rownames(data)=rt$id Warning message: Setting row names on a tibble is deprecated.

这个警告信息的意思是在 tibble 上设置行名称（row names）已经不推荐使用了。这是因为 tibble 是一种专门用于数据分析的数据结构，它与传统的数据框（data frame）有一些不同之处，其中之一就是默认不使用行名称。

如果你需要使用行名称，可以考虑将 tibble 转换为数据框，然后再设置行名称。例如，可以使用以下代码将 tibble `data` 转换为数据框，并将行名称设置为 `id` 列：

data <- as.data.frame(data)  # 将 tibble 转换为数据框
rownames(data) <- data$id  # 设置行名称为 id 列的值
data$id <- NULL  # 删除 id 列

这样，你就可以在数据框上使用行名称了。不过，需要注意的是，使用行名称可能会导致一些问题，比如当数据框中有重复的行名称时会出现冲突。因此，在使用行名称时，需要特别注意数据的唯一性。

相关问题

> rownames(data) <- data$...1 Warning message: Setting row names on a tibble is deprecated

这个警告消息是在R语言中遇到的，当你试图将数据框（data frame）的行名设置为该数据框中某个列的数据时发出的。`rownames(data) <- data$...1`这行代码的意图可能是想基于`...1`列的内容给数据框设置行标签。然而，从R 4.0开始，tibbles（一种高效的数据结构，类似于data frames）默认不允许直接赋值行名，因为它们通常不需要显式的行名。

警告信息告诉你，这种操作已经被弃用（deprecated），意味着虽然现在还能工作，但在未来的版本中可能会发生变化。如果你想给tibble设置行名，可以先将其转换为标准的data frame，或者使用`tibble::rownames_to_column()`函数进行转换后再设置。

# 如果data是一个tibble
data_temp <- as.data.frame(data)
rownames(data_temp) <- data_temp$...1

# 或者使用tibble的方式
data %>% rownames_to_column(var = "row_name") # 如果希望保留原列名，可以指定var参数

DATA=readxl::read_xlsx(path = "C:/Users/63035/Desktop/土壤微生物整理 - 副本/方差分析/细菌原始数值方差.xlsx",sheet = 1) TuRang=cbind(as.data.frame(lapply(X = as.list(DATA[,3:27]),FUN = function(x){ model=aov(formula = x~DATA$group) MM <- duncan.test(y = model,trt = "DATA$group", group=T,console=F) MM1<-MM$groups rowname<-row.names(MM1) MM2<-data.frame(rowname,MM1$'x',MM1$groups) MM2=MM2[order(factor(MM2$rowname)),] rowname<-MM2$rowname mean=MM$means[,1] sd=MM$means[,2] marker=MM2$MM1.groups Result=data.frame(round(x = mean,digits = 4),round(x = sd,digits = 4),marker) colnames(x = Result)=c("","SD","Marker") rownames(x = Result)=rowname Result } ))) 请修改脚本，使输出结果行列顺序均不改变

可以将代码中的最后一行修改为：

Result <- data.frame(t(Result), check.names = FALSE)

这样可以转置输出结果，并且保留原有的行列顺序。同时，`check.names = FALSE`参数可以保证列名不被修改。