gcn进行图片分类的案例包含代码

时间: 2023-07-05 08:08:06 浏览: 23
以下是使用GCN进行图像分类的示例代码: 首先,需要导入必要的依赖项: ```python import torch import torch.nn.functional as F from torch_geometric.datasets import MNISTSuperpixels from torch_geometric.nn import GCNConv from torch_geometric.data import DataLoader ``` 接下来,定义模型: ```python class Net(torch.nn.Module): def __init__(self): super(Net, self).__init__() self.conv1 = GCNConv(1, 32, cached=False) self.conv2 = GCNConv(32, 64, cached=False) self.fc1 = torch.nn.Linear(64, 128) self.fc2 = torch.nn.Linear(128, 10) def forward(self, data): x, edge_index, batch = data.x, data.edge_index, data.batch x = F.relu(self.conv1(x, edge_index)) x = F.relu(self.conv2(x, edge_index)) x = torch_geometric.nn.global_max_pool(x, batch) x = F.relu(self.fc1(x)) x = F.dropout(x, training=self.training) x = self.fc2(x) return F.log_softmax(x, dim=1) ``` 然后,加载数据集并进行训练: ```python device = torch.device('cuda' if torch.cuda.is_available() else 'cpu') model = Net().to(device) optimizer = torch.optim.Adam(model.parameters(), lr=0.01) criterion = torch.nn.NLLLoss() train_dataset = MNISTSuperpixels(root='./data', train=True) test_dataset = MNISTSuperpixels(root='./data', train=False) train_loader = DataLoader(train_dataset, batch_size=64, shuffle=True) test_loader = DataLoader(test_dataset, batch_size=64, shuffle=False) def train(): model.train() for data in train_loader: data = data.to(device) optimizer.zero_grad() output = model(data) loss = criterion(output, data.y) loss.backward() optimizer.step() def test(loader): model.eval() correct = 0 for data in loader: data = data.to(device) output = model(data) pred = output.max(1)[1] correct += pred.eq(data.y).sum().item() return correct / len(loader.dataset) for epoch in range(1, 201): train() train_acc = test(train_loader) test_acc = test(test_loader) print(f'Epoch: {epoch}, Train Acc: {train_acc:.4f}, Test Acc: {test_acc:.4f}') ``` 这里使用了MNISTSuperpixels数据集进行训练和测试,但是可以根据实际情况替换为其他图像数据集。

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以下是使用GCN进行知识图谱实体对齐的Python代码示例: 首先,需要安装相关依赖库,例如networkx、numpy、scikit-learn和pytorch等。 