python实现将nii.gz格式的T1和T1ce模态数据转换为numpy数组进行做差得到sub,再将numpy数组的sub转换成nii.gz格式的数据
时间: 2023-12-03 11:44:41 浏览: 74
要实现这个功能,可以使用Python中的nibabel库来读取和写入NIfTI格式的文件,使用numpy库来进行数组运算。以下是一个示例代码,你可以根据自己的需求进行修改和优化。
```python
import nibabel as nib
import numpy as np
# 读取T1和T1ce模态数据
t1_img = nib.load('t1.nii.gz')
t1ce_img = nib.load('t1ce.nii.gz')
# 将NIfTI格式数据转换为numpy数组
t1_data = t1_img.get_fdata()
t1ce_data = t1ce_img.get_fdata()
# 计算T1和T1ce的差异
sub_data = t1_data - t1ce_data
# 将sub数组转换为NIfTI格式数据
sub_img = nib.Nifti1Image(sub_data, t1_img.affine, t1_img.header)
# 保存NIfTI格式数据
nib.save(sub_img, 'sub.nii.gz')
```
在上面的代码中,我们首先使用nibabel库中的`nib.load()`函数加载了T1和T1ce模态数据,然后使用`get_fdata()`方法将它们转换为numpy数组。接着,我们使用numpy库中的`-`运算符计算了T1和T1ce的差异,并将结果保存到一个名为`sub_data`的数组中。
最后,我们使用nibabel库中的`Nifti1Image()`函数将`sub_data`数组转换为NIfTI格式的数据,并使用`nib.save()`函数将其保存到磁盘上。请将代码中的文件路径替换为你自己的文件路径。
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