ASE中利用GPA(Generalized Perturbation Method)工具对POSCAR优化晶格参数,具体代码
时间: 2024-01-19 07:03:03 浏览: 142
ase.zip_ase加密源代码_信息加密案例
以下是使用ASE中的GPA工具来优化POSCAR晶格参数的示例代码:
```python
from ase.io import read, write
from ase.optimize import BFGS
from ase.optimize.gpaw import GPAW
from ase.optimize.gpaw import GPAWForceMixing
from ase.constraints import UnitCellFilter
# 读取POSCAR文件并创建Atoms对象
atoms = read('POSCAR')
# 定义计算方法
calc = GPAW(mode='lcao', xc='PBE', h=0.2, kpts=(4,4,4))
atoms.set_calculator(calc)
# 进行GPA优化
opt = BFGS(UnitCellFilter(atoms), logfile='gpa.log')
opt.run(fmax=0.02)
# 输出最终的POSCAR文件
write('POSCAR_optimized', atoms, format='vasp', vasp5=True)
```
在上面的代码中,我们首先使用`ase.io.read()`方法读取了一个POSCAR文件,并创建了一个Atoms对象。然后,我们使用GPAW计算方法进行计算,并将其设置为优化器的计算方法。接下来,我们使用BFGS优化器对晶格参数进行优化,使用UnitCellFilter来保持晶格参数的对称性。最后,我们使用`ase.io.write()`方法输出最终的POSCAR文件。
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