if self.onehot_y: mask = mask if mask.ndim < 4 else mask.squeeze(axis=1) mask = F.one_hot(mask.astype("int64"), self.n_classes) mask = mask.transpose((0, 3, 1, 2))改为torch

时间: 2024-02-22 17:59:14 浏览: 129
如果您想将上述代码中的NumPy数组转换为PyTorch张量,可以按照以下方式进行修改: ``` if self.onehot_y: mask = mask if mask.ndim < 4 else mask.squeeze(dim=1) mask = F.one_hot(torch.from_numpy(mask.astype("int64")), self.n_classes) mask = mask.transpose(1, 3).transpose(2, 3) ``` 修改后的代码中,我们使用`torch.from_numpy()`函数将NumPy数组转换为PyTorch张量,并在转换过程中指定数据类型为`int64`。另外,由于PyTorch的one-hot编码函数`F.one_hot()`只支持对整型张量进行编码,所以我们需要先将输入的`mask`张量转换为整型张量,然后再进行one-hot编码。最后,我们使用`transpose()`函数将处理后的`mask`张量的维度按照指定的顺序重排,即将批次大小(如果有的话)移动到第0个维度的位置,将通道数移动到第1个维度的位置,将高度移动到第2个维度的位置,将宽度移动到第3个维度的位置。注意,由于PyTorch的`transpose()`函数和NumPy的`transpose()`函数的参数顺序不同,所以在PyTorch中需要使用两次`transpose()`函数将通道数和高度的位置交换。
相关问题

mask = mask if mask.ndim < 4 else mask.squeeze(axis=1) mask = F.one_hot(mask.long(), self.n_classes) mask = mask.transpose(0, 3, 1, 2)代码问题

这段代码的作用是将输入的`mask`张量进行处理,使其符合模型的输入要求。具体来说,代码的处理步骤如下: 1. 如果输入的`mask`张量的维度大于等于4(即包含批次大小的维度),则将维度为1的维度移除,即通过`squeeze()`函数将维度为1的维度压缩掉。 2. 将处理后的`mask`张量转换为one-hot编码形式,即将每个像素的类别标签转换为一个向量,向量的长度等于类别数`n_classes`,向量中只有对应类别的位置为1,其他位置为0。这个转换可以通过`F.one_hot()`函数实现。 3. 将处理后的`mask`张量的维度按照指定的顺序重排,即将批次大小(如果有的话)移动到第0个维度的位置,将通道数移动到第1个维度的位置,将高度移动到第2个维度的位置,将宽度移动到第3个维度的位置。这个重排可以通过`transpose()`函数实现。 总之,这段代码的作用是将输入的`mask`张量进行处理,使其符合模型的输入要求。如果输入的`mask`张量已经符合模型的输入要求,则这段代码可以直接跳过,不需要进行处理。例如,如果输入的`mask`张量的形状已经是`(batch_size, n_classes, height, width)`,则这段代码可以直接跳过,不需要进行处理。如果输入的`mask`张量的形状不符合模型的输入要求,则需要使用这段代码将其进行处理。

def loss(self, x, t): y = self.predict(x, train_flg=True) return self.last_layer.forward(y, t) def accuracy(self, x, t, batch_size=100): if t.ndim != 1 : t = np.argmax(t, axis=1) acc = 0.0 for i in range(int(x.shape[0] / batch_size)): tx = x[i*batch_size:(i+1)*batch_size] tt = t[i*batch_size:(i+1)*batch_size] y = self.predict(tx, train_flg=False) y = np.argmax(y, axis=1) acc += np.sum(y == tt) return acc / x.shape[0]

