解释下面的代码:recon_params1 = list(map(id, denoiser.recon_trunk.parameters())) recon_params2 = list(map(id, denoiser.cbam.parameters())) recon_params3 = list(map(id, denoiser.conv_last.parameters())) base_params = filter(lambda p: id(p) not in recon_params1+recon_params2+recon_params3, denoiser.parameters()) opt = optim.Adam([{'params': base_params}, {'params': denoiser.recon_trunk.parameters(), 'lr': 1e-5}, {'params': denoiser.cbam.parameters(), 'lr': 1e-5}, {'params': denoiser.conv_last.parameters(), 'lr': 1e-5}], lr = 1e-6)

时间: 2024-04-05 22:31:18 浏览: 23
这段代码是一个 PyTorch 模型的优化器设置。首先,它将模型的参数分成了三部分:recon_trunk、cbam 和 conv_last。然后,它创建了一个 base_params 变量,其中包含了所有不属于这三个部分的其他参数。 接下来,它使用 optim.Adam 优化器来定义优化过程。Adam 是一种常用的随机梯度下降优化算法。在这里,它使用了一个字典格式的参数列表,其中包含了四个元素。第一个元素是 base_params,它使用默认的学习率。其他三个元素分别是 recon_trunk、cbam 和 conv_last,它们的学习率都设为了 1e-5。 最后,整个优化器被赋值给 opt 变量,它的学习率被设置为 1e-6。这个学习率将被用于所有的参数,包括 base_params、recon_trunk、cbam 和 conv_last。
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def train(images, labels, epoch, training_mode): with tf.GradientTape() as tape: if training_mode == 'full': predictions = bc_model(images) elif training_mode == 'latent': z, _, _ = cmvae_model.encode(images) predictions = bc_model(z) elif training_mode == 'reg': z = reg_model(images) predictions = bc_model(z) recon_loss = tf.reduce_mean(compute_loss(labels, predictions)) gradients = tape.gradient(recon_loss, bc_model.trainable_variables) optimizer.apply_gradients(zip(gradients, bc_model.trainable_variables)) train_loss_rec_v(recon_loss)

这段代码实现了一个模型的训练过程,训练的是一个基于条件变分自编码器(CMVAE)的卷积神经网络(CNN),可以在完全训练模式、潜变量训练模式和正则化训练模式下进行。这里的`bc_model`是一个卷积神经网络模型,`cmvae_model`是一个条件变分自编码器模型,`reg_model`是一个正则化模型。`compute_loss`是一个计算损失函数的函数。 在训练过程中,首先根据训练模式(`training_mode`)选择不同的模型进行预测(`predictions = bc_model(images)`),然后计算预测结果与标签数据的损失(`recon_loss = tf.reduce_mean(compute_loss(labels, predictions))`)。接着,使用`tf.GradientTape`记录损失函数对模型参数的梯度,然后使用优化器(`optimizer`)对模型参数进行更新,使得模型能够更好地拟合数据。最后,将损失函数值记录在一个变量中(`train_loss_rec_v(recon_loss)`),以便进行可视化和监控训练过程中的损失变化。

代码解析 scores = pdist_l1(input_,recon_image[:,0,:,:].unsqueeze(1))

这段代码是在计算两个张量之间的L1范数距离(曼哈顿距离),其中`input_`是一个张量,`recon_image[:,0,:,:].unsqueeze(1)`是另一个张量。 让我们逐步解析这段代码: 1. `recon_image[:,0,:,:].unsqueeze(1)`:这部分代码表示从`recon_image`张量中选择第一个通道的所有元素,即`recon_image`的第一个通道的所有图像数据。`.unsqueeze(1)`将张量的维度从`(batch_size, channel, height, width)`变为`(batch_size, 1, height, width)`,在通道维度上增加了一个维度。 2. `pdist_l1(input_, recon_image[:,0,:,:].unsqueeze(1))`:这部分代码使用`pdist_l1`函数计算了`input_`张量和上述处理后的`recon_image`张量之间的L1范数距离。`pdist_l1`函数通常是用于计算欧氏距离或曼哈顿距离。具体实现可能依赖于所使用的库或框架,可以查阅相关文档以了解该函数的具体功能和实现方式。 最终,`scores`是一个包含两个张量之间L1范数距离的结果。它的形状可能取决于输入张量的维度和大小。

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运行代码: import scipy.io import mne from mne.bem import make_watershed_bem import random import string # Load .mat files inner_skull = scipy.io.loadmat('E:\MATLABproject\data\MRI\Visit1_040318\\tess_mri_COR_MPRAGE_RECON-mocoMEMPRAGE_FOV_220-298665.inner_skull.mat') outer_skull = scipy.io.loadmat('E:\MATLABproject\data\MRI\Visit1_040318\\tess_mri_COR_MPRAGE_RECON-mocoMEMPRAGE_FOV_220-298665.outer_skull.mat') scalp = scipy.io.loadmat('E:\MATLABproject\data\MRI\Visit1_040318\\tess_mri_COR_MPRAGE_RECON-mocoMEMPRAGE_FOV_220-298665.scalp.mat') print(inner_skull.keys()) # Assuming these .mat files contain triangulated surfaces, we will extract vertices and triangles # This might need adjustment based on the actual structure of your .mat files inner_skull_vertices = inner_skull['Vertices'] inner_skull_triangles = inner_skull['Faces'] outer_skull_vertices = outer_skull['Vertices'] outer_skull_triangles = outer_skull['Faces'] scalp_vertices = scalp['Vertices'] scalp_triangles = scalp['Faces'] subjects_dir = 'E:\MATLABproject\data\MRI\Visit1_040318' subject = ''.join(random.choices(string.ascii_uppercase + string.ascii_lowercase, k=8)) # Prepare surfaces for MNE # Prepare surfaces for MNE surfs = [ mne.make_bem_model(inner_skull_vertices, inner_skull_triangles, conductivity=[0.01], subjects_dir=subjects_dir), # brain mne.make_bem_model(outer_skull_vertices, outer_skull_triangles, conductivity=[0.016], subjects_dir=subjects_dir), # skull mne.make_bem_model(scalp_vertices, scalp_triangles, conductivity=[0.33], subjects_dir=subjects_dir), # skin ] # Create BEM solution model = make_watershed_bem(surfs) solution = mne.make_bem_solution(model) 时报错: Traceback (most recent call last): File "E:\pythonProject\MEG\头模型.py", line 30, in <module> mne.make_bem_model(inner_skull_vertices, inner_skull_triangles, conductivity=[0.01], subjects_dir=subjects_dir), # brain File "<decorator-gen-68>", line 12, in make_bem_model File "E:\anaconda\envs\pythonProject\lib\site-packages\mne\bem.py", line 712, in make_bem_model subject_dir = op.join(subjects_dir, subject) File "E:\anaconda\envs\pythonProject\lib\ntpath.py", line 117, in join genericpath._check_arg_types('join', path, *paths) File "E:\anaconda\envs\pythonProject\lib\genericpath.py", line 152, in _check_arg_types raise TypeError(f'{funcname}() argument must be str, bytes, or ' TypeError: join() argument must be str, bytes, or os.PathLike object, not 'ndarray' 进程已结束,退出代码1

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