ggcorrplot()参数 只显示p<0.01的,其他留空白
时间: 2024-03-10 20:45:35 浏览: 23
好的,你的问题是关于 ggcorrplot() 函数的参数,想要知道如何只显示 p 值小于 0.01 的相关系数,其他的则留空白,是吗?其实,ggcorrplot() 函数本身并没有直接提供这样的参数,不过我们可以通过在函数中使用一些额外的代码来实现这个功能。具体来说,我们可以先计算出每个相关系数的 p 值,然后通过修改 ggcorrplot() 的 ggplot2 组件,只对 p 值小于 0.01 的相关系数进行填充。下面是一段实现上述功能的代码,你可以参考一下:
```{r}
library(ggcorrplot)
library(Hmisc)
# 生成一组相关系数矩阵
set.seed(123)
data <- matrix(rnorm(100), ncol = 10)
colnames(data) <- paste0("Var", 1:10)
# 计算相关系数及其 p 值
cor_mat <- cor(data)
p_mat <- rcorr(as.matrix(data))$P
# 修改 ggplot2 组件
fill_colors <- ifelse(p_mat < 0.01, "#69b3a2", "white")
ggcorrplot(cor_mat, hc.order = TRUE, type = "lower", outline.color = "white",
colors = c("white", "#69b3a2", "#404080"), legend.title = "Correlation",
legend.label = c("0", "0.5", "1"), ggtheme = ggplot2::theme_gray(),
tile.col = fill_colors)
```
在上述代码中,我们首先使用 cor() 函数计算出数据的相关系数矩阵,然后使用 rcorr() 函数计算出每个相关系数的 p 值。接着,我们定义了一个 fill_colors 向量,其中 p 值小于 0.01 的相关系数对应的颜色为 "#69b3a2",其他相关系数对应的颜色为 "white"。最后,我们将 fill_colors 向量作为 tile.col 参数传递给 ggcorrplot() 函数,从而实现了只显示 p 值小于 0.01 的相关系数,其他留空白的效果。