错误于survdiff(Surv(OS.time, OS) ~ group, data = surv, na.action = na.exclude): 没有"survdiff"这个函数 >
时间: 2024-09-28 13:15:22 浏览: 39
看起来你在尝试在 R 语言的 survival 包中使用 `survdiff` 函数来进行生存差异分析,但似乎遇到了找不到该函数的问题。实际上,`survdiff` 是 `survival` 包中用于做单因素生存比较的一个核心函数,不是 `Surv()` 函数。`Surv()` 是为了创建生存对象,通常用于定义生存时间和结局变量。
正确的语法应该是这样的:
```R
surv_diff <- survdiff(Surv(OS.time, event) ~ group, data = surv, na.action = na.exclude)
```
这里的 `OS.time` 是生存时间,`event` 是结局变量(1表示发生了事件,0表示仍在研究中),`group` 是你要比较的分类变量。`na.action = na.exclude` 会忽略缺失值。
如果依然提示找不到函数,确认一下你是否已经正确安装了 `survival` 包,并且在当前环境中已经加载了它。如果没有,使用 `install.packages("survival")` 安装,然后 `library(survival)` 加载包。
如果你想知道更多关于 `survdiff` 使用的帮助信息,可以运行 `?survdiff` 查看文档。
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fit <- coxph(Surv(OS.time,OS) ~ ., data = my.cli.2) # 查看回归系数和显著性检验结果 summary(fit)##结果变成data frame
在这段代码中,使用了coxph()函数拟合了一个Cox回归模型,并将结果保存在fit对象中。其中,Surv()函数表示生存数据的格式,OS.time表示生存时间,OS表示是否事件发生(1表示事件发生,0表示未发生),~.表示使用所有其他变量拟合模型。data参数表示使用的数据集,这里是my.cli.2。最后,使用summary()函数查看回归系数和显著性检验结果,结果会以数据框(data frame)的形式呈现。
Error in cph(Surv(time, Y) ~ ., X = T, y = T, data = surv, surv = T, n = 17836) : argument 6 matches multiple formal arguments
这个错误提示是因为在 cph() 函数中,参数 "surv" 和 "n" 都被匹配到了第六个参数位置。这可能是因为你的代码中使用了过时的参数名或者参数位置不正确。
你可以尝试在函数中指定参数名来避免这个问题,比如将 "surv" 参数指定为 "id",将 "n" 参数指定为 "maxiter",如下所示:
```
cph(Surv(time, Y) ~ ., X = T, y = T, data = surv, id = T, maxiter = 17836)
```
这样就可以避免参数位置混淆的问题。另外,你也可以查看一下 cph() 函数的帮助文档,确保你使用的是正确的参数名和参数位置。
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