这段代码是神经网络中的损失函数和准确率计算函数。损失函数用于计算预测值与真实值之间的差异,常用的损失函数有交叉熵损失函数、均方误差损失函数等。该函数接受两个输入参数x和t,其中x表示输入数据,t表示对应的真实标签。函数首先调用predict函数计算出预测结果y,然后将预测结果y和真实标签t传入最后一层last_layer的forward方法中计算损失值,并返回结果。 准确率计算函数用于计算模型在给定数据集上的准确率。该函数接受三个输入参数x、t和batch_size,其中x和t分别表示输入数据和对应的真实标签,batch_size表示每次计算准确率时使用的数据批次大小。函数首先判断真实标签的维度是否为1,如果不是则将其转换为one-hot编码。然后遍历整个数据集,每次取出batch_size个数据进行预测,并将预测结果和真实标签进行比较,计算出正确预测的个数。最终将所有batch的正确预测个数相加并除以数据集总大小得到准确率。
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for (img1_file, img2_file) in tqdm(img_pairs): img1 = np.array(imread(img1_file)) img2 = np.array(imread(img2_file)) if args.arch == 'StrainNet_l' and img1.ndim == 3: img1 = img1[:,:,1] img2 = img2[:,:,1] img1 = img1/255 img2 = img2/255 if img1.ndim == 2: img1 = img1[np.newaxis, ...] img2 = img2[np.newaxis, ...] img1 = img1[np.newaxis, ...] img2 = img2[np.newaxis, ...] img1 = torch.from_numpy(img1).float() img2 = torch.from_numpy(img2).float() if args.arch == 'StrainNet_h' or args.arch == 'StrainNet_f': img1 = torch.cat([img1,img1,img1],1) img2 = torch.cat([img2,img2,img2],1) input_var = torch.cat([img1,img2],1) elif img1.ndim == 3: img1 = np.transpose(img1, (2, 0, 1)) img2 = np.transpose(img2, (2, 0, 1)) img1 = torch.from_numpy(img1).float() img2 = torch.from_numpy(img2).float() input_var = torch.cat([img1, img2]).unsqueeze(0) # compute output input_var = input_var.to(device) output = model(input_var) if args.arch == 'StrainNet_h' or args.arch == 'StrainNet_l': output = torch.nn.functional.interpolate(input=output, scale_factor=2, mode='bilinear') output_to_write = output.data.cpu() output_to_write = output_to_write.numpy() disp_x = output_to_write[0,0,:,:] disp_x = - disp_x * args.div_flow + 1 disp_y = output_to_write[0,1,:,:] disp_y = - disp_y * args.div_flow + 1 filenamex = save_path/'{}{}'.format(img1_file.stem[:-1], '_disp_x') filenamey = save_path/'{}{}'.format(img1_file.stem[:-1], '_disp_y') np.savetxt(filenamex + '.csv', disp_x,delimiter=',') np.savetxt(filenamey + '.csv', disp_y,delimiter=',')

--------------------------------------------------------------------------- ValueError Traceback (most recent call last) Input In [27], in <cell line: 11>() 9 model.add(LSTM(units=32, input_shape=(sequence_length, 4))) 10 model.add(Dropout(0.2)) ---> 11 model.add(LSTM(units=32)) 12 model.add(Dense(units=1, activation='sigmoid')) 14 # 编译模型 File ~/anaconda3/lib/python3.9/site-packages/tensorflow/python/trackable/base.py:204, in no_automatic_dependency_tracking.<locals>._method_wrapper(self, *args, **kwargs) 202 self._self_setattr_tracking = False # pylint: disable=protected-access 203 try: --> 204 result = method(self, *args, **kwargs) 205 finally: 206 self._self_setattr_tracking = previous_value # pylint: disable=protected-access File ~/anaconda3/lib/python3.9/site-packages/keras/src/utils/traceback_utils.py:70, in filter_traceback.<locals>.error_handler(*args, **kwargs) 67 filtered_tb = _process_traceback_frames(e.__traceback__) 68 # To get the full stack trace, call: 69 # tf.debugging.disable_traceback_filtering() ---> 70 raise e.with_traceback(filtered_tb) from None 71 finally: 72 del filtered_tb File ~/anaconda3/lib/python3.9/site-packages/keras/src/engine/input_spec.py:235, in assert_input_compatibility(input_spec, inputs, layer_name) 233 ndim = shape.rank 234 if ndim != spec.ndim: --> 235 raise ValueError( 236 f'Input {input_index} of layer "{layer_name}" ' 237 "is incompatible with the layer: " 238 f"expected ndim={spec.ndim}, found ndim={ndim}. " 239 f"Full shape received: {tuple(shape)}" 240 ) 241 if spec.max_ndim is not None: 242 ndim = x.shape.rank ValueError: Input 0 of layer "lstm_8" is incompatible with the layer: expected ndim=3, found ndim=2. Full shape received: (None, 32)

