for smiles in smiles_list: mol = Chem.MolFromSmiles(smiles) mols.append(mol) def fragment_score(mols, fragment_lib): fragments = set() for mol in mols: mol_fragment = Chem.GetMolFrags(mol, asMols=True) for mol_frag in mol_fragment:优化这段代码
时间: 2024-02-19 09:03:18 浏览: 88
这段代码可以进行如下优化:
1. 使用列表推导式替换 for 循环添加元素到列表的操作,可以让代码更简洁:
```
mols = [Chem.MolFromSmiles(smiles) for smiles in smiles_list]
```
2. 可以使用集合推导式替换双重循环添加元素到集合的操作,可以让代码更简洁:
```
fragments = {mol_frag for mol in mols for mol_frag in Chem.GetMolFrags(mol, asMols=True)}
```
3. 可以使用生成器表达式替换列表推导式,可以避免创建中间结果列表,提高代码的效率:
```
mols = (Chem.MolFromSmiles(smiles) for smiles in smiles_list)
```
4. 可以使用列表生成器替换集合推导式,可以避免创建中间结果集合,提高代码的效率:
```
fragments = [mol_frag for mol in mols for mol_frag in Chem.GetMolFrags(mol, asMols=True)]
```
综上所述,优化后的代码可以写成以下几种形式:
1. 使用列表推导式和集合推导式:
```
mols = [Chem.MolFromSmiles(smiles) for smiles in smiles_list]
fragments = {mol_frag for mol in mols for mol_frag in Chem.GetMolFrags(mol, asMols=True)}
```
2. 使用生成器表达式和列表生成器:
```
mols = (Chem.MolFromSmiles(smiles) for smiles in smiles_list)
fragments = [mol_frag for mol in mols for mol_frag in Chem.GetMolFrags(mol, asMols=True)]
```
注意,如果需要多次使用 `mols`,最好使用列表推导式创建列表,因为生成器只能遍历一次。
阅读全文