for i in *.faa; do iqtree -s $i -nt 150 --undo -m AVX2;done 请问这个代码输出的文件有哪些

这个代码会对当前目录下所有以".faa"结尾的文件运行"iqtree"程序，并且使用150个线程，使用AVX2模型进行模型选择和树构建。其中"--undo"选项表示将所有的模型评估结果输出到文件，而不是仅输出最优模型的结果。因此，输出的文件可能包括：

- 各个序列文件的模型评估结果文件（以".iqtree"为后缀）
- 各个序列文件的最优模型结果文件（以".best"为后缀）
- 各个序列文件的树文件（以".treefile"为后缀）
- 各个序列文件的分支支持值文件（以".ufboot"为后缀）
- 各个序列文件的模型参数文件（以".bionj"为后缀）
- 各个序列文件的模型参数文件（以".mldist"为后缀）
- 各个序列文件的模型参数文件（以".log"为后缀）

具体输出的文件数量和后缀名可能会因为不同的参数选项而有所不同。

相关问题

请帮我优化这段代码for i in *.faa; do iqtree -s $i -nt 150 --undo; done for i in *.faa; do iqtree -s $i -nt 150 --undo; done

可以将两个 for 循环合并成一个，这样可以减少重复的代码，优化后的代码如下：

for i in *.faa; do
    iqtree -s $i -nt 150 --undo;
done

此外，如果您的处理器支持 AVX2 或 AVX512 指令集，可以添加 `-m AVX2` 或 `-m AVX512` 参数来提高 iqtree 的运行效率。

for i in *.faa; do iqtree -s $i -nt 150 --undo -m AVX2;done

这也是一个批量进行进化树构建的脚本，和之前的脚本相比，只是省略了一些参数设置，包括 "-mset" 参数、bootstrap 和 SH-like 处理的参数、贝叶斯推断的参数以及输出文件名前缀的设置。

具体来说，该脚本对于每个以 ".faa" 结尾的文件，都使用 IQ-TREE 软件进行进化树构建，其中 "-s" 参数指定输入序列文件，"-nt" 参数指定线程数，"-m" 参数指定模型为 AVX2。

因此，该脚本的功能相对较简单，只是进行了一些基本的参数设置，并没有进行复杂的模型选择和处理。