解释:def levenberg_marquardt(fun, grad, jacobian, x0, iterations, tol): """ Minimization of scalar function of one or more variables using the Levenberg-Marquardt algorithm. Parameters ---------- fun : function Objective function. grad : function Gradient function of objective function. jacobian :function function of objective function. x0 : numpy.array, size=9 Initial value of the parameters to be estimated. iterations : int Maximum iterations of optimization algorithms. tol : float Tolerance of optimization algorithms. Returns ------- xk : numpy.array, size=9 Parameters wstimated by optimization algorithms. fval : float Objective function value at xk. grad_val : float Gradient value of objective function at xk. grad_log : numpy.array The record of gradient of objective function of each iteration. """ fval = None # y的最小值 grad_val = None # 梯度的最后一次下降的值 x_log = [] # x的迭代值的数组,n*9,9个参数 y_log = [] # y的迭代值的数组,一维 grad_log = [] # 梯度下降的迭代值的数组 x0 = asarray(x0).flatten() if x0.ndim == 0: x0.shape = (1,) # iterations = len(x0) * 200 k = 1 xk = x0 updateJ = 1 lamda = 0.01 old_fval = fun(x0) gfk = grad(x0) gnorm = np.amax(np.abs(gfk)) J = [None] H = [None] while (gnorm > tol) and (k < iterations): if updateJ == 1: x_log = np.append(x_log, xk.T) yk = fun(xk) y_log = np.append(y_log, yk) J = jacobian(x0) H = np.dot(J.T, J) H_lm = H + (lamda * np.eye(9)) gfk = grad(xk) pk = - np.linalg.inv(H_lm).dot(gfk) pk = pk.A.reshape(1, -1)[0] # 二维变一维 xk1 = xk + pk fval = fun(xk1) if fval < old_fval: lamda = lamda / 10 xk = xk1 old_fval = fval updateJ = 1 else: updateJ = 0 lamda = lamda * 10 gnorm = np.amax(np.abs(gfk)) k = k + 1 grad_log = np.append(grad_log, np.linalg.norm(xk - x_log[-1:])) fval = old_fval grad_val = grad_log[-1] return xk, fval, grad_val, x_log, y_log, grad_log

ValueError Traceback (most recent call last) <ipython-input-54-536a68c200e5> in <module> 52 return model 53 # lstm network ---> 54 model = create_LSTM_model(X_train,n_steps,n_length, n_features) 55 # summary 56 print(model.summary()) <ipython-input-54-536a68c200e5> in create_LSTM_model(X_train, n_steps, n_length, n_features) 22 X_train = X_train.reshape((X_train.shape[0], n_steps, 1, n_length, n_features)) 23 ---> 24 model.add(ConvLSTM2D(filters=64, kernel_size=(1,3), activation='relu', 25 input_shape=(n_steps, 1, n_length, n_features))) 26 model.add(Flatten()) ~\anaconda3\lib\site-packages\tensorflow\python\trackable\base.py in _method_wrapper(self, *args, **kwargs) 203 self._self_setattr_tracking = False # pylint: disable=protected-access 204 try: --> 205 result = method(self, *args, **kwargs) 206 finally: 207 self._self_setattr_tracking = previous_value # pylint: disable=protected-access ~\anaconda3\lib\site-packages\keras\utils\traceback_utils.py in error_handler(*args, **kwargs) 68 # To get the full stack trace, call: 69 # tf.debugging.disable_traceback_filtering() ---> 70 raise e.with_traceback(filtered_tb) from None 71 finally: 72 del filtered_tb ~\anaconda3\lib\site-packages\keras\engine\input_spec.py in assert_input_compatibility(input_spec, inputs, layer_name) 233 ndim = shape.rank 234 if ndim != spec.ndim: --> 235 raise ValueError( 236 f'Input {input_index} of layer "{layer_name}" ' 237 "is incompatible with the layer: " ValueError: Input 0 of layer "conv_lstm2d_12" is incompatible with the layer: expected ndim=5, found ndim=3. Full shape received: (None, 10, 5)解决该错误

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