import networkx as nx import matplotlib.pyplot as plt # 创建图 G = nx.Graph()

时间: 2023-12-09 11:05:49 浏览: 125
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Python Matplotlib 基于networkx画关系网络图

# 添加节点 G.add_node(1) G.add_node(2) G.add_node(3) # 添加边 G.add_edge(1, 2) G.add_edge(2, 3) G.add_edge(3, 1) # 绘制图形 nx.draw(G, with_labels=True) plt.show()
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python复杂网络分析库NetworkX.docx

G = nx.Graph() # 创建一个空的无向图 G G.add_node(1) # 添加一个节点 1 G.add_edge(2, 3) # 添加一条边 2-3，同时隐含添加节点 2 和 3 G.add_edge(3, 2) # 对于无向图，边 3-2 与边 2-3 被认为是一样的 print(...

import networkx as nximport matplotlib.pyplot as plt# 读取人物关系数据with open('characters.txt', 'r') as f: data = f.readlines()# 创建空的Graph对象G = nx.Graph()# 添加节点和边for line in data: characters = line.strip().split(',') for i in range(len(characters)): if not G.has_node(characters[i]): G.add_node(characters[i]) for j in range(i+1, len(characters)): if not G.has_node(characters[j]): G.add_node(characters[j]) if not G.has_edge(characters[i], characters[j]): G.add_edge(characters[i], characters[j])# 绘制图形pos = nx.spring_layout(G)nx.draw(G, pos, with_labels=True, font_size=10, node_size=500, node_color='lightblue', edge_color='gray')plt.show()

这是Python中导入networkx和matplotlib.pyplot模块的语句。networkx是一个用于创建、操作和研究复杂网络的Python库，而matplotlib.pyplot是一个用于绘制图形的Python库。

import networkx as nx import matplotlib.pyplot as plt # create graph object G = nx.Graph() # add nodes G.add_node('A') G.add_node('B') G.add_node('C') G.add_node('D') # add edges with weights G.add_edge('A', 'B', weight=5) G.add_edge('A', 'C', weight=7) G.add_edge('B', 'D', weight=6) G.add_edge('C', 'D', weight=3) # define node positions (optional) pos = {'A': (0, 0), 'B': (1, 1), 'C': (-1, 1), 'D': (0, 2)} # draw nodes and edges with labels nx.draw_networkx_nodes(G, pos) nx.draw_networkx_edges(G, pos) nx.draw_networkx_labels(G, pos) edge_labels = nx.get_edge_attributes(G, 'weight') nx.draw_networkx_edge_labels(G, pos, edge_labels=edge_labels) plt.axis('off') plt.show()

import matplotlib.pyplot as plt # 创建一个带权图 G = nx.Graph() # 添加节点 G.add_node('A') G.add_node('B') G.add_node('C') G.add_node('D') # 添加带权边 G.add_edge('A', 'B', weight=5) G.add_edge('A'...

import pandas as pd import numpy as np import networkx as nx import matplotlib.pyplot as plt # 读取Excel文件中的邻接矩阵 adjacency_matrix = pd.read_excel('output.xlsx', index_col=0) # 将邻接矩阵转换为numpy数组 adjacency_matrix = adjacency_matrix.to_numpy() # 创建有向图对象 G = nx.DiGraph(adjacency_matrix) def preprocess(G): p = 0 directedGraph = nx.DiGraph() for u in G.nodes(): for v in G.neighbors(u): if (v != u): propProb = G.number_of_edges(u, v) / G.degree(v) directedGraph.add_edge(u, v, pp=propProb) return directedGraph def simulate(G, seedNode, propProbability): newActive = True currentActiveNodes = seedNode.copy() newActiveNodes = set() activatedNodes = seedNode.copy() influenceSpread = len(seedNode) while newActive: for node in currentActiveNodes: for neighbor in G.neighbors(node): if neighbor not in activatedNodes: if G[node][neighbor]['pp'] > propProbability: newActiveNodes.add(neighbor) activatedNodes.append(neighbor) influenceSpread += len(newActiveNodes) if newActiveNodes: currentActiveNodes = list(newActiveNodes) newActiveNodes = set() else: newActive = False return influenceSpread def flipCoin(probability): return np.random.random() < probability # 可视化传播过程 def visualizePropagation(G, seedNode, propProbability): pos = nx.spring_layout(G) # 选择布局算法 labels = {node: node for node in G.nodes()} # 节点标签为节点名 colors = ['r' if node in seedNode else 'b' for node in G.nodes()] # 种子节点为红色，其他节点为蓝色 plt.figure(figsize=(10,6)) nx.draw_networkx_nodes(G, pos, node_color=colors) nx.draw_networkx_edges(G, pos) nx.draw_networkx_labels(G, pos, labels) plt.title('Propagation Visualization') plt.show() # 示例用法 seedNode = [7,36,17] propProbability = 0.7 directedGraph = preprocess(G) influenceSpread = simulate(directedGraph, seedNode, propProbability) print("Influence Spread:", influenceSpread) visualizePropagation(directedGraph, seedNode, propProbability)修改这个代码使得输出图形节点之间间隔合理能够看清