python import networkx as nx import numpy as np from sklearn.preprocessing import LabelEncoder, OneHotEncoder from sklearn.model_selection import train_test_split import torch import torch.nn.functional as F from torch_geometric.data import Data from torch_geometric.nn import GCNConv # 构建两个图G1和G2 G1 = nx.read_edgelist('graph1.txt', delimiter=',', nodetype=int) G2 = nx.read_edgelist('graph2.txt', delimiter=',', nodetype=int) # 创建节点ID到索引的映射 id_to_idx = {} for i, node in enumerate(G1.nodes()): id_to_idx[node] = i for i, node in enumerate(G2.nodes()): id_to_idx[node] = i + len(G1.nodes()) # 创建节点的标签编码器 le = LabelEncoder() labels = list(G1.nodes()) + list(G2.nodes()) le.fit(labels) # 获取节点特征 node_features = np.zeros((len(labels), len(le.classes_))) for i, node in enumerate(labels): node_features[i, le.transform([node])[0]] = 1 # 创建节点特征和关系边缘索引的PyTorch几何数据对象 G1_edges = np.array(list(G1.edges())) G2_edges = np.array(list(G2.edges())) + len(G1.nodes()) edges = np.concatenate((G1_edges, G2_edges), axis=0) data = Data(x=torch.from_numpy(node_features).float(), edge_index=torch.from_numpy(edges).T) # 划分训练和测试数据集 train_idx, test_idx = train_test_split(np.arange(len(labels)), test_size=0.2, random_state=42) # 创建GCN模型 class GCN(torch.nn.Module): def __init__(self, in_channels, hidden_channels, out_channels): super(GCN, self).__init__() self.conv1 = GCNConv(in_channels, hidden_channels) self.conv2 = GCNConv(hidden_channels, out_channels) def forward(self, x, edge_index): x = self.conv1(x, edge_index) x = F.relu(x) x = F.dropout(x, training=self.training) x = self.conv2(x, edge_index) return x # 训练GCN模型 device = torch.device('cuda' if torch.cuda.is_available() else 'cpu') model = GCN(node_features.shape[1], 16, 2).to(device) optimizer = torch.optim.Adam(model.parameters(), lr=0.01, weight_decay=5e-4) criterion = torch.nn.CrossEntropyLoss() data = data.to(device) train_idx = torch.from_numpy(train_idx).to(device) test_idx = torch.from_numpy(test_idx).to(device) def train(): model.train() optimizer.zero_grad() out = model(data.x, data.edge_index)[train_idx] loss = criterion(out, torch.cat((torch.zeros(len(G1.nodes())), torch.ones(len(G2.nodes())))).long().to(device)) loss.backward() optimizer.step() return loss.item() def test(): model.eval() out = model(data.x, data.edge_index)[test_idx] pred = out.argmax(dim=1) acc = int((pred == torch.cat((torch.zeros(len(G1.nodes())), torch.ones(len(G2.nodes())))).long().to(device)).sum()) / len(test_idx) return acc for epoch in range(1, 201): loss = train() acc = test() print(f'Epoch {epoch:03d}, Loss: {loss:.4f}, Acc: {acc:.4f}') # 对齐实体 model.eval() out = model(data.x, data.edge_index) pred = out.argmax(dim=1) for i, node in enumerate(labels): if pred[i] == 0: G1.nodes[node]['label'] = le.inverse_transform([node_features[i].argmax()])[0] else: G2.nodes[node]['label'] = le.inverse_transform([node_features[i].argmax()])[0] 在这个示例中,首先读入两个图G1和G2的边缘列表文件,并将它们转换为networkx图对象。