# 加载训练集和验证集 > train_data <- fread("data.rose") Error in fread("data.rose") : 文件'data.rose' 不存在, 或不可读. getwd()=='C:/Users/仙仙/OneDrive/文档'

根据你提供的错误信息，"data.rose"文件可能不存在或无法读取。请确保"data.rose"文件存在于当前工作目录中，并且文件名拼写正确。你可以使用以下代码检查当前工作目录并列出该目录下的文件：

getwd()  # 获取当前工作目录
list.files()  # 列出当前工作目录下的文件

请确认"data.rose"文件是否在当前工作目录中，并确保文件名的大小写与实际文件名一致。如果"data.rose"文件存在于其他目录中，你需要将文件的完整路径提供给`fread()`函数，例如：

train_data <- fread("/path/to/data.rose")

请将"/path/to/data.rose"替换为"data.rose"文件的实际路径。

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> data <- fread("/Users/imac/Desktop/summary_process/output_summary15.csv") > library(data.table) > setwd("/Users/imac/Desktop/summary_process") > data <- fread("output_summary15.csv") > cols <- c(4, 5, 25, 17, 26, 10) > selected_data <- data[, cols] Error in `[.data.table`(data, , cols) : j (the 2nd argument inside [...]) is a single symbol but column name 'cols' is not found. Perhaps you intended DT[, ..cols]. This difference to data.frame is deliberate and explained in FAQ 1.1.

这个错误是因为在`data[, cols]`中，`cols`被解释为一个列名，而不是列的索引。可以使用`..cols`来解决这个问题，因为`..`告诉`data.table`使用变量的值而不是变量名。

以下是修改后的代码：

library(data.table)

# 设置工作目录
setwd("/Users/imac/Desktop/summary_process")

# 读取csv文件
data <- fread("output_summary15.csv")

# 选择需要的列
cols <- c(4, 5, 25, 17, 26, 10)
selected_data <- data[, ..cols]

# 将列粘在一起
text <- apply(selected_data, 1, function(x) {
  paste(x[1], x[2], "blastx", x[3], x[4], "blastn", x[5], x[6], sep = "::")
})

# 使用gsub函数将空格替换为.
text <- gsub(" ", ".", text)

# 将文本转化为数据框
new_data <- data.frame(text)

# 写入新文件
write.csv(new_data, "new_file.csv", row.names = FALSE)

请注意，我只是修改了第5和第8行的代码，以便正确选择列。

> # 设置工作目录 > setwd("/Users/imac/Desktop/summary_process") > > # 读取csv文件 > data <- fread("output_summary15.csv") > > # 选择需要的列 > cols <- c("V1", "V2", "V24", "V15", "V3.y", "V7") > selected_data <- data[, ..cols] > > # 将列粘在一起 > text <- apply(selected_data, 1, function(x) { + paste(x[V1], x[V2], "blastx", x[V24], x[V15], "blastn", x[V3.y], x[V7], sep = "::") + }) Error in eval(quote(list(...)), env) : object 'V1' not found

这个错误是因为在`paste()`函数中使用了未定义的变量`V1`。因为`x`是一个向量，它不支持通过`x[V1]`这样的方式来选择列。要选择列，应该使用列的名称或索引，像这样：

paste(x["V1"], x["V2"], "blastx", x["V24"], x["V15"], "blastn", x["V3.y"], x["V7"], sep = "::")

或者

paste(x[1], x[2], "blastx", x[3], x[4], "blastn", x[5], x[6], sep = "::")

这将确保正确选择列并将它们粘合在一起。