nx.draw_networkx_nodes(G, pos, node_color=colors) nx.draw_networkx_edges(G, pos) nx.draw_networkx_labels(G, pos, labels) plt.title('Propagation Visualization') plt.show() # 示例用法 seedNode = ...

import matplotlib.pyplot as plt# 将图形绘制成一个圆形布局pos = nx.circular_layout(G)# 绘制图形的节点和边nx.draw_networkx_nodes(G, pos)nx.draw_networkx_edges(G, pos)# 添加节点标签node_labels = {node: str(node) for node in G.nodes()}nx.draw_networkx_labels(G, pos, node_labels)# 添加边权重标签edge_labels = {(u, v): str(d['weight']) for u, v, d in G.edges(data=True)}nx.draw_networkx_edge_labels(G, pos, edge_labels)# 显示图形plt.show() 修改代码，将图形绘制成一个矩形布局

import matplotlib.pyplot as plt import networkx as nx # 创建一个图形对象 G = nx.Graph() # 添加节点和边 G.add_edges_from([(1, 2), (1, 3), (2, 3), (2, 4), (3, 4), (4, 5), (5, 6)]) # 生成矩形布局 pos ...

修改代码，将图形绘制成一个矩形布局：import matplotlib.pyplot as plt# 将图形绘制成一个圆形布局pos = nx.circular_layout(G)# 绘制图形的节点和边nx.draw_networkx_nodes(G, pos)nx.draw_networkx_edges(G, pos)# 添加节点标签node_labels = {node: str(node) for node in G.nodes()}nx.draw_networkx_labels(G, pos, node_labels)# 添加边权重标签edge_labels = {(u, v): str(d['weight']) for u, v, d in G.edges(data=True)}nx.draw_networkx_edge_labels(G, pos, edge_labels)# 显示图形plt.show()

import matplotlib.pyplot as plt import networkx as nx # 创建一个图形对象 G = nx.Graph() # 添加节点和边 G.add_edges_from([(1, 2), (1, 3), (2, 3), (2, 4), (3, 4), (4, 5), (5, 6)]) # 生成矩形布局 pos ...

可以通过修改该小程序，最终实现利用shibor.csv数据中的shibor列中的2000个数据（比如20101130~20181130）作为研究对象，将shibor序列分为5个长度一段（共400段），利用可见图算法将生成每段的图，并统计400段中重复出现次数最多的一个图。 。 import networkx as nx import pandas as pd import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt series=[3,4,3.5,3.9,7.8] temp=pd.DataFrame([]) def vg(series): n=len(series)#返回数组中元素的总数 for i in range(2,n+1): temp.loc[i-1,0]=i-1 temp.loc[i-1,1]=i nnn1=n-1 for i in range(1,n-1): for j in range(i+2,n+1): poke=1 slope0=float((series[j-1]-series[i-1]))/(j-i) for k in range(i+1,j): if float((series[k-1]-series[i-1]))/(k-i)<slope0: poke=poke*1 else: poke=poke*0 if poke==1: nnn1=nnn1+1 temp.loc[nnn1,0]=i temp.loc[nnn1,1]=j return temp Re=vg(series) Re=np.array(Re) gg1=list(Re) G=nx.Graph(gg1) nx.draw_networkx(G,node_size = 400)

import matplotlib.pyplot as plt # 读取数据 data = pd.read_csv('shibor.csv') series = data['shibor'].values # 将shibor序列分为5个长度一段（共400段） n = len(series) m = 400 sub_len = int(np.ceil(n/m)...

