SampleID=JN_1901 Blast_out=/Analysis_B/20220326_JNILI/007_blastn/ Diamond_file_in=/Analysis_B/20220326_JNILI/004_Trinity/JN_1901_trinity.fa #### 003 #### cd ${Blast_out} blastn -query ${Diamond_file_in} -db "/home/Reference_database/NCBI_db_nt/" -out ${Blast_out}${SampleID}_blastn.out -num_threads 12 -outfmt 6 qseqid qlen saccver salltitles slen pident length qcovs bitscore evalue staxids -evalue 1e-5 awk -F$'/t' '!seen[$1]++' ${Blast_out}${SampleID}_blastn.out > ${Blast_out}${SampleID}_blastn.out.unique帮我解释一下这段代码

这段代码主要是进行基因序列比对和去重的过程，其中：

- SampleID=JN_1901 是样本的编号；
- Blast_out=/Analysis_B/20220326_JNILI/007_blastn/ 是blast比对结果的输出路径；
- Diamond_file_in=/Analysis_B/20220326_JNILI/004_Trinity/JN_1901_trinity.fa 是基因组装结果的路径；
- cd ${Blast_out} 进入blast比对结果的输出路径；
- blastn -query ${Diamond_file_in} -db "/home/Reference_database/NCBI_db_nt/" -out ${Blast_out}${SampleID}_blastn.out -num_threads 12 -outfmt 6 qseqid qlen saccver salltitles slen pident length qcovs bitscore evalue staxids -evalue 1e-5 进行blastn比对，-query指定比对的查询序列，-db指定参考序列库，-out指定输出文件名，-num_threads指定线程数，-outfmt指定输出格式，这里是tabular格式；
- awk -F$'/t' '!seen[$1]++' ${Blast_out}${SampleID}_blastn.out > ${Blast_out}${SampleID}_blastn.out.unique 根据比对结果中的qseqid（即查询序列的ID）进行去重，这里使用awk命令，-F指定分隔符为制表符，!seen[$1]++表示如果第一个字段（即qseqid）没有出现过，则保留该行，否则忽略该行，最终输出去重后的结果到${Blast_out}${SampleID}_blastn.out.unique文件中。