor() render_window_interactor.SetRenderWindow(render_window) # 创建vtk可视化对象 volume_mapper = vtk.vtkSmartVolumeMapper() if vtk.VTK_MAJOR_VERSION <= 5: volume_mapper.SetInput(vtk_data) else: volume_mapper.SetInputData(vtk_data) volume_property = vtk.vtkVolumeProperty() volume = vtk.vtkVolume() volume.SetMapper(volume_mapper) volume.SetProperty(volume_property) # 添加vtk可视化对象到窗口 renderer.AddVolume(volume) renderer.ResetCamera() # 显示可视化窗口 render_window.Render() render_window_interactor.Start() ``` 需要安装的依赖包: - vtk - nibabel 注意:读取的nii文件需要经过图像分割处理,且为单通道灰度图像。
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