import pandas as pd import networkx as nx import matplotlib # 读取Excel表格并转化为邻接矩阵 df = pd.read_excel('E:/Download/.Download/2023年杭州电子科技大学第十三届研究生数学建模竞赛题/HDUGMCM-2023-Problem-B：多无人车协同快递配送问题/附件/附件1.xlsx', header=None) adjacency_matrix = df.values[1:, 1:] # 创建无向图 G = nx.Graph() # 添加节点 for i in range(1, len(adjacency_matrix) + 1): G.add_node(i, pos=(df.values[i, 0], df.values[0, i])) # 添加边 for i in range(len(adjacency_matrix)): for j in range(i, len(adjacency_matrix)): if adjacency_matrix[i][j] > 0: G.add_edge(i+1, j+1, weight=adjacency_matrix[i][j]) # 绘制图形 pos = nx.get_node_attributes(G, 'pos') nx.draw(G, pos, with_labels=True, node_size=50) labels = nx.get_edge_attributes(G, 'weight') nx.draw_networkx_edge_labels(G, pos, edge_labels=labels) plt.show()代码改正

import matplotlib.pyplot as plt # 读取Excel表格并转化为邻接矩阵 df = pd.read_excel('E:/Download/.Download/2023年杭州电子科技大学第十三届研究生数学建模竞赛题/HDUGMCM-2023-Problem-B：多无人车协同快递...

import networkx as nx import numpy as np import pandas as pd import matplotlib.pyplot as plt import networkx as nx import random df=pd.read_csv("D:\级联失效\edges.csv") G=nx.from_pandas_edgelist(df,'from','to',create_using=nx.Graph()) nx.draw(G,node_size=300,with_labels=True) As=nx.adjacency_matrix(G) A=As.todense() def f(x): F=4*x*(1-x) return F n=len(A) r=2 ohxs=0.4 step=10 d=np.zeros([n,step]) for i in range(n): d[i,0]=np.sum(A[i]) x_intial=np.zeros([n,step]) for i in range(n): x_intial[i,0]=random.random() np.set_printoptions(precision=5) h_a=100 H=np.zeros([n,step]) D=np.zeros([n,step]) for i in range(n): Deg=0 for k in range(n): if k!=i: Deg=Deg+d[k,0] D[i,0]=Deg H[i,0]=d[i,0]/D[i,0]/h_a fail_scale=np.zeros(step) fail_scale[0]=1 node_rand_id=random.randint(0,n) r=2 x_intial[node_rand_id,0]=x_intial[node_rand_id,0]+r print(x_intial) fail_node=np.zeros(n) fail_node[node_rand_id]=1 print(fail_node) np.seterr(divide='ignore',invalid='ignore') for t in range(1,step): fail_node_id=[idx for (idx,val) in enumerate(fail_node) if val ==1] for i in range(n): sum=0 for j in range(n): sum = sum+A[i,j]*f(x_intial[j,t-1])/d[i] if i in fail_node_id: x_intial[i,t-1]=0 A[i,:]=0 A[:,i]=0 else: x_intial[i,t]=H[i,t-1]*abs((1-ohxs)*f(x_intial[i,t-1])+ohxs*sum) d[i,t]=np.sum(A[i]) Deg=0 for k in range(n): if k!=i: Deg=Deg+d[i,t] D[i,t]=Deg H[i,t]=d[i,t]/D[i,t]/h_a new_fail_id=[idx for (idx,val) in enumerate(x_intial[:,t]) if val>=1] fail_scale[t]=fail_scale[t-1]+len(new_fail_id) fail_node[new_fail_id]=1 x_intial[new_fail_id,t]=x_intial[new_fail_id,t]+r print(H[i,t]) print(fail_node) print(x_intial) plt.plot(fail_scale) plt.show()