然后,使用LabelEncoder将节点标签转换为数字,并将节点特征和边缘索引转换为PyTorch几何数据对象。接着,将数据集划分为训练集和测试集,并创建一个GCN模型。最后,使用训练集训练模型,并使用测试集评估模型的性能。在训练完成之后,可以使用模型预测每个节点所属的图,并将相应的节点标签添加到每个图中。
高光谱图像分类是遥感图像处理的一个重要分支,在许多领域都有广泛的应用,如农业、林业、环境监测等。GCN(Graph Convolutional Network,图卷积网络)是近年来被广泛应用于图像分类任务的一种神经网络模型,能够有效地提取图像中的特征信息,因此也被用于高光谱图像分类中。 GCN高光谱图像分类代码需要进行以下步骤: 1.准备数据集:从公共数据集中下载高光谱图像数据集,如Indian Pines数据集,包含224x224个像素的224个波段。 2.对原始数据进行预处理:对数据进行标准化处理,将像素值转换为(0,1)之间的范围。 3.构建GCN模型: 使用Python中的keras或tensorflow等深度学习框架,构建GCN模型,包括图结构、卷积层、池化层、激活函数等。 4.训练模型:使用训练集对模型进行训练,并使用交叉验证进行调参,找到最佳的超参数。 5.预测分类:使用测试数据集对模型进行预测,并计算预测结果的准确性和精确度。 GCN高光谱图像分类代码需要注意的点包括: 1.在构建GCN模型时需要使用图结构,并考虑到图的不规则性和稀疏性,适应高光谱图像数据集的特点。 2.在训练模型时需要考虑到过拟合的问题,可以使用dropout等技术来避免。 3.预处理的方法要合适,不同的预处理方法可能会对模型的预测结果产生不同影响。 4.需要选择适当的评估指标,如准确性和精确度等。 总之,GCN高光谱图像分类代码需要深入理解图卷积网络的原理和高光谱图像的特点,充分发挥GCN在图像分类任务中的优势,并在数据预处理、模型构建、训练和预测等方面进行综合考虑才能达到更好的分类结果。
下面是一个使用 PyTorch 实现 GCN 进行图像分类的示例代码: python import torch import torch.nn as nn import torch.nn.functional as F class GCN(nn.Module): def __init__(self, in_channels, out_channels, use_bias=True): super(GCN, self).__init__() self.in_channels = in_channels self.out_channels = out_channels self.use_bias = use_bias self.weight = nn.Parameter(torch.Tensor(in_channels, out_channels)) if self.use_bias: self.bias = nn.Parameter(torch.Tensor(out_channels)) else: self.register_parameter('bias', None) self.reset_parameters() def reset_parameters(self): nn.init.xavier_uniform_(self.weight) if self.use_bias: nn.init.zeros_(self.bias) def forward(self, x, adj): h = torch.matmul(x, self.weight) h = torch.matmul(adj, h) if self.use_bias: h = h + self.bias return h class GCNClassifier(nn.Module): def __init__(self, in_channels, hidden_channels, out_channels, num_layers, use_bias=True): super(GCNClassifier, self).__init__() self.layers = nn.ModuleList() self.layers.append(GCN(in_channels, hidden_channels, use_bias)) for _ in range(num_layers - 2): self.layers.append(GCN(hidden_channels, hidden_channels, use_bias)) self.layers.append(GCN(hidden_channels, out_channels, use_bias)) def forward(self, x, adj): for layer in self.layers: x = F.relu(layer(x, adj)) return x model = GCNClassifier(in_channels=128, hidden_channels=64, out_channels=10, num_layers=4) 在这个示例代码中,我们首先定义了一个 GCN 类,它实现了图卷积操作;接着我们定义了 GCNClassifier 类,它使用了多个 GCN 层,并通过最后一层输出图像的分类
