rdkit将smiles转化为原子坐标键数据

RDKit是一个广泛用于化学信息学的Python库，它提供了一系列强大的工具处理分子结构。当你有一个SMILES（Simplified Molecular Input Line Entry System）字符串，这是一种化学结构的文本表示形式，RDKIT可以将其转换成分子的结构模型，包括原子坐标和键信息。

具体来说，RDKit通过`Chem.MolFromSmiles()`函数将SMILES解析为一个`rdkit.Chem.Mol`对象，这个对象包含了分子中每个原子的位置（x、y、z坐标）以及它们之间的化学键连接。你可以进一步访问`GetConformer()`方法获取特定构象（conformation）下的原子坐标，并利用这些数据进行各种分子级别的分析和计算。

例如：

from rdkit import Chem

smiles = "CC(=O)OC1=CC=C(C=C1)F"
mol = Chem.MolFromSmiles(smiles)
coords = mol.GetConformer().GetPositions()

在这个例子中，`coords`就是键数据，包含了每个原子的三维坐标数组。