这是一个使用 Python 编写的网络模型，使用了 networkx 库来构建网络。代码中从 csv 文件中读取了网络的边，然后使用 from_pandas_edgelist 方法将边转化为图。接着定义了一个 f(x) 函数，对应于网络中每个节点的...

import community G = nx.karate_club_graph() partition = community.best_partition(G) pos = nx.spring_layout(G) plt.figure(figsize=(12,12)) plt.axis('off') nx.draw_networkx_nodes(G, pos, node_size=200, cmap=plt.cm.RdYlBu, node_color=list(partition.values())) nx.draw_networkx_edges(G,pos, alpha=0.5)

import matplotlib.pyplot as plt 2. 创建Karate Club图。 G = nx.karate_club_graph() 3. 使用community.best_partition函数检测图中的社区，并将结果存储在字典partition中。 partition = ...

import networkx as nx import matplotlib.pyplot as plt # 输入数据 locations = [[125.330802,125.401931,125.326444,125.332284,125.322837,125.32563,125.334942,125.378548,125.386251,125.426883,125.42665,125.437111,125.453763,125.431396,125.430705,125.41968,125.437906,125.404171,125.385772,125.341942,125.341535,125.300812,125.307316,125.345642,125.331492,125.330322,125.284474,125.334851,125.30606,125.377211,125.381077,125.417041,125.41427,125.416371,125.432283,125.401676,125.403855,125.38582,125.426733,125.291], [43.917542,43.919075,43.905821,43.90266,43.900238,43.89703,43.888187,43.904508,43.892574,43.907904,43.896354,43.894605,43.889122,43.88774,43.882928,43.887149,43.8789,43.879647,43.883112,43.873763,43.861505,43.854652,43.876513,43.850479,43.833745,43.825044,43.812019,43.803154,43.793054,43.788869,43.824152,43.816805,43.801673,43.82893,43.83235,43.843713,43.854322,43.868372,43.871792,43.8306]] num_flights = 4 flight_capacity = [10, 10, 10, 10] # 将坐标转化为图 G = nx.Graph() for i in range(len(locations[0])): G.add_node(i+1, pos=(locations[0][i], locations[1][i])) for i in range(len(locations[0])): for j in range(i+1, len(locations[0])): dist = ((locations[0][i]-locations[0][j])**2 + (locations[1][i]-locations[1][j])**2)**0.5 G.add_edge(i+1, j+1, weight=dist) # 添加起点和终点 start_node = len(locations[0])+1 end_node = len(locations[0])+2 G.add_node(start_node, pos=(0, 0)) G.add_node(end_node, pos=(0, 0)) # 添加边和边权 for i in range(len(locations[0])): G.add_edge(start_node, i+1, weight=0) G.add_edge(i+1, end_node, weight=0) for f in range(num_flights): for i in range(len(locations[0])): G.add_edge(i+1, len(locations[0])+f*len(locations[0])+i+1, weight=0) G.add_edge(len(locations[0])+f*len(locations[0])+i+1, end_node, weight=0) # 添加航班容量的限制 for f in range(num_flights): for i in range(len(locations[0])): G.add_edge(len(locations[0])+f*len(locations[0])+i+1, len(locations[0])+f*len(locations[0])+len(locations[0])+1, weight=-flight_capacity[f]) #创造路径规划模型 path_model = nx.DiGraph() for i in range(len(locations[0])): for f in range(num_flights): for j in range(len(locations[0])): if i != j: path_model.add_edge(len(locations[0])+flen(locations[0])+i+1, len(locations[0])+flen(locations[0])+j+1, weight=G[i+1][j+1]['weight']G[len(locations[0])+flen(locations[0])+i+1][len(locations[0])+f*len(locations[0])+j+1]['weight'])找出错误

path_model.add_edge(len(locations[0])+f*len(locations[0])+i+1, len(locations[0])+f*len(locations[0])+len(locations[0])+j+1, weight=G[i+1][j+1]['weight']) 这样就能够运行正确了。