PyTorch GCN代码是指使用PyTorch库实现图卷积网络(Graph Convolutional Networks,GCN)的代码。 图卷积网络是一种用于图数据的深度学习模型,主要用于节点分类、链接预测和图生成等任务。它通过对图结构进行卷积操作来提取节点的特征表示。而PyTorch是一种基于Python的开源深度学习框架,提供了丰富的神经网络模块和自动求导功能。 在使用PyTorch库实现GCN的代码中,通常需要进行以下几个步骤: 1. 数据准备:需要将图数据转换为PyTorch可处理的数据格式,通常使用邻接矩阵和节点特征矩阵表示图结构和节点特征。 2. 模型定义:定义GCN模型的结构,通常包括多层图卷积层、激活函数和池化层等。每一层的输出作为下一层的输入,以逐层提取节点特征。 3. 模型训练:使用训练数据对定义的GCN模型进行训练,通常使用随机梯度下降(SGD)等优化算法来更新模型参数,以降低训练损失。 4. 模型评估:使用测试数据对训练好的模型进行评估,通常使用准确度、精确度、召回率等指标来评估模型的性能。 需要注意的是,代码的具体实现方式会因不同的GCN变体而有所差异,例如ChebNet、SpectralNet等。此外,代码中还可能包括数据预处理、结果可视化和超参数调优等过程。 总之,PyTorch GCN代码是指使用PyTorch库实现图卷积网络的代码,其实现过程涵盖数据准备、模型定义、模型训练和模型评估等步骤。具体实现方式会因GCN的变体而有所不同。
semi-gcn是一种半监督图卷积网络(Graph Convolutional Network)的代码实现。在处理图数据时,传统的卷积神经网络(CNN)无法直接应用。semi-gcn代码是基于半监督学习的图卷积神经网络的具体实现,它通过学习图数据的拓扑结构和节点特征来进行节点分类或图分类等任务。 semi-gcn代码的主要流程包括以下几个步骤: 1. 数据准备:从输入数据中构建图,通常使用邻接矩阵来表示图的连接关系,同时还可以使用节点特征矩阵来表示每个节点的属性。 2. 模型构建:构建卷积神经网络的模型结构,其中包含多个图卷积层和激活函数。每个图卷积层通过将节点的特征与其邻居节点的特征进行卷积操作来更新节点的特征表示。 3. 训练过程:使用半监督学习的方法进行训练,即通过已标记节点的标签来指导网络学习。通常使用交叉熵损失函数来衡量预测值和真实标签之间的差距,并通过反向传播算法更新网络参数。 4. 预测与评估:使用训练得到的模型来对新的未标记节点进行预测,即将网络应用于测试数据集中的节点,以获得节点的预测标签。同时,可以使用一些评估指标(如准确率、召回率等)来评估模型的性能。 Semi-gcn代码的实现可以使用Python编程语言和常用的深度学习框架(如TensorFlow、PyTorch)来完成。通过按照上述步骤进行编码,可以实现半监督图卷积网络,从而对图数据进行分类、聚类等任务的处理。此外,代码的性能还可以通过调整模型结构、参数设置和数据预处理等方式来提高。
### 回答1: GCN(Graph Convolutional Network)是一种用于图数据的深度学习模型,广泛应用于社交网络、推荐系统、生物学等领域。而PyTorch是一个基于Python的深度学习框架,提供了高效的自动求导机制和丰富的神经网络模块。 在PyTorch中实现GCN通常包括以下几个步骤: 1. 数据准备:将图数据表示为邻接矩阵和特征矩阵的形式。邻接矩阵描述了图中节点之间的连接关系,特征矩阵则包含了每个节点的特征向量。 2. 定义图卷积层:在PyTorch中,可以通过定义一个继承自nn.Module的新类来实现图卷积层。此类通常包括权重矩阵、激活函数和前向传播函数。权重矩阵用于将当前节点的特征与相邻节点的特征进行线性组合,激活函数则引入非线性变换。 3. 构建GCN模型:利用上述定义的图卷积层构建一个多层的GCN模型。在PyTorch中,可以通过将多个图卷积层串联起来构建一个nn.Sequential模型。 4. 定义损失函数和优化器:根据任务的不同,可以选择适合的损失函数来评估模型的性能,如交叉熵损失函数。同时,需要选择合适的优化器,如Adam优化器,用于更新模型的参数。 5. 训练模型:使用训练数据对模型进行训练。在每个训练迭代中,通过前向传播计算模型的输出,并与真实标签进行比较以计算损失。然后,使用反向传播算法计算梯度,并利用优化器更新模型的参数。 6. 测试模型:使用测试数据对训练好的模型进行测试。通过前向传播计算模型的输出,并与真实标签进行比较以评估模型的性能。 需要注意的是,在实现GCN过程中,还可以对模型进行一些调优,如添加正则化项、使用dropout技术等,以增强模型的泛化能力。此外,还可以使用一些效果更好的GCN变体,如GraphSAGE、GAT等。 