import networkx as nx import matplotlib.pyplot as plt # 输入数据 locations = [ [125.330802,125.401931,125.326444,125.332284,125.322837,125.32563,125.334942,125.378548,125.386251,125.426883,125.42665,125.437111,125.453763,125.431396,125.430705,125.41968,125.437906,125.404171,125.385772,125.341942,125.341535,125.300812,125.307316,125.345642,125.331492,125.330322,125.284474,125.334851,125.30606,125.377211,125.381077,125.417041,125.41427,125.416371,125.432283,125.401676,125.403855,125.38582,125.426733,125.291], [43.917542,43.919075,43.905821,43.90266,43.900238,43.89703,43.888187,43.904508,43.892574,43.907904,43.896354,43.894605,43.889122,43.88774,43.882928,43.887149,43.8789,43.879647,43.883112,43.873763,43.861505,43.854652,43.876513,43.850479,43.833745,43.825044,43.812019,43.803154,43.793054,43.788869,43.824152,43.816805,43.801673,43.82893,43.83235,43.843713,43.854322,43.868372,43.871792,43.8306] ] num_flights = 4 flight_capacity = [10, 10, 10, 10] # 将坐标转化为图 G = nx.Graph() for i in range(len(locations[0])): G.add_node(i+1, pos=(locations[0][i], locations[1][i])) for i in range(len(locations[0])): for j in range(i+1, len(locations[0])): dist = ((locations[0][i]-locations[0][j])**2 + (locations[1][i]-locations[1][j])**2)**0.5 G.add_edge(i+1, j+1, weight=dist) # 添加起点和终点 start_node = len(locations[0])+1 end_node = len(locations[0])+2 G.add_node(start_node, pos=(0, 0)) G.add_node(end_node, pos=(0, 0)) # 添加边和边权 for i in range(len(locations[0])): G.add_edge(start_node, i+1, weight=0) G.add_edge(i+1, end_node, weight=0) for f in range(num_flights): for i in range(len(locations[0])): G.add_edge(i+1, len(locations[0])+flen(locations[0])+i+1, weight=0) G.add_edge(len(locations[0])+flen(locations[0])+i+1, end_node, weight=0) # 添加航班容量的限制 for f in range(num_flights): for i in range(len(locations[0])): G.add_edge(len(locations[0])+flen(locations[0])+i+1, len(locations[0])+flen(locations[0])+len(locations[0])+1, weight=-flight_capacity[f]) # 创造路径规划模型 path_model = nx.DiGraph() for i in range(len(locations[0])): for f in range(num_flights): for j in range(len(locations[0])): if i != j: path_model.add_edge(len(locations[0])+flen(locations[0])+i+1, len(locations[0])+flen(locations[0])+j+1, weight=G[i+1][j+1]['weight']+G[len(locations[0])+flen(locations[0])+i+1][len(locations[0])+flen(locations[0])+j+1]['weight']) # 添加航班时间的限制 for f in range(num_flights): for i in range(len(locations[0])): for j in range(len(locations[0])): if i != j: path_model.add_edge(len(locations[0])+f*len(locations[0])+i+1, len(locations[0])+((f+1)%num_flights)len(locations[0])+j+1, weight=G[i+1][j+1]['weight']) # 求解最短路径 path = nx.bellman_ford_path(path_model, source=start_node, target=end_node, weight='weight') # 绘制路径图 pos = nx.get_node_attributes(G, 'pos') nx.draw_networkx_nodes(G, pos, node_size=50, node_color='w') nx.draw_networkx_labels(G, pos) nx.draw_networkx_edges(G, pos, edgelist=G.edges(), width=0.5) for f in range(num_flights): start = len(locations[0])+flen(locations[0])+1 end = len(locations[0])+(f+1)*len(locations[0])+1 nx.draw_networkx_edges(G, pos, edgelist=path[start:end], edge_color='r', width=2.0, alpha=0.7) plt.axis('off') plt.show()找出错误并改正

import matplotlib.pyplot as plt # 输入数据 locations = [ [125.330802,125.401931,125.326444,125.332284,125.322837,125.32563,125.334942,125.378548,125.386251,125.426883,125.42665,125.437111,125....

import networkx as nx import random # 读入edge文件，构建图结构 graph = {} with open("./edge/football.edge", "r") as f: for line in f: u, v = line.strip().split() if u not in graph: graph[u] = [] if v not in graph: graph[v] = [] graph[u].append(v) graph[v].append(u) # 随机选择一个节点作为感染源 infected = random.choice(list(graph.keys())) print("Infected node:", infected) # 初始化每个节点的感染状态 status = {} for node in graph: status[node] = "S" status[infected] = "I" # SI模型参数 p = 0.5 # 感染过程 while True: changed = False for node in graph: if status[node] == "I": for neighbor in graph[node]: if status[neighbor] == "S" and random.random() < p: status[neighbor] = "I" changed = True if not changed: break # 输出每个节点的感染状态和邻居 for node in graph: print(node, status[node], graph[node])续写一个加入观测节点的溯源代码并可视化

import matplotlib.pyplot as plt # 读入edge文件，构建图结构 graph = {} with open("./edge/football.edge", "r") as f: for line in f: u, v = line.strip().split() if u not in graph: graph[u] = [] if ...

请用python实现二分图的最大匹配算法。还需要用matplotlib.pyplot来实现可视化

import matplotlib.pyplot as plt # 创建二分图 def create_bipartite_graph(): G = nx.Graph() # 添加源节点和目标节点，例如源节点为A-Z，目标节点为1-26 for letter in 'ABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZ': G.add...

graph = nx.DiGraph() graph.add_nodes_from(example.dominoModules[i].nodes()) graph.add_edges_from(example.dominoModules[i].edges()) pos = nx.spring_layout(graph) plt.title(f'Bayesian Network Based On {example.dominoModules[i].get_roots()[0]}') nx.draw(graph, pos, with_labels=True, node_color='lightblue', node_size=2000, edge_color='gray', arrows=True) plt.show()改成使用multipartite_layout绘制

import matplotlib.pyplot as plt import networkx as nx from pgmpy.readwrite import XMLBIFReader # 从XML文件中读取贝叶斯网络 reader = XMLBIFReader("network.xml") model = reader.get_model() # 创建一个...

node_labels = {node: node for node in nd_nodes} nx.draw_networkx_labels(self.aoi.graph, pos=pos, labels=node_labels, font_size=10)，标记的位置和点重合了怎么办，如何能使得标志改变位置，如何能使得标记的序号出现在字母C的下角标处，并且C和序号同时斜体

import matplotlib.pyplot as plt import networkx as nx # 设置字体为斜体 plt.rcParams['mathtext.fontset'] = 'stix' plt.rcParams['font.family'] = 'STIXGeneral' # 生成图形并布局 G = nx.Graph() G.add_...

node_labels = {node: r"$\mathit{C}_{" + str(node + 1) + "}$" for node in nd_nodes} nx.draw_networkx_labels(self.aoi.graph, pos=pos, labels=node_labels, font_size=15)，现在标记的位置和点重合了，如何修改程序使得标记改变位置，不再遮挡点的位置

import matplotlib.pyplot as plt import networkx as nx # 设置字体为斜体 plt.rcParams['mathtext.fontset'] = 'stix' plt.rcParams['font.family'] = 'STIXGeneral' # 生成图形并布局 G = nx.Graph() G.add_...

# 将实体转换为图形结构 G = nx.Graph() for record in result: node_id = str(uuid.uuid4()) # 生成 UUID G.add_node(node_id, name=record["name"], time_reference=record["time_reference"], address=record["address"],open_time=record["open_time"],ticket=record["ticket"],region=record["region"],lon=record["lon"],lat=record["lat"])后输出图形代码

import matplotlib.pyplot as plt # 创建图形结构 G = nx.Graph() for record in result: node_id = str(uuid.uuid4()) G.add_node(node_id, name=record["name"], time_reference=record["time_reference"], ...
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