综上所述,使用PyTorch实现GCN的过程涉及数据准备、图卷积层定义、GCN模型构建、损失函数和优化器选择、模型训练和测试等环节。掌握了这些步骤后,就可以利用PyTorch实现自己的GCN模型,并在图数据上进行监督学习任务。 ### 回答2: Graph Convolutional Network (GCN) 是一种用于图数据的深度学习模型,它在节点级别上进行特征表示学习和预测。下面是对GCN代码在PyTorch中的讲解。 GCN代码的主要结构如下: 1. 定义图结构:首先,需要定义节点之间的图结构。常见的方式是使用邻接矩阵来表示图中的连接关系。 2. 定义图卷积层:GCN的核心是图卷积层,它采用邻居节点的特征来更新目标节点的特征。在PyTorch中,可以使用torch.nn模块中的GraphConvolution类来实现。 - 在GraphConvolution类中,首先需要定义输入特征的维度和输出特征的维度。 - 在forward方法中,通过邻接矩阵和输入特征,计算每个节点的邻居节点的加权和。 - 然后,通过激活函数(如ReLU)进行非线性变换,得到更新后的特征表示。 - 最后,返回更新后的节点特征。 3. 定义整个GCN模型:GCN模型由多个图卷积层组成。在PyTorch中,可以通过定义一个包含多个图卷积层的类来实现。 - 在类的初始化方法中,定义每一层的输入特征维度、输出特征维度以及层数。 - 在forward方法中,将输入特征作为第一层的输入,并通过多个图卷积层进行特征的传递和更新。 - 返回最后一层的节点特征表示。 4. 数据准备和训练:在训练GCN模型之前,需要准备好带标签的图数据集。可以使用常见的数据处理库(如DGL、NetworkX等)来加载和处理图数据。然后,使用PyTorch的数据加载工具(如DataLoader)将数据转换为可供GCN模型使用的格式。 5. 定义损失函数和优化器:根据具体的问题,选择适合的损失函数和优化器。常见的损失函数包括交叉熵损失函数(CrossEntropyLoss),均方误差损失函数(MSELoss)等。优化器一般选择Adam、SGD等。 6. 模型训练和验证:使用准备好的训练数据和测试数据,对GCN模型进行训练和验证。通过计算损失函数进行参数更新,并根据验证结果确定模型的优化方向。 以上就是对GCN代码在PyTorch中的基本讲解。通过构建图结构、定义图卷积层和整个GCN模型,准备数据并进行训练,可以实现对图数据进行特征表示学习和预测的任务。 ### 回答3: GCN(Graph Convolutional Network)是一种用于图结构数据的深度学习模型,旨在解决图结构数据上的节点分类、链接预测等问题。PyTorch是一种广泛使用的深度学习框架,提供了灵活且高效的计算图表示和自动微分功能。 GCN的PyTorch代码讲解可以从以下几个方面展开: 1. 数据准备:首先,需要将图结构数据表示为邻接矩阵或稀疏矩阵的形式,并将其作为PyTorch的Tensor输入。同时,还需准备标签数据作为模型的监督信号。 2. 模型定义:使用PyTorch构建GCN模型,可以继承torch.nn.Module类,并在forward函数中定义模型的前向传播逻辑。在GCN中,通常包括图卷积层和非线性激活函数。可以使用torch.nn模块提供的函数或自定义函数实现这些操作。 3. 图卷积层:GCN的核心是图卷积层,它在前一层节点的特征基础上,通过邻居节点的信息来更新每个节点的特征表示。可以使用torch_geometric等第三方库提供的图卷积层实现,也可以自己编写代码实现。 4. 优化器和损失函数:将模型输出与标签数据进行比较,并定义损失函数衡量模型预测与真实标签之间的差异。可选择常见的损失函数,例如交叉熵损失函数,并使用PyTorch提供的优化器,如随机梯度下降(SGD)或Adam优化器。 5. 训练过程:定义训练过程的具体逻辑,包括正向传播、计算损失、反向传播、更新模型参数等步骤。可以设置训练迭代次数和学习率等超参数,并使用训练集和验证集对模型进行训练和评估。 总之,GCN的PyTorch代码实现主要包括数据准备、模型定义、图卷积层的实现、优化器和损失函数的选择、以及训练过程的编写。深入理解GCN模型的原理和PyTorch的使用,可以更好地理解和运用GCN的PyTorch代码。
好的,下面是可以用Python实现通过Neo4j创建的知识图谱利用GCN进行嵌入的代码: 首先,我们需要安装一些必要的库,包括: - PyTorch - dgl(基于PyTorch的图神经网络库) - neo4j(Python驱动程序) 可以使用以下命令安装它们: pip install torch pip install dgl pip install neo4j 然后,我们需要从Neo4j数据库中获取数据并准备好它们。这里我们假设我们的知识图谱中有一个实体类型为“Person”,一个实体类型为“Movie”,以及一个关系类型为“ACTED_IN”的关系类型。我们可以使用以下代码从Neo4j数据库中获取它们: python from neo4j import GraphDatabase driver = GraphDatabase.driver(uri, auth=(user, password)) with driver.session() as session: result = session.run(""" MATCH (p:Person)-[:ACTED_IN]->(m:Movie) RETURN id(p) as src, id(m) as dst """) src_ids = [record['src'] for record in result] dst_ids = [record['dst'] for record in result] 然后,我们需要将这些实体和关系转换为图形数据结构。我们可以使用dgl库来做到这一点: python import dgl import torch g = dgl.graph((src_ids, dst_ids)) g.ndata['feat'] = torch.zeros(g.num_nodes(), 10) # 初始化节点特征 现在我们已经准备好了图形数据,接下来我们需要定义一个GCN模型。这里我们使用dgl库中已经实现的GCN模型: python import dgl.nn.pytorch as dglnn class GCN(torch.nn.Module): def __init__(self, in_feats, hidden_feats, out_feats): super().__init__() self.conv1 = dglnn.GraphConv(in_feats, hidden_feats) self.conv2 = dglnn.GraphConv(hidden_feats, out_feats) def forward(self, g, features): x = self.conv1(g, features) x = torch.relu(x) x = self.conv2(g, x) return x 最后,我们可以使用GCN模型对知识图谱进行嵌入: python model = GCN(10, 16, 5) optimizer = torch.optim.Adam(model.parameters()) for epoch in range(10): logits = model(g, g.ndata['feat']) loss = torch.nn.functional.cross_entropy(logits, torch.tensor(labels)) optimizer.zero_grad() loss.backward() optimizer.step() 这里我们使用交叉熵作为损失函数,并使用Adam算法优化模型参数。在实际使用中,还需要为每个节点和关系分配标签,以便进行有监督的训练。
GCN(Graph Convolutional Network)是一种用于节点分类的深度学习模型。它主要应用于图结构数据的分类任务。Python是一种流行的编程语言,因其简单易学和丰富的第三方库而被广泛应用于各个领域,包括机器学习和深度学习。 GCN基于图的邻接矩阵来建模节点之间的关系,并进行卷积操作来提取节点的特征表示。在节点分类任务中,我们通常已经有了节点的特征矩阵和邻接矩阵。通过使用GCN模型,我们可以利用这些信息来预测每个节点所属的类别。 在使用Python实现GCN模型时,可以使用各种深度学习框架,例如TensorFlow和PyTorch。这些框架提供了用于构建和训练GCN模型的高级API和库函数,从而简化了模型的实现过程。 首先,我们需要将节点的特征矩阵和邻接矩阵加载到Python环境中。然后,我们可以使用深度学习框架的函数来创建GCN模型的网络结构。这个网络结构通常包括多个卷积层和非线性激活函数,以及用于分类的输出层。 在构建完GCN模型之后,我们可以使用训练集数据对模型进行训练,使用验证集数据来调整超参数,并使用测试集数据来评估模型的性能。通过多次迭代训练,我们可以逐渐提高模型的分类准确率。 总结来说,GCN是一种用于节点分类的深度学习模型,而Python则是一种常用的编程语言,可以使用其丰富的第三方库和深度学习框架来实现和训练GCN模型。通过这些工具和技术,我们可以有效地进行图结构数据的分类任务。
使用GCN(Graph Convolutional Network)进行分子预测是一种先进的方法。GCN是一种基于图结构的深度学习模型,在分子预测中可以利用分子的结构信息和特征进行预测和分类。 在GCN中,分子被建模为图,其中原子是图中的节点,分子中的化学键是图中的边。GCN通过在节点和边上进行卷积操作,学习节点和边的表示。这样,GCN可以将分子中的各个原子和化学键的信息捕捉到,并进行有效的分子预测。 使用GCN进行分子预测的一般步骤如下: 1. 构建分子的图表示:将分子转化为图结构,将原子作为节点,化学键作为边,构建分子的图表示。 2. 特征化分子节点:为每个分子节点赋予特征向量,可以使用原子的物理化学性质、电子结构特征等。 3. 图卷积网络的学习:使用GCN对图中的节点和边进行卷积操作,通过多个卷积层学习节点和边的表示。 4. 分子预测和分类:在图卷积网络学习完成后,可以通过输出层进行分子的预测和分类,如预测分子的性质、活性等。 使用GCN进行分子预测的优势在于能够充分利用分子的结构信息进行学习,不仅可以预测分子的性质和活性,还可以探索化合物之间的关联性和相互作用。此外,GCN还可以适应不同类型和规模的分子数据集,具有良好的可扩展性和泛化能力。 总之,使用GCN进行分子预测是一种高效、准确的方法,可以在化学研究和药物设计等领域中发挥